代谢组学疾病诊断应用:与基因组学和蛋白质组学相比,代谢组学的研究侧重于相关特定组分的共性,是要涉及研究每一个代谢组分的共性、特性和规律,目前据此目标相距甚远。尽管充满了挑战,研究人员仍然坚信,与基因组学和蛋白质组学相比,代谢组学与生理学的联系更加紧密。疾病导致机体病理生理过程变化,引起代谢产物发生相应的改变,通过对某些代谢产物进行分析,并与正常人的代谢产物比较,寻找疾病的生物标记物,将提供一种较好的疾病诊断方法。代谢组学与临床化学较为相似。武汉LC-MS/MS非靶向代谢组学费用代谢组学细胞样本收集:悬浮细胞:1)连同培养基转移到1.5 mL的进口离心管中。2)低速离心5 min(低于3000 ...
代谢组学介绍:通过液质联用(LC-MS)方法检测生物体受外界刺激前后体内大多数小分子代谢物的动态变化,重点寻找在实验组和对照组中有明显变化的代谢物,进而研究这些代谢物与生理病理变化的相关关系,其研究对象大多是分子量1500Da以内的小分子物质。技术优势:较高的灵敏度、分辨率;较宽的动态范围;适合对标本中未知代谢物的探索研究;适合于生物样本中复杂代谢产物的检测和潜在标志物的鉴定。代谢组学应用方向: 土壤代谢组学。研究土壤中有机质及土壤微生物代谢含量变化及相互作用,了解土壤微生物多样性及其碳代谢能力,为探索调节、控制和改善土壤环境质量提供重要的参考。代谢组学技术可应用于病因病机研究。山东脂质代谢组...
代谢组学的概念:代谢组学的概念来源于代谢组,代谢组是指某一生物或细胞在一特定生理时期内所有的低分子量代谢产物,代谢组学则是对某一生物或细胞在一特定生理时期内所有低分子量代谢产物同时进行定性和定量分析的一门新学科。它是以组群指标分析为基础,以高通量检测和数据处理为手段,以信息建模与系统整合为目标的系统生物学的一个分支。 代谢组学主要研究的是作为各种代谢路径的底物和产物的小分子代谢物(MW
代谢组学的研究对象与层次有哪些?一般来说,代谢组学关注的对象是分子量在1000以下的小分子化合物。根据研究的对象和目的不同,科学家将生物体系的代谢产物分析分为4个层次:代谢物靶标分析:某一个或几个特定组分的定性和定量分析,如某一类结构、性质相关的化合物(氨基酸、有机酸、顺二醇类)或者某一代谢途径的所有中间产物或多条代谢途径的标志性组分。代谢物指纹分析:同时对多个代谢物进行分析,不分离鉴定具体单一组分。代谢轮廓分析:限定条件下对生物体内特定组织内的代谢产物的快速定性和半定量分析。代谢组分析:对生物体或体内某一特定组织所包含的所有代谢物的定量分析,并研究该代谢物组在外界干预或病理生理条件下的动态变...
代谢组学样本收集指南:1.血浆样本收集:(1)从合适的静脉采集血液(典型10mL)到标记的肝素锂血浆收集管中(肝素锂用作抗凝剂)。(2)立即于4 °C离心(3000g)20min,上清液即为血浆。(3)离心完毕,取出血浆收集管,取上清液(血浆),分等份(0.5mL或0.1mL),转移到冻存管中(冰上),旋盖。(4)保存于-80℃冰箱。寄样需足量干冰。2.血清样本收集:(1)从合适的静脉采集血液(典型10mL)到血清收集管中。(2)将血清收集管冰水浴(4℃)凝集至少1h(2h以内),记录凝集时间。(3)将血清收集管放到冷冻离心机中低温(4℃)离心15min(2500 g)。(4)离心完毕,取出血...
代谢组学究竟是一门什么样的研究方向?首先定义什么是代谢组学。简单的说就是研究生物体对内外刺激的整体代谢应答规律。那么为什么代谢组学是基因组,转录组,蛋白质组的下游。我们研究它到底有什么意义。中心法则告诉我们了遗传信息的流向,的执行者蛋白质中很多酶参与了体内的代谢过程。基因测序数量太大,而且基因水平解释问题往往很吃力。因为基因的调控和生物学事件之间隔了一个很漫长的信号转导过程。蛋白同理,一是蛋白种类巨大,二是蛋白组学发展进入瓶颈;发展代谢组是因为代谢物种类只有不到1w种,建立它的差异分析更加简单,同时在价格等方面更有推广的意义。代谢组学技术可应用于疾病早期诊断。湖北动物靶向代谢组学领域选择代谢组...
代谢组学研究方法: 对于代谢产物来说,不只只有质谱峰这个特征。更进一步说,质谱(MS)并不能检测出所有的代谢产物,并不是因为质谱的灵敏度不够,而是由于质谱只能检测离子化的物质,但有些代谢产物在质谱仪中不能被离子化。采用核磁共振(NMR)的方法,可以弥补色谱的不足。过去,只有毒理学方面的研究使用核磁共振,而质谱只在植物代谢研究中采用。如今,这两种方法在代谢组学研究中已经普遍使用。为在不同样品间进行有意义的比较,研究人员必须结合使用这两种方法获得的大量数据进行分析。此外,还需要结合基因组学研究获得的数据。代谢产物是基因表达的产物,在代谢酶的作用下生成。山东LC-MS/MS非靶向代谢组学技术服务代谢...
LC-MS非靶向代谢组学:LC-MS非靶向代谢组学通过液质联用(LC-MS)方法检测生物体受外界刺激前后体内大多数小分子代谢物的动态变化,重点寻找在实验组和对照组中有明显变化的代谢物,进而研究这些代谢物与生理病理变化的相关关系,其研究对象大都是分子量1500Da以内的小分子物质。LC-MS非靶向代谢组学技术优势:1、较高的灵敏度、分辨率;2、较宽的动态范围;3、适合于生物样本中复杂代谢产物的检测和潜在标志物的鉴定;4、适合对标本中未知代谢物的探索研究。代谢组学技术得到了迅速发展。武汉个性化定制靶向代谢组学鉴定代谢组学有哪些特点?(1) 代谢处于系统生物学的末端,更能反映基因与外部环境互作的真实...
代谢组学疾病诊断应用:与基因组学和蛋白质组学相比,代谢组学的研究侧重于相关特定组分的共性,是要涉及研究每一个代谢组分的共性、特性和规律,目前据此目标相距甚远。尽管充满了挑战,研究人员仍然坚信,与基因组学和蛋白质组学相比,代谢组学与生理学的联系更加紧密。疾病导致机体病理生理过程变化,引起代谢产物发生相应的改变,通过对某些代谢产物进行分析,并与正常人的代谢产物比较,寻找疾病的生物标记物,将提供一种较好的疾病诊断方法。代谢组学作为系统生物学的重要组成部分,在临床医学领域具有普遍的应用前景。广州LC-MS/MS非靶向代谢组学鉴定非靶向代谢组学:非靶向代谢组学可用于检测生物体内大多数小分子代谢物的动态变...
GC-MS非靶向代谢组学能检测到哪些类别的代谢物?衍生化极大地拓展了GC/MS的检测分析范围。GC/MS能检测到有机酸、氨基酸、单糖、糖醇、胺类、脂肪酸、吲哚、单甘油酯、核苷、二糖、生育酚、甾醇和胆汁酸等代谢物。如何提高定性准确度?GC/MS的定性有双重标准,一是保留指数,二是质谱信息的相似度(similarity)。不同于LC/MS的软电离源,GC/MS使用的EI源属于硬电离,能量较强且稳定,在将代谢物分子电离后,分子离子峰进一步碎裂产生丰富的碎片离子。因此,我们很难在GC/MS上看到分子离子峰。GC/MS提供的是代谢物的“指纹图谱”,将仪器得到的实际指纹图谱和质谱库(如NIST库)进行比对...
代谢组学的功能:代谢组学的功能,就有点类似GPS。代谢组学不做任何假设,针对样本和参照物分别进行代谢物全谱检测,帮你寻找出与差异代谢物,可能会有好几十个甚至更多,从它们所在的被上调或下调的代谢通路上去找到关键的代谢酶,再找到它们上游的调控基因,再进行后续的深入研究,是不是可以避免走一些弯路?可以说代谢组学是一个相当有效率的研究工具。代谢组学在生物标志物的发现,疾病早期诊断和预测,药物或营养干预的评价,药物毒性评价,代谢工程研究中均有应用,但代谢组学只是一个“检测平台”,它无法单独开展机制性研究,但是如果合理的将代谢组学与分子生物学等学科协同使用,就可以起到事半功倍的作用。代谢组学是对某一生物或...
非靶向代谢组学分析流程:1、代谢谱分析(也称为差异表达分析):在一组实验和对照样品中,寻找丰度改变有统计学意义的感兴趣代谢物;2、鉴定:进行代谢谱分析后,测定这些代谢物的化学结构;3、解释:研究流程的结尾的一步,解释所发现的代谢物与生物过程或生物状态之间的关联。代谢组学主要是对生物体受到内部(基因)或外部(饮食、环境等)刺激后所发生生物响应进行综合分析的研究工具,代谢组学的研究按照研究目的的不同可分为靶向代谢组学和非靶向代谢组学。代谢组学着重研究的是生物整体或组织的内源性代谢物质的代谢途径。江苏LC-MS/MS非靶向脂质组学质谱鉴定代谢组学的特点:1.相对于其他组学研究,检测技术相对简单(液-...
靶向代谢组学:靶向代谢组学分析主要是以标准品为参照,对特定的代谢物群进行有针对性地、特异性地检测与分析。通常采用的技术方案包括常规的液质联用(LC-MS)分析技术和选择性反应/多反应监测技术(MRM/ SRM)。常规分析法首先利用LC-MS的方法对待分析样本进行大规模代谢组分析,然后通过与相同分析条件下标准品的分析结果进行比对,实现对样本内目标代谢群的定性和定量分析。MRM/SRM技术是基于已知或假定的反应离子信息,有针对性地选择数据进行质谱信号采集,对符合规则的离子对进行信号记录,去除不符合规则离子信号的干扰。定量过程中,该技术首先筛选到目标代谢物特异性的母离子,然后选择性地对这些母离子进行...
代谢组学的研究领域有哪些?1、疾病机制研究。2、疾病诊断与防治。3、新药筛选和开发。4、药物作用机制的研究。5、药物毒性评价。6、植物的细胞代谢组学研究。7、微生物代谢组学研究。代谢组能够检测到的代谢物含量是多少?不同检测平台的灵敏度不一样,灵敏度比较高,可达到fM级。另外,相同含量的不同物质,由于自身化学性质不同,质谱的离子化效率、信号响应强度会差异很大。物质的检测灵敏度跟自身的化学性质有关,化学性质的影响主要表现在离子化效率和质谱碎裂行为两方面。因此,相同含量的不同物质,可能一个能检测出来,另一个检测不出来。代谢组学关注的对象是分子量在1000以下的小分子化合物。武汉代谢组学质谱分析选择代...
代谢组学样品收集方法及所需样本量是什么?根据不同的检测要求,需要配合不同的样本量和样本采集方法,常规的方法和单个样本量如下:(1) 微生物和细胞样本:细胞迅速猝灭细胞并冷冻保存;单个样本细胞数量要求10^6。(2) 动物体液(如尿、血、组织、唾液):采样后要迅速预处理,如加入抗凝血剂、防腐剂,并立即冷冻处理(-80 ℃);单个样本要求体积为10μL。(3) 植物样本:采集后迅速冷冻(液氮),然后转入-80℃保存,单个样本要求质量为50mg。代谢组学技术可应用于疾病早期诊断。贵阳常规靶向代谢组学分析研究LC-MS非靶向代谢组学:LC-MS非靶向代谢组学通过液质联用(LC-MS)方法检测生物体受外...
LC-MS非靶向代谢组学:LC-MS非靶向代谢组学通过液质联用(LC-MS)方法检测生物体受外界刺激前后体内大多数小分子代谢物的动态变化,重点寻找在实验组和对照组中有明显变化的代谢物,进而研究这些代谢物与生理病理变化的相关关系,其研究对象大都是分子量1500Da以内的小分子物质。LC-MS非靶向代谢组学技术优势:1、较高的灵敏度、分辨率;2、较宽的动态范围;3、适合于生物样本中复杂代谢产物的检测和潜在标志物的鉴定;4、适合对标本中未知代谢物的探索研究。代谢组学主要技术手段是质谱(MS)。深圳代谢组学主要技术代谢组学的研究对象与层次有哪些?一般来说,代谢组学关注的对象是分子量在1000以下的小分...
代谢组学适用范围:1、体液:血清、血浆、尿液、唾液、膝盖滑液、脑脊液、卵泡液、牛奶、痰液、舌苔液、胆汁等。2、组织:各种动物组织和植物组织。3、细胞:细胞及细胞培养液等。3、微生物:大肠杆菌、链球菌等。4、其他:粪便、食糜、肠道内容物等。应用领域:1、非靶向代谢物组学结果的验证。2、代谢相关生理、病理研究。3、发酵工艺研究。4、食品科学与营养学研究。非靶向代谢组学分析内容:非靶向代谢组学分析内容大致包括数据的预处理(包括质谱峰提取和质谱峰校正)-数据质控(包括t-检验、主成分分析等)--差异代谢物分析(包括聚类分析、通路注释分析、多组学关联分析等)。代谢组学是要涉及研究每一个代谢组分的共性、特...
代谢组学样品收集方法及所需样本量是什么?根据不同的检测要求,需要配合不同的样本量和样本采集方法,常规的方法和单个样本量如下:(1) 微生物和细胞样本:细胞迅速猝灭细胞并冷冻保存;单个样本细胞数量要求10^6。(2) 动物体液(如尿、血、组织、唾液):采样后要迅速预处理,如加入抗凝血剂、防腐剂,并立即冷冻处理(-80 ℃);单个样本要求体积为10μL。(3) 植物样本:采集后迅速冷冻(液氮),然后转入-80℃保存,单个样本要求质量为50mg。代谢组学主要研究的是作为各种代谢路径的底物和产物的小分子代谢物(MW
代谢组学技术介绍:代谢组学技术(Metabolomics) 是基因时代发展起来的系统生物学新技术,以生物体内所有代谢产物为研究对象,其主要目标是定性定量研究代谢物与机体生理病理变化之间的关系。代谢物的变化与细胞所处内外环境密切相关。与基因组学和蛋白质组学相比,代谢组学提供了一种更加直接的生理状态检测方式。就研究方法而言,代谢组学主要包括靶向(Targeted)代谢组学和非靶向(Untargeted)代谢组学两部分。非靶向代谢组学是针对一定生理状态下的全代谢组学,一目了然地发现差异性代谢物,其优势在于全方面性。而靶向代谢组学则是针对具体代谢物,以标准品为参照,进行相对的定量分析,具有更好的灵敏度...
代谢组学的概念:代谢组学的概念来源于代谢组,代谢组是指某一生物或细胞在一特定生理时期内所有的低分子量代谢产物,代谢组学则是对某一生物或细胞在一特定生理时期内所有低分子量代谢产物同时进行定性和定量分析的一门新学科。它是以组群指标分析为基础,以高通量检测和数据处理为手段,以信息建模与系统整合为目标的系统生物学的一个分支。 代谢组学主要研究的是作为各种代谢路径的底物和产物的小分子代谢物(MW
代谢组学样本收集指南:1.血浆样本收集:(1)从合适的静脉采集血液(典型10mL)到标记的肝素锂血浆收集管中(肝素锂用作抗凝剂)。(2)立即于4 °C离心(3000g)20min,上清液即为血浆。(3)离心完毕,取出血浆收集管,取上清液(血浆),分等份(0.5mL或0.1mL),转移到冻存管中(冰上),旋盖。(4)保存于-80℃冰箱。寄样需足量干冰。2.血清样本收集:(1)从合适的静脉采集血液(典型10mL)到血清收集管中。(2)将血清收集管冰水浴(4℃)凝集至少1h(2h以内),记录凝集时间。(3)将血清收集管放到冷冻离心机中低温(4℃)离心15min(2500 g)。(4)离心完毕,取出血...
代谢组学样本收集植物组织:叶片、茎、花:1)取整片叶片/一段茎/一朵花,放入离心管或锡箔纸中并标记,迅速放入液氮中冷冻处理至少15 min。2)将装有样本的离心管迅速放入自封袋中(每组一袋),在自封袋中放入标签纸注明样本信息。3)迅速放入-80 ℃冰箱冻存。足量干冰寄送。注意:(1)采集叶片样本时,在中午光照好的时间收集。(2)采集样本时保持样本一致性,尤其是同一组样本(颜色、衰老程度、叶脉占比、光照、位置等)。根:1)取整株植物的根部,迅速用PBS缓冲液或者超纯水漂洗掉根上的泥土、培养基或营养液等;2)吸水纸吸干水分后,分装为500 mg/管;3)标号后迅速放入液氮中冷冻处理至少15 min...
代谢组学究竟是一门什么样的研究方向?首先定义什么是代谢组学。简单的说就是研究生物体对内外刺激的整体代谢应答规律。那么为什么代谢组学是基因组,转录组,蛋白质组的下游。我们研究它到底有什么意义。中心法则告诉我们了遗传信息的流向,的执行者蛋白质中很多酶参与了体内的代谢过程。基因测序数量太大,而且基因水平解释问题往往很吃力。因为基因的调控和生物学事件之间隔了一个很漫长的信号转导过程。蛋白同理,一是蛋白种类巨大,二是蛋白组学发展进入瓶颈;发展代谢组是因为代谢物种类只有不到1w种,建立它的差异分析更加简单,同时在价格等方面更有推广的意义。代谢组学的研究处于生物信息流的中游。武汉LC-MS/MS非靶向脂质组...
代谢组学概念:基因与蛋白质的表达紧密相连,而代谢物则更多地反映了细胞所处的环境,这又与细胞的营养状态,药物和环境污染物的作用,以及其它外界因素的影响密切相关。因此有人认为,“基因组学和蛋白质组学告诉你什么可能会发生,而代谢组学则告诉你什么确实发生了。”代谢组学的概念来源于代谢组,代谢组是指某一生物或细胞在一特定生理时期内所有的低分子量代谢产物,代谢组学则是对某一生物或细胞在一特定生理时期内所有低分子量代谢产物同时进行定性和定量分析的一门新学科。它是以组群指标分析为基础,以高通量检测和数据处理为手段,以信息建模与系统整合为目标的系统生物学的一个分支。代谢组学是在基因组学和蛋白质组学之后新近发展起...
代谢组学(英语:metabolomics)是对细胞,生物流体,组织或生物体内的小分子(通常称为代谢物,metabolites)的大规模研究。 这些小分子及其在生物系统中的相互作用统称为代谢组。能够对生物样本中的代谢物进行全方面分析的一项新兴技术,被定义为代谢组学技术。代谢组学是在后基因组学时代兴起的一门跨领域学科,其主要目标是定量的研究生命体对外界刺激、病理生理变化、以及本身基因突变而产生的其体内代谢物水平的多元动态反应。之后得到迅速发展并渗透到多项领域,比如疾病诊断、医药研制开发、营养食品科学、毒理学、环境学,植物学等与人类健康护理密切相关的领域。代谢组学研究对象大是相对分子质量1000以内...
代谢组学是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生物整体、组织的内源性代谢物质的代谢途径及其所受内在或者外在因素的影响及随时间变化的规律。代谢组学通过揭示内在和外在因素影响下代谢整体的变化轨迹来反映某种病理生理过程中所发生的一系列生物事件。代谢组学在系统生物学的末端。以人体为例,对基因序列信息研究是基因组学的范畴。转录组学研究基因在外在或内在环境刺激下不同的表达。基因信息翻译成蛋白质后,各种蛋白的形状、功能、相互关系是蛋白组学的研究范畴。各种营养物质经过人体的消化、代谢后的代谢物,就是代谢组学的研究范围。...
代谢组学应用方向:肠道菌群代谢组学,运用代谢组学检测肠菌代谢物的动态变化,了解肠道菌群在宿主中的代谢状态,直观的研究肠道菌群与疾病发生的发展的关系,为疾病的预防,调高宿主的健康水平提供新的思路。经典脂质组学:对生物体、组织或细胞中的脂质以及与其相互作用的分子进行全方面系统的鉴定分析。了解脂质的结构和功能,揭示脂质代谢与细胞乃至机体的生理、病理过程之间的关系,普遍运用于分子生理学、功能基因组学以及环境与健康等重要领域。代谢组学是效仿基因组学和蛋白质组学的研究思想。山东植物靶向代谢组学服务如何获得高质量GC/MS代谢组学数据?实验设计先不谈,在仪器分析阶段,若想获得高质量数据,有以下几个方面需要注...
代谢产物是基因表达的产物,在代谢酶的作用下生成。虽然与基因或蛋白质相比,代谢产物较小,但是不能形成代谢产物的细胞是死细胞,因此不能小看代谢产物的重要性。研究人员通过对机体代谢产物的深入研究,可以判断机体是否处于正常状态,而对基因和蛋白质的研究都无法得出这样的结论。事实上,代谢组学研究已经能诊断出一些代谢类疾病,如糖尿病、肥胖症,代谢综合症。目前,已经研究清楚的普通代谢途径包括三羧酸循环(TCA),糖酵解,花生四烯酸 (AA)/炎症途径。代谢组学是研究关于生物体被扰动后其代谢产物种类、数量及其变化规律的科学。上海LC-MS/MS非靶向代谢组学方法代谢组学适用范围:1、体液:血清、血浆、尿液、唾液...
LC-MS非靶向代谢组学:LC-MS非靶向代谢组学通过液质联用(LC-MS)方法检测生物体受外界刺激前后体内大多数小分子代谢物的动态变化,重点寻找在实验组和对照组中有明显变化的代谢物,进而研究这些代谢物与生理病理变化的相关关系,其研究对象大都是分子量1500Da以内的小分子物质。LC-MS非靶向代谢组学技术优势:1、较高的灵敏度、分辨率;2、较宽的动态范围;3、适合于生物样本中复杂代谢产物的检测和潜在标志物的鉴定;4、适合对标本中未知代谢物的探索研究。代谢组学技术可应用于药物毒理学。哈尔滨个性化定制靶向代谢组学领域代谢组学究竟是一门什么样的研究方向?首先定义什么是代谢组学。简单的说就是研究生物...
LC-MS非靶向代谢组学:LCMS非靶向是通过液质联用(LC–MS)方法检测生物体受扰动或刺激前后大量代谢产物的动态变化,从中找出表达差异的代谢物,进而阐明生物体代谢相关过程的代谢组学技术。LCMS非靶向代谢组学适用于分析难挥发或热稳定性差的代谢产物,具有高通量、高分辨率、高灵敏度的特点。超高压液相色谱或超高效液相色谱(UPLC)通过采用更小粒径的色谱填料配合更高的压力,实现了更好的分离,具体包括更高的分离能力、更快的分离速度以及更好的灵敏度;串联质谱仪在MS扫描模式下,可实现高低碰撞能量快速切换,同时采集代谢物的一二级质谱信息,结合代谢组学数据处理软件对质谱信息的解析,在单次分析中可检测和鉴...