代谢组学样品收集方法及所需样本量是什么?根据不同的检测要求,需要配合不同的样本量和样本采集方法,常规的方法和单个样本量如下:(1) 微生物和细胞样本:细胞迅速猝灭细胞并冷冻保存;单个样本细胞数量要求10^6。(2) 动物体液(如尿、血、组织、唾液):采样后要迅速预处理,如加入抗凝血剂、防腐剂,并立即冷冻处理(-80 ℃);单个样本要求体积为10μL。(3) 植物样本:采集后迅速冷冻(液氮),然后转入-80℃保存,单个样本要求质量为50mg。代谢组学主要研究的是作为各种代谢路径的底物和产物的小分子代谢物(MW<1000)。贵州动物靶向代谢组学应用
GC-MS非靶向代谢组学医学分析生物样本为何要衍生化处理?有哪些衍生化的方法?GC的流动相为气体(通常为高纯氦),这就要求被分析物必须能够气化,而生物样本中很多内源性代谢物都含有极性基团,具有沸点高、不易气化特点。衍生化能够降低这些代谢物的沸点,增加它们的热稳定性,以便分析能够顺利进行。衍生化方法及试剂种类繁多,根据不同的分析目标,需选择合适的衍生化方法。如分析脂肪酸,我们可以采用甲酯化衍生。在GC/MS代谢平台上,比较常用的衍生化方法是硅烷化衍生,因为它的广谱高效。在进行硅烷化衍生之前,还需添加甲氧胺吡啶溶液,以封闭羰基(针对α-酮酸和糖类,保护作用),减少衍生化副产物的生成。贵州个性化定制靶向代谢组学定量分析代谢组学先进分析检测技术结合模式识别和专家系统等计算分析方法是代谢组学研究的基本方法。
代谢组学(英语:metabolomics)是对细胞,生物流体,组织或生物体内的小分子(通常称为代谢物,metabolites)的大规模研究。 这些小分子及其在生物系统中的相互作用统称为代谢组。能够对生物样本中的代谢物进行全方面分析的一项新兴技术,被定义为代谢组学技术。代谢组学是在后基因组学时代兴起的一门跨领域学科,其主要目标是定量的研究生命体对外界刺激、病理生理变化、以及本身基因突变而产生的其体内代谢物水平的多元动态反应。之后得到迅速发展并渗透到多项领域,比如疾病诊断、医药研制开发、营养食品科学、毒理学、环境学,植物学等与人类健康护理密切相关的领域。
代谢组学研究方法:代谢组学的研究方法与蛋白质组学的方法类似,通常有两种方法。一种方法称作代谢物指纹分析 (metabolomic fingerprinting),采用液相色谱-质谱联用(LC-MS)的方法,比较不同血样中各自的代谢产物以确定其中所有的代谢产物。从本质上来说,代谢指纹分析涉及比较不同个体中代谢产物的质谱峰,然后了解不同化合物的结构,建立一套完备的识别这些不同化合物特征的分析方法。另一种方法是代谢轮廓分析(metabolomic profiling),研究人员假定了一条特定的代谢途径,并对此进行更深入的研究。代谢组学是用来解决什么问题的呢?
代谢组学应用方向:肠道菌群代谢组学,运用代谢组学检测肠菌代谢物的动态变化,了解肠道菌群在宿主中的代谢状态,直观的研究肠道菌群与疾病发生的发展的关系,为疾病的预防,调高宿主的健康水平提供新的思路。经典脂质组学:对生物体、组织或细胞中的脂质以及与其相互作用的分子进行全方面系统的鉴定分析。了解脂质的结构和功能,揭示脂质代谢与细胞乃至机体的生理、病理过程之间的关系,普遍运用于分子生理学、功能基因组学以及环境与健康等重要领域。代谢组学效仿了基因组学和蛋白质组学的研究思想。北京农学靶向代谢组学分析方法
代谢组学研究对象大是相对分子质量1000以内的小分子物质。贵州动物靶向代谢组学应用
代谢组学疾病诊断应用:与基因组学和蛋白质组学相比, 代谢组学的研究侧重于相关特定组分的共性,是要涉及研究每一个代谢组分的共性、特性和规律,目前据此目标相距甚远。尽管充满了挑战,研究人员仍然坚信,与基因组学和蛋白质组学相比,代谢组学与生理学的联系更加紧密。疾病导致机体病理生理过程变化,引起代谢产物发生相应的改变,通过对某些代谢产物进行分析,并与 正常人的代谢产物比较,寻找疾病的生物标记物,将提供一种较好的疾病诊断方法。贵州动物靶向代谢组学应用