蛋白质翻译后修饰组学是什么?蛋白质翻译后修饰是指蛋白质在翻译中或翻译后经历的一个共价加工过程,即通过1个或几个氨基酸残基加上修饰基团或通过蛋白质水解剪去基团而改变蛋白质的性质。蛋白质氨基酸序列的特定位置可以与化学基团或者小分子量的蛋白共价结合从而发生蛋白质翻译后修饰(post-translational modifications,PTMs),相较于没有发生修饰的蛋白,PTMs会导致特定序列分子量的增加。在蛋白翻译后修饰方式的鉴定过程中,蛋白会首先被酶切成肽段,然后进入质谱进行分析;通过质谱分析,得到的是一系列肽段的分子质量信息。对于某一个特定肽段而言,在没有发生任何翻译后修饰的情况下,其序列信息和分子量是确定的。蛋白质磷酸化对于许多生物现象的引发是很必要的。北京丙二酰化修饰蛋白质组学服务
乙酰化修饰蛋白组学介绍:蛋白质乙酰化(Acetylation)是蛋白在乙酰基转移酶(或非酶)的催化下,将乙酰基团转移并添加在蛋白赖氨酸残基或蛋白N端上的过程,在调控蛋白质功能、染色质结构和基因表达中起重要作用。乙酰化修饰主要分为两类:蛋白N端的乙酰化修饰和蛋白赖氨酸上的乙酰化修饰。N端乙酰化修饰大部分发生在真核生物的蛋白上,由N乙酰转移酶(NATs)催化;赖氨酸上的乙酰化修饰是一个可逆的过程,主要由赖氨酸乙酰化酶(KATs)和赖氨酸去乙酰化酶(KDACs)催化。济南蛋白质甲基化修饰组学价钱蛋白质翻译后修饰 (PTMs) 进一步促进了从基因组水平到蛋白质组复杂性的增加。
磷酸化修饰蛋白组学应用:蛋白质组(Proteome)泛指一个生命体内所有蛋白质,蛋白质组学(Proteomics)是以蛋白质组为研究对象,研究细胞、组织或生物体蛋白质组成及其变化规律的科学,是对蛋白质进行定性、定量及功能的分析。定性分析包括鉴定蛋白质的序列、PTM及蛋白之间的相互作用,对比来看,磷酸化蛋白质组(Phosphoproteome)就是蛋白质组中全部的磷酸化蛋白质,而磷酸化蛋白质组学(Phosphoproteomics,下文简称PP)就是针对磷酸化蛋白质的全方面的分析,包括对磷酸化的鉴定、定位和定量。本来属于蛋白质组学的一个分支,但随着研究的深入,人们在各个领域关于PP都有重大发现,基于PP的研究也越来越多。
泛素化修饰蛋白质组学技术原理:尽管质谱仪器的分析能力近年来有了长足的发展,但是由于蛋白翻译后修饰化学计量值低、复杂性大,直接将蛋白组(如全细胞裂解产物,组织匀浆产物或全血清蛋白)的酶解肽段送入质谱鉴定和定量PTM是非常困难的。因此,很多翻译后修饰的富集方法会被采用,来提高样品中PTM肽段的丰度和相对比例,从而提高了质谱对翻译后修饰位点的鉴定效率。研究发现在泛素化修饰的蛋白在tyrpsin的作用下都会产生diGly位点。基于这一特异性,利用针对蛋白质翻译后修饰(PTM)基序(motif)抗体,在肽段水平上免疫亲和富集带有泛素化修饰的肽段,利用液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)进行定量分析,能够快速、准确、高通量地分析多种疾病相关信号通路关键节点蛋白修饰的变化,满足创新性研究、生物标志物鉴定、药物靶点筛选和评价的需求。目前,发现的比较常见的修饰类型是糖基化、泛素化和磷酸化。
泛素化修饰蛋白质组学的作用:泛素化、心血管等疾病的发病密切相关。因此,作为近年来生物化学研究的一个重大成果,它已然成为研究、开发新药物的新靶点。技术原理是首先将蛋白样本酶解成肽段混合物,然后使用液相色谱对酶解后的肽段混合物进行组分分离以降低样本复杂程度,然后通过高质量的泛素化修饰抗体和生物材料对修饰肽段进行富集,之后上样至液相色谱-串联质谱中进行分析定量。技术优势:高特异性的修饰抗体;高分辨率、高灵敏度质谱仪;鉴定通量高;可与代谢组学等进行多组学联合分析。蛋白质翻译后修饰组学泛素化修饰是一种重要的翻译后修饰。江苏蛋白质翻译后修饰组学质谱鉴定
蛋白质翻译后修饰组学自中而下的蛋白质组学技术可用于组蛋白修饰的分析。北京丙二酰化修饰蛋白质组学服务
琥珀酰化修饰蛋白质组技术特点:采用主流抗体亲和富集方法,特异性高,富集效率好;通过高分辨率、高扫描速度的质谱,对富集的琥珀酰化肽段进行大规模鉴定;结合常用的定量技术可对不同样品间的琥珀酰化水平差异进行定量比较。适用范围:药物作用靶点研究;疾病标志物筛选;植物胁迫/抗逆研究;作用机制研究;要求物种具有蛋白质参考数据库、EST序列(转录组)或基因组注释信息。应用方向:线粒体代谢、生物合成与代谢、中心代谢途径、炎症与疾病。北京丙二酰化修饰蛋白质组学服务