蛋白质组学技术方法介绍：蛋白质组学技术方法：生物质谱：生物质谱技术是蛋白质组学研究中比较重要的鉴定技术，其基本原理是样品分子离子化后，根据不同离子之间的荷质比（M/E）的差异来分离并确定分子量。对于经过双向电泳分离的目标蛋白质用胰蛋白酶酶解（水解Lys或Arg的-C端形成的肽键）成肽段，对这些肽段用质谱进行鉴定与分析。目前常用的质谱包括两种：基质辅助激光解吸电离-飞行时间质谱（MALDI-TOF-MS）和电喷雾质谱（ESI- MS）。在未来的发展中，蛋白质组学的研究领域将更加普遍。四川常规蛋白质组学鉴定

蛋白组学技术：质谱技术相较于传统蛋白质鉴定技术而言，拥有灵敏、准确、高通量、自动化等特点。质谱鉴定蛋白质的基本原理是先将样品分子离子化，然后根据不同离子之间的质荷比差异来分离并确定蛋白质的相对分子质量。根据蛋白质酶解后所得到的肽质量指纹图谱、肽序列标签、和肽阶梯序列去检索蛋白质或核酸序列数据库，质谱技术可达到对蛋白质的快速鉴定和高通量筛选。因产生离子的方法不同而发展起来的质谱包括基质辅助激光解吸离子化质谱、电喷雾离子化质谱、表面增强激光解吸离子化质谱等。河南Label free非标记定量蛋白质组学技术在当前的生物医学研究和临床诊断中，蛋白质组学相关技术有非常多的应用。

我们究竟怎么研究蛋白质组学呢？目前高通量检测蛋白质的方法中，还是首推基于质谱的方法，纳流液相可以将复杂样品中的肽段高效地分离，然后依次进入质谱，对每个被离子化的肽段及其碎裂后碎片的荷质比进行分析，从而得到该肽段的序列信息，然后根据对应的色谱峰面积或者报告离子强度等信息，我们又可以得到该肽段的定量信息。蛋白组学研究怎么做？当下蛋白组学研究中应用比较普遍的技术是同位素标记定量（iTRAQ/TMT技术）。iTRAQ/TMT技术是利用DDA扫描模式，其扫描的方式是将一级质谱信号比较强的Top20的多肽进行二级打碎，然后进入二级质谱进行检测。其优势是二级谱图采集的肽段信息都来源于同一条多肽，有利于后续的定性分析。

蛋白质组学描述： 蛋白质组（proteome）：一种细胞、组织或生物体完整基因组所对应的全套蛋白质。蛋白质组学（proteomics）：研究细胞、组织或生物体中蛋白质组成、变化、定位及相互作用规律的科学。蛋白质谱技术： 蛋白质谱技术是蛋白质鉴定分析的主要支撑技术，它通过测定样品离子的质荷比(m/z) 来进行成分和结构分析。高灵敏度，精确度；能同时提供样品的精确分子量和结构信息；既可用于定性分析，也可用于定量分析。标记定量技术原理： 在一级质谱图中，任何一种iTRAQ/TMT试剂标记不同样本中的同一蛋白质表现为相同的质荷比； 在二级质谱图中，报告离子表现为不同质荷比的峰，因此根据波峰的高度及面积，可以鉴定出蛋白质和分析出同一蛋白质不同处理的定量信息。蛋白质组研究技术涉及到各种重要的生物学现象，如信号转导、细胞分化、蛋白质折叠等等。

蛋白质组学：质谱分析蛋白质组学的基本原理主要是通过测定被测样品离子的理化性质来进行分析，根据样品的质量谱图和相关信息从而得到定性和定量结果。目前，蛋白质组学质谱分析一般是根据保留时间（retentiontime）、质荷比（m/z）、离子强度（intensity）这三个维度对肽蛋白质进行鉴定和定量，即3D蛋白质组学。4D蛋白质组学在3D蛋白质组学的基础之上增加了第四维度，离子淌度（mobility），主要根据离子的形状和截面对离子进行分离，能够区分m/z差值非常小的肽段，使低丰度蛋白信号能够被区分和识别出来。4D蛋白质组学基于timsTOFPro质谱仪，结合PASEF（ParallelAccumulationSerialFragmentation，同步累积连续碎裂）与TIMS（TrappedIonMobilitySpectrometry，离子迁移谱），可重复测量所有检测离子的碰撞截面（CCS），能更快、更灵敏的进行蛋白质组定性和定量。蛋白质组研究技术覆盖了原核微生物、真核微生物、植物和动物等范围。四川定量乙酰化蛋白质组学技术服务

蛋白质组学技术的本质（从分析化学角度来看），就是对蛋白质的定性定量分析。四川常规蛋白质组学鉴定

蛋白质组学样品寄样要求：动物组织的样本蛋白量相对较高，送样量的要求也相对比较宽松，一般提供50~100mg的量即可。此外，组织上有血迹、脂肪、结缔组织的还需要用PBS和组织剪将其清理干净。送样前将样品用液氮速冻5min，放置在-80℃保存，送样时需要置于干冰环境中运输。动物的悬浮培养细胞也是比较热门的蛋白组学研究对象，如果想做细胞的蛋白组学，起码需要1×107个细胞，离心后收集，置于-80摄氏度环境中。蛋白质组学，指对某一基因组所表达的所有蛋白质及其特征进行大规模、系统化地研究，以期望在蛋白质水平上解释控制复杂的生命活动的分子网络。四川常规蛋白质组学鉴定