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江苏蛋白质甲基化修饰组学有哪些类型

来源: 发布时间:2022-05-12

翻译后修饰蛋白组分析:蛋白质翻译后修饰是影响蛋白质功能并调节整个细胞过程的重要方式,几乎在每个细胞过程中都是不可或缺的。分析和鉴定翻译后修饰蛋白质对揭示蛋白质的功能和深入了解各种生理现象具有重要意义。大多数翻译后修饰蛋白以低化学计量和丰度存在,这限制了在分析全细胞裂解液时对其的检测。蛋白质是各种细胞功能比较重要的执行者,其功能正常与否决定着生命活动能否有序、高效的进行,而其中翻译后修饰起着至关重要的作用。翻译后修饰改变了蛋白质中不同氨基酸残基上的生物化学官能团,进而改变其化学性质或结构,使得蛋白质具有更为复杂的结构和更为完善的功能,实现更为精细的调节。蛋白质的翻译后修饰过程极其复杂,已知的翻译后修饰种类有20多种。但其中较为常见的主要是磷酸化、泛素化、SUMO化、酰(含乙酰)化、甲基化以及糖基化。蛋白质翻译后修饰PTMs通常包括磷酸化,糖基化,泛素化,亚硝基化,甲基化,乙酰化,脂质化和蛋白水解。江苏蛋白质甲基化修饰组学有哪些类型

泛素化修饰蛋白质组产品介绍:泛素化修饰(Ubiquitylation)是一种常见的蛋白质翻译后修饰,是指一个或多个泛素分子(Ubiquitin,由76个氨基酸组成的多肽)在一系列特殊的酶作用下,将细胞内的蛋白质分类,从中选出靶蛋白分子,并对靶蛋白进行特异性修饰的过程。 泛素化修饰是一种重要的翻译后修饰,泛素-蛋白酶体系统介导了真核生物80%~85%的蛋白质降解。除参与蛋白质降解之外,泛素化修饰还参与了细胞周期、增殖、细胞凋亡、分化、转录调控、基因表达、转录调节、信号传递、损伤修复、炎症免疫等几乎一切生命活动的调控。泛素化、心血管等疾病的发病密切相关。因此,作为近年来生物化学研究的一个重大成果,它已然成为研究、开发新药物的新靶点。河南蛋白质棕榈酰化修饰组学分析泛素化修饰还可以直接影响蛋白质的活性和定位。

蛋白翻译后修饰位点鉴定:蛋白质翻译后修饰(Post-Translational Modifications, PTMs)几乎参与了细胞所有正常生命活动的过程,并发挥十分重要的调控作用。蛋白质修饰位点能够影响蛋白的多种属性,包括蛋白质折叠、活性以及之后的功能,对于蛋白质修饰位点的发现及研究对阐明蛋白质的功能具有重要作用。技术特点:时间快,周期短;识别位点准确,采用高分辨率质谱技术可以准确定位到发生修饰的氨基酸位点。适用范围:已知蛋白序列;明确翻译后修饰的类型。

泛素化修饰蛋白质组学技术原理:尽管质谱仪器的分析能力近年来有了长足的发展,但是由于蛋白翻译后修饰化学计量值低、复杂性大,直接将蛋白组(如全细胞裂解产物,组织匀浆产物或全血清蛋白)的酶解肽段送入质谱鉴定和定量PTM是非常困难的。因此,很多翻译后修饰的富集方法会被采用,来提高样品中PTM肽段的丰度和相对比例,从而提高了质谱对翻译后修饰位点的鉴定效率。研究发现在泛素化修饰的蛋白在tyrpsin的作用下都会产生diGly位点。基于这一特异性,利用针对蛋白质翻译后修饰(PTM)基序(motif)抗体,在肽段水平上免疫亲和富集带有泛素化修饰的肽段,利用液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)进行定量分析,能够快速、准确、高通量地分析多种疾病相关信号通路关键节点蛋白修饰的变化,满足创新性研究、生物标志物鉴定、药物靶点筛选和评价的需求。蛋白质翻译后修饰组学有什么重要的作用呢?

乙酰化修饰蛋白组学应用方向:1、乙酰化修饰与细胞基因表达调控、表观调控、细胞凋亡、细胞代谢、信号转导、蛋白质稳定性等生理过程研究。2、乙酰化引起的代谢疾病、代谢紊乱发生等疾病机理研究。乙酰化生物学意义:1、调节DNA-蛋白、蛋白-蛋白相互作用;2、与其他PTMs发生crosstalk;3、调节酶活性;4、调控蛋白亚细胞定位。生物领域各个研究方面,如:1、农林领域:抗逆胁迫机制,生长发育机制,育种保护研究等;2、 畜牧业:肉类及乳品质研究,致病机理研究等。在技术上,研究翻译后修饰蛋白的主要挑战是开发特异性的检测和纯化方法。四川丙二酰化修饰蛋白质组学

蛋白质翻译后修饰(PTMs)是指蛋白质在翻译中或翻译后的化学修饰过程。江苏蛋白质甲基化修饰组学有哪些类型

磷酸化修饰蛋白质组学:磷酸化修饰蛋白质组的研究主要集中于真核生物中普遍存在的丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸的磷酸化。由于体内磷酸化蛋白的含量很低,因此在分析前必须对其进行分离和富集。目前,常用的磷酸化蛋白质的分离和富集技术包括固定化金属亲和色谱、免疫沉淀、强阳离子交换色谱、强阴离子交换色谱、反相色谱等。这些技术被整合和优化用于不同生物样品的磷酸化蛋白质组分析。翻译后修饰分析自中而下分析策略:自中而下的蛋白质组学技术可用于组蛋白修饰的分析。样品制备与普遍使用的自下而上的分析策略相同,直到得到纯化的组蛋白。提取组蛋白后,用GluC进行消化。然后用弱阳离子交换/亲水相互作用色谱与配备电子转移解离(的高分辨率质谱联机联用,对样品进行理想的分离。谱识别可以用传统的软件进行,但是由于估计适当的错误发现率的问题,需要对结果进行过滤。江苏蛋白质甲基化修饰组学有哪些类型

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