蛋白质乙酰化修饰组学:乙酰化修饰是指在酶或非酶作用下,将乙酰CoA的乙酰基基团转移至蛋白质氨基酸的残基上。蛋白质乙酰化也是一种可逆的酶促反应过程。乙酰基转移酶可以将乙酰基团(CH3C=O)从乙酰辅酶A转移至蛋白质。同理,去乙酰化酶则可以逆转这种反应。蛋白质上的...
泛素化修饰蛋白组学研究分析样品要求:1. 如果您提供的是组织样品,请您干冰将组织样品寄给我们;植物组织样本大于400mg,血液样品至少2ml(血浆注意用EDTA防凝),血清2ml,尿液10ml,动物组织样品至少2g,细胞样品为1X10^8个细胞,酵母、微生物等...
常用的定量蛋白质组学技术方法有以下几类:非标记(labelfree)的定量蛋白组学技术:Label free定量蛋白组学技术是通过液质联用技术对蛋白质酶解肽段进行质谱分析,无需使用昂贵的稳定同位素标签做内部标准,只需分析大规模鉴定蛋白质时所产生的质谱数据,比较...
转录组学的概念:转录组是指特定组织或细胞在某一发育阶段或功能状态下转录出来的所有RNA的汇合,包括蛋白质编码的信使RNA和非编码RNA(rRNA、tRNA和其他ncRNAs),高通量测序技术也被称为下一代测序(NGS)技术,推进了基因组学的研究进展。该项新技术...
代谢组学的研究对象与层次有哪些?一般来说,代谢组学关注的对象是分子量在1000以下的小分子化合物。根据研究的对象和目的不同,科学家将生物体系的代谢产物分析分为4个层次:代谢物靶标分析:某一个或几个特定组分的定性和定量分析,如某一类结构、性质相关的化合物(氨基酸...
单细胞转录组学技术:Anydeplete技术首先通过随机引物进行一链合成,一链合成引入核苷酸类似物,用于酶切打断,二链合成同样引入核苷酸类似物用于保证链特异性。然后两端加上接头,接头一条链也带有核苷酸类似物,用于酶切降解。当形成单链文库后,设计特异性引物与rR...
代谢组学究竟是一门什么样的研究方向?首先定义什么是代谢组学。简单的说就是研究生物体对内外刺激的整体代谢应答规律。那么为什么代谢组学是基因组,转录组,蛋白质组的下游。我们研究它到底有什么意义。中心法则告诉我们了遗传信息的流向,的执行者蛋白质中很多酶参与了体内的代...
常用的定量蛋白质组学技术方法有以下几类:非标记(labelfree)的定量蛋白组学技术:Label free定量蛋白组学技术是通过液质联用技术对蛋白质酶解肽段进行质谱分析,无需使用昂贵的稳定同位素标签做内部标准,只需分析大规模鉴定蛋白质时所产生的质谱数据,比较...
什么叫转录组学?广义转录组是指生命单元(通常是一种细胞)中所有按基因信息单元转录和加工的RNA分子(包括编码和非编码RNA功能单元),或者是一个特定细胞所有转录本的总和.它的研究对象就是这些RNA与蛋白质分子和它们所组成的基因功能网络以及它们与细胞功能的关系....
乙酰化修饰蛋白组学实验流程:1)组织/细胞破碎,提取蛋白质;2)蛋白酶解成多肽片段;3)对多肽片段进行 iTRAQ 标记;4)高效特异性乙酰化抗体富集乙酰化修饰肽段;5)使用 LC-MS/MS 对富集的乙酰化肽段进行序列分析;5)数据分析,比对不同样本中蛋白乙...
蛋白质翻译后修饰的重要性:翻译后修饰可以发生在蛋白质生命周期的任何阶段。例如,许多蛋白质在翻译完成后不久就被修饰,以介导适当的蛋白质折叠或稳定,或将新生蛋白质引导到不同的细胞区室(例如,细胞核、膜)。折叠和定位完成后发生其他修饰,以刺激或灭活催化活性或以其他方...
蛋白质翻译后修饰组学是什么?蛋白质翻译后修饰是指蛋白质在翻译中或翻译后经历的一个共价加工过程,即通过1个或几个氨基酸残基加上修饰基团或通过蛋白质水解剪去基团而改变蛋白质的性质。蛋白质氨基酸序列的特定位置可以与化学基团或者小分子量的蛋白共价结合从而发生蛋白质翻译...
代谢组学疾病诊断应用:与基因组学和蛋白质组学相比,代谢组学的研究侧重于相关特定组分的共性,是要涉及研究每一个代谢组分的共性、特性和规律,目前据此目标相距甚远。尽管充满了挑战,研究人员仍然坚信,与基因组学和蛋白质组学相比,代谢组学与生理学的联系更加紧密。疾病导致...
普通转录组学测序适用于哪些情况?普通转录组测序主要适用于两大类:一是不同的生长阶段或者发育过程;二是不同的环境、药物、病原菌等逆境胁迫处理。转录组学测序必须做生物学重复么?需要几个重复?生物学重复是生物实验所必须的,转录组测序也不例外,至少3次生物学重复。准备...
泛素化修饰PRM定量验证:原理: 泛素化修饰是一种重要的翻译后修饰。泛素-蛋白酶体系统介导了真核生物体内80%~85%的蛋白质降解。此外,泛素化修饰还可以直接影响蛋白质的活性和定位,调控包括细胞周期、细胞凋亡、转录调控、DNA 损伤修复以及免疫应答等在内的多种...
LC-MS非靶向代谢组学:LC-MS非靶向代谢组学通过液质联用(LC-MS)方法检测生物体受外界刺激前后体内大多数小分子代谢物的动态变化,重点寻找在实验组和对照组中有明显变化的代谢物,进而研究这些代谢物与生理病理变化的相关关系,其研究对象大都是分子量1500D...
常用的定量蛋白质组学技术方法有以下几类:非标记(labelfree)的定量蛋白组学技术:Label free定量蛋白组学技术是通过液质联用技术对蛋白质酶解肽段进行质谱分析,无需使用昂贵的稳定同位素标签做内部标准,只需分析大规模鉴定蛋白质时所产生的质谱数据,比较...
泛素化修饰蛋白质组产品介绍:泛素化修饰(Ubiquitylation)是一种常见的蛋白质翻译后修饰,是指一个或多个泛素分子(Ubiquitin,由76个氨基酸组成的多肽)在一系列特殊的酶作用下,将细胞内的蛋白质分类,从中选出靶蛋白分子,并对靶蛋白进行特异性修饰...
GC-MS非靶向代谢组学能检测到哪些类别的代谢物?衍生化极大地拓展了GC/MS的检测分析范围。GC/MS能检测到有机酸、氨基酸、单糖、糖醇、胺类、脂肪酸、吲哚、单甘油酯、核苷、二糖、生育酚、甾醇和胆汁酸等代谢物。如何提高定性准确度?GC/MS的定性有双重标准,...
单细胞转录组学技术:10×genomics技术:首先在凝胶微珠上种上特定的DNA的片段,DNA的片段由三部分组成:Barcode、UMI、PolyT组成。Barcode是16个碱基的长度。一共有400万种Barcode,一个微珠是对应于一种Barcode,通过...
蛋白质翻译后修饰组学产品:常规的蛋白质组学研究往往只关注不同生理、病理条件下蛋白质表达水平的变化。然而,越来越多的研究发现,许多重要的生命活动、疾病发生不仅与蛋白质的丰度相关,更重要的是被各类蛋白质翻译后修饰所调控。因此深入研究蛋白质翻译后修饰对揭示生命活动的...
蛋白组学常见研究模式主要有两种:1.通过蛋白质组学寻找疾病发生的发展的新型标志物;2.结合其它组学建立疾病或者研究主题的表达谱和分子机制。蛋白质组学( proteomics) 是指系统研究某一基因组所表达的所有蛋白质,包括组成蛋白质一级结构的氨基酸序列,蛋白质...
乙酰化修饰蛋白组学简介:乙酰化是把一种乙酰官能基团添加到另一种有机化合物上,并进行结合的过程。乙酰化也是细胞内蛋白质翻译后修饰的一种重要形式,其主要发生在组蛋白赖氨酸上,是由组蛋白乙酰转移酶 (HATs) 催化的,其反过程去乙酰化由组蛋白去乙酰酶 (Histo...
泛素化修饰蛋白质组学有些什么?泛素化可以生产出单泛素化或多泛素化蛋白质。后者在当7个赖氨酸残基的泛素与另一个泛素的甘氨酸C端连接形成。这种泛素分子链接在生物过程中起到重要的作用。共价结合泛素的蛋白质能被蛋白酶识别并降解,这是细胞内短寿命蛋白质和一些异常蛋白降解...
单细胞RNA-seq转录组学工作流程:单细胞RNA测序等高通量单细胞转录组学技术通常从针对不同瘤和组织类型(解离、分选和分离细胞等)量身定制的实验工作流程开始,然后产生可以比对的序列,量化、质量控制(QC)过滤和以不同方式标准化,以实现许多下游计算分析,例如聚...
转录组学含义:转录组学是指一门在整体水平上研究细胞中基因转录的情况及转录调控规律的学科。转录组学是从RNA水平研究基因表达的情况。转录组即一个活细胞所能转录出来的所有RNA的总和,是研究细胞表型和功能的一个重要手段。以DNA为模板合成RNA的转录过程是基因表达...
蛋白质翻译后修饰的重要性:翻译后修饰可以发生在蛋白质生命周期的任何阶段。例如,许多蛋白质在翻译完成后不久就被修饰,以介导适当的蛋白质折叠或稳定,或将新生蛋白质引导到不同的细胞区室(例如,细胞核、膜)。折叠和定位完成后发生其他修饰,以刺激或灭活催化活性或以其他方...
甲基化修饰蛋白质组学技术原理:目前用于甲基化蛋白质组分析的甲基化肽段富集抗体分为精氨酸甲基化(Me-R)抗体和赖氨酸甲基化(Me-K)抗体两大类。根据氨基酸残基上所含甲基化修饰基团数量的不同,精氨酸甲基化(Me-R)抗体又包括:单甲基化精氨酸(MMA)抗体、非...
转录组及转录组测序(RNA-seq):转录组即特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和,包括mRNA和非编码RNA。转录组测序(RNA-seq)主要通过高通量测序研究特定组织或细胞在某个时期转录出来的mRNA的表达量,进而对相关基因和表型的关系进...
代谢组学的功能:代谢组学的功能,就有点类似GPS。代谢组学不做任何假设,针对样本和参照物分别进行代谢物全谱检测,帮你寻找出与差异代谢物,可能会有好几十个甚至更多,从它们所在的被上调或下调的代谢通路上去找到关键的代谢酶,再找到它们上游的调控基因,再进行后续的深入...