代谢组学的概念:代谢组学的概念来源于代谢组,代谢组是指某一生物或细胞在一特定生理时期内所有的低分子量代谢产物,代谢组学则是对某一生物或细胞在一特定生理时期内所有低分子量代谢产物同时进行定性和定量分析的一门新学科。它是以组群指标分析为基础,以高通量检测和数据处理为手段,以信息建模与系统整合为目标的系统生物学的一个分支。 代谢组学主要研究的是作为各种代谢路径的底物和产物的小分子代谢物(MW<1000)。 在食品安全领域,利用代谢组学工具发现农兽药等在动植物体内的相关生物标志物也是一个热点领域。其样品主要是动植物的细胞和组织的提取液。主要技术手段是核磁共振,质谱,色谱,其中以NMR为主。通过检测一系列样品的NMR 谱图,再结合模式识别方法,可以判断出生物体的病理生理状态,并有可能找出与之相关的生物标志物。为相关预警信号提供一个预知平台。在食品安全领域,利用代谢组学工具发现农兽药等在动植物体内的相关生物标志物也是一个热点领域。湖北农学靶向代谢组学鉴定
代谢组学比较常用到的数据分析方法:代谢组学分析数据用于统计分析时,数据集通常为一个N × K的矩阵(X矩阵),N表示N个样本数,每一行表示一个样品, K表示K个变量,每一列表示一个变量,在代谢组学中变量通常是指代谢物含量。单变量分析方法只分别分析单个变量,不考虑多个变量的相互作用与内在联系。具有简单性、易应用性和可解释性。但是无法基于整体数据对所测样品的优劣、差异进行综合评价和分析。差异倍数变化大小(Fold Change,FC)表示实验组与对照组的含量比值,可以快速考察各个代谢物在不同组别之间的含量变化大小。贵阳农学靶向代谢组学分析与基因组学和蛋白质组学相比,代谢组学的研究侧重于相关特定组分的共性。
代谢组学概念:代谢组学主要研究的是作为各种代谢路径的底物和产物的小分子代谢物(MW<1000)。 在食品安全领域,利用代谢组学工具发现农兽药等在动植物体内的相关生物标志物也是一个热点领域。其样品主要是动植物的细胞和组织的提取液。主要技术手段是核磁共振(NMR),质谱(MS),色谱(HPLC,GC),其中以NMR为主。通过检测一系列样品的NMR 谱图,再结合模式识别方法,可以判断出生物体的病理生理状态,并有可能找出与之相关的生物标志物(biomarker)。
非靶向代谢组学:新陈代谢网络是复杂的网络,特别是人体的代谢网络,一直被认为是相对复杂的代谢网络。现在多数信号通路的研究是集中在代谢网络的一个很小的领域。基因组学、蛋白组学研究已经揭示了部分调节通路,但是和代谢网络直接相关的是代谢产物。从多种代谢产物中选取研究对象,无疑是困难的。非靶向代谢组学又称为发现代谢组学,主要是将对照组和实验组的代谢组(某一生物体的全部代谢物)进行比对,以找出其代谢物的差异。代谢组学研究通过一定的手段能够帮助研究员从代谢产物海中跳出来,提供一个“航拍”的视角,从而发现差异性代谢产物。然后通过已知的代谢通路逆推找出调节酶和基因,完成疾病发病机制、药物疗理机制等方面的研究。LC-MS非靶向代谢组的优势有什么?
GC-MS非靶向代谢组学能检测到哪些类别的代谢物?衍生化极大地拓展了GC/MS的检测分析范围。GC/MS能检测到有机酸、氨基酸、单糖、糖醇、胺类、脂肪酸、吲哚、单甘油酯、核苷、二糖、生育酚、甾醇和胆汁酸等代谢物。如何提高定性准确度?GC/MS的定性有双重标准,一是保留指数,二是质谱信息的相似度(similarity)。不同于LC/MS的软电离源,GC/MS使用的EI源属于硬电离,能量较强且稳定,在将代谢物分子电离后,分子离子峰进一步碎裂产生丰富的碎片离子。因此,我们很难在GC/MS上看到分子离子峰。GC/MS提供的是代谢物的“指纹图谱”,将仪器得到的实际指纹图谱和质谱库(如NIST库)进行比对后,我们将会得到一个叫相似度的指标。保留指数和相似度都必须满足设定的阈值,软件才会给出色谱峰的定性结果。然后采用标准品质谱信息进行完全比对定性,也就是说只有经过标准品比对,代谢物才是被100%定性。选择代谢组学作为科研技术手段的优势有哪些?湖北常规靶向代谢组学费用
代谢组学有哪些特点?湖北农学靶向代谢组学鉴定
代谢组学有哪些应用?近年来,代谢组学技术得到了迅速发展,主要可应用于:功能基因组学、疾病早期诊断、病因病机研究、药物毒理学、中医药现代化、植物代谢组学、微生物代谢组学、营养学、环境科学等生命科学的各个领域。为什么要选择代谢组学?首先需要明确的是代谢组学的目标分析物主要为生物小分子及其代谢产物,如糖、有机酸、脂质、维生素、氨基酸、芳香烃之类等化合物。所以,如果关注的是小分子物质,那么采用代谢组学的方法,可以对样品内检测到的小分子物质进行定性、定量分析。同于基因组学和蛋白组学,代谢组学的研究反映某一时刻下正在发生的生命活动情况,研究代谢物的表达量、代谢物与生理病理变化的关系,能够帮助寻找新的生物标记物,发现新的代谢途径,以及更进一步深入了解目前已知的这些途径,应用于疾病的早期诊断、药物靶点的发现、疾病的病理生理研究。湖北农学靶向代谢组学鉴定