代谢组学样本收集植物组织:叶片、茎、花:1)取整片叶片/一段茎/一朵花,放入离心管或锡箔纸中并标记,迅速放入液氮中冷冻处理至少15 min。2)将装有样本的离心管迅速放入自封袋中(每组一袋),在自封袋中放入标签纸注明样本信息。3)迅速放入-80 ℃冰箱冻存。足量干冰寄送。注意:(1)采集叶片样本时,在中午光照好的时间收集。(2)采集样本时保持样本一致性,尤其是同一组样本(颜色、衰老程度、叶脉占比、光照、位置等)。根:1)取整株植物的根部,迅速用PBS缓冲液或者超纯水漂洗掉根上的泥土、培养基或营养液等;2)吸水纸吸干水分后,分装为500 mg/管;3)标号后迅速放入液氮中冷冻处理至少15 min,-80 ℃冻存,干冰寄送。代谢组学主要技术手段是色谱(HPLC,GC)。武汉GC-MS非靶向代谢组学检测价格
代谢组学的研究分为靶向和非靶向。通俗说就是你有没有目标分子。传统代谢组学研究利用的是GC-MS,因为代谢物大多数都不是高沸点的,而且GC-MS有庞大的数据库检索。然后发展的LC-MS差不多,就是克服了一些高沸点物质难以检测的弊端。NMR用于代谢组学不是很多,一方面是NMR这个东西入行起点有点高,另一方面是样品太复杂而且灵敏度不高。但是NMR样品处理简单,无损。不需要各种衍生化。而且NMR对于物质结构的指认要比MS更精确(比如异构体)因此对定性非常有用,成为非靶向代谢组学的重要方法。河南代谢组学费用代谢组学主要研究的是产物的小分子代谢物(MW<1000)。
代谢组学研究方法: 对于代谢产物来说,不只只有质谱峰这个特征。更进一步说,质谱(MS)并不能检测出所有的代谢产物,并不是因为质谱的灵敏度不够,而是由于质谱只能检测离子化的物质,但有些代谢产物在质谱仪中不能被离子化。采用核磁共振(NMR)的方法,可以弥补色谱的不足。过去,只有毒理学方面的研究使用核磁共振,而质谱只在植物代谢研究中采用。如今,这两种方法在代谢组学研究中已经普遍使用。为在不同样品间进行有意义的比较,研究人员必须结合使用这两种方法获得的大量数据进行分析。此外,还需要结合基因组学研究获得的数据。
非靶向代谢组学:新陈代谢网络是复杂的网络,特别是人体的代谢网络,一直被认为是相对复杂的代谢网络。现在多数信号通路的研究是集中在代谢网络的一个很小的领域。基因组学、蛋白组学研究已经揭示了部分调节通路,但是和代谢网络直接相关的是代谢产物。从多种代谢产物中选取研究对象,无疑是困难的。非靶向代谢组学又称为发现代谢组学,主要是将对照组和实验组的代谢组(某一生物体的全部代谢物)进行比对,以找出其代谢物的差异。代谢组学研究通过一定的手段能够帮助研究员从代谢产物海中跳出来,提供一个“航拍”的视角,从而发现差异性代谢产物。然后通过已知的代谢通路逆推找出调节酶和基因,完成疾病发病机制、药物疗理机制等方面的研究。代谢组学先进分析检测技术结合模式识别和专家系统等计算分析方法是代谢组学研究的基本方法。
代谢组学检测的手段有哪些?主要技术手段是核磁共振(NMR ),液-质联用(LC-MS),气-质联用(GC-MS),色谱(HPLC,GC)等。通过检测一系列样品的谱图,再结合化学模式识别方法,可以判断出生物体的病理生理状态,基因的功能,药物的毒性和药效等,并有可能找出与之相关的生物标志物(biomarker)。代谢组学可以检测哪些样品?代谢组学主要研究的是作为各种代谢路径的底物和产物的小分子代谢物(MW<1000)。其样品主要是尿液,血浆或血清,唾液,以及细胞和组织的提取液。我们也做过植物,微生物提取物,脑脊液昆虫血淋巴,羊水,卵泡液,膝盖滑液,眼泪,粪便及肠道内容物提取液等。代谢组学技术可应用于药物毒理学。上海动物靶向代谢组学质谱鉴定
代谢组学是系统生物学的重要组成部分。武汉GC-MS非靶向代谢组学检测价格
非靶向代谢组学:非靶向代谢组学是将生物体所有内源性代谢物作为研究目标(广筛),重点在于比较实验组和对照组,发现寻找其种具有明显的变化的代谢物质(差异代谢物),并构建代谢通路以解释代谢物于该生命体的关联。LC-MS非靶向代谢组的优势:1、分析范围广,MS几乎可以检测所有的化合物,更加容易地解决了分析热不稳定化合物的难题;2、分离能力强,即使被分析混合物在色谱上没有完全分离开,但通过MS的特征离子质量色谱图也能分别给出它们各自的色谱图来进行定性定量。武汉GC-MS非靶向代谢组学检测价格