代谢组学概念:基因与蛋白质的表达紧密相连,而代谢物则更多地反映了细胞所处的环境,这又与细胞的营养状态,药物和环境污染物的作用,以及其它外界因素的影响密切相关。因此有人认为,“基因组学和蛋白质组学告诉你什么可能会发生,而代谢组学则告诉你什么确实发生了。”代谢组学的概念来源于代谢组,代谢组是指某一生物或细胞在一特定生理时期内所有的低分子量代谢产物,代谢组学则是对某一生物或细胞在一特定生理时期内所有低分子量代谢产物同时进行定性和定量分析的一门新学科。它是以组群指标分析为基础,以高通量检测和数据处理为手段,以信息建模与系统整合为目标的系统生物学的一个分支。代谢组学是在基因组学和蛋白质组学之后新近发展起来的一门学科。江苏靶向代谢组学鉴定
靶向代谢组学:靶向代谢组学分析主要是以标准品为参照,对特定的代谢物群进行有针对性地、特异性地检测与分析。通常采用的技术方案包括常规的液质联用(LC-MS)分析技术和选择性反应/多反应监测技术(MRM/ SRM)。常规分析法首先利用LC-MS的方法对待分析样本进行大规模代谢组分析,然后通过与相同分析条件下标准品的分析结果进行比对,实现对样本内目标代谢群的定性和定量分析。MRM/SRM技术是基于已知或假定的反应离子信息,有针对性地选择数据进行质谱信号采集,对符合规则的离子对进行信号记录,去除不符合规则离子信号的干扰。定量过程中,该技术首先筛选到目标代谢物特异性的母离子,然后选择性地对这些母离子进行碰撞诱导,去除其他离子的干扰,只对选定的特异MS/MS2离子进行质谱信号的采集,从而实现对目标代谢分子更为特异、灵敏、准确的分析。四川动物靶向代谢组学技术服务代谢组学是继基因组学、蛋白质组学、转录组学后出现的新兴“组学”。
靶向代谢组学:靶向代谢组学(Targeted Metabolomics)是代谢组学研究的重要组成部分,也是全代谢组研究的延伸与拓展。相对于全代谢组分析而言,靶向代谢组分析具有特异性强,检测灵敏度高和定量准确等几个特点。通过对血液、尿液或其他体液以及组织中某一特定的代谢物的富集与准确定量定性分析,一方面可以结合其它实验数据揭示相关的分子生物学作用机制,另一方面,也可以为后续代谢分子标志物的深入研究和开发利用提供有力支持。靶向代谢组学可以用于:验证有非靶向代谢组学实验提出的假说;进行基于假说的探索性实验,针对特定代谢物,研究代谢模型。
GC-MS非靶向与代谢组学的关系?代谢组学是运用多种技术手段,研究生物体系中小分子代谢物(包括氨基酸、糖和磷酸糖、生物胺和脂质等)的种类、数量及变化规律的科学,是系统生物学的重要组成部分。其中GC-MS非靶向代谢组学是对生物体内源性代谢物进行系统全方面的分析平台。气相色谱-质谱联用(GC-MS)技术因为其较为成熟、分辨率高、灵敏度高、重现性好,拥有大量标准质谱图数据库的特点,被大量地运用在植物、动物、微生物的研究中。随着信息科学和分析技术的发展,运用GC-MS非靶向代谢组学研究疾病机制和发现药物靶点的方法日趋成熟,其重要性也日益凸显。GC-MS非靶向代谢组学也在代谢性疾病等药物靶点、疾病机制研究和药物靶点发现中提供重要参考和启示。代谢组学技术得到了迅速发展。
代谢产物是基因表达的产物,在代谢酶的作用下生成。虽然与基因或蛋白质相比,代谢产物较小,但是不能形成代谢产物的细胞是死细胞,因此不能小看代谢产物的重要性。研究人员通过对机体代谢产物的深入研究,可以判断机体是否处于正常状态,而对基因和蛋白质的研究都无法得出这样的结论。事实上,代谢组学研究已经能诊断出一些代谢类疾病,如糖尿病、肥胖症,代谢综合症。目前,已经研究清楚的普通代谢途径包括三羧酸循环(TCA),糖酵解,花生四烯酸 (AA)/炎症途径。代谢组学的代谢产物是基因表达的产物。江苏靶向代谢组学鉴定
代谢组学技术可应用于病因病机研究。江苏靶向代谢组学鉴定
靶向代谢组学的一般分析流程为:1. 数据采集 第1步是得到标准品。如果无法从市场上买到,就必须定制合成。然后通过优化产物离子碰撞能量以得到的信号,再通过测定三重串联四极杆测定代谢物的 MRM 跃迁值。2. 定量 接下来用定量分析软件对 MRM 数据进行处理,得到报告。3. 统计分析和解释 将定量报告输入统计分析软件包,用统计工具,如ANOVA,对数据进行处理。靶向分析:在基于质谱的代谢组学分析中,要意识到离子强度和色谱保留时间都会随着时间的推移而产生漂移,所以在实验中,要按随机顺序对样本进行检测,且数据需要在同天同一批次进行采集,以减少误差。江苏靶向代谢组学鉴定