GC-MS非靶向代谢组学能检测到哪些类别的代谢物？衍生化极大地拓展了GC/MS的检测分析范围。GC/MS能检测到有机酸、氨基酸、单糖、糖醇、胺类、脂肪酸、吲哚、单甘油酯、核苷、二糖、生育酚、甾醇和胆汁酸等代谢物。如何提高定性准确度？GC/MS的定性有双重标准，一是保留指数，二是质谱信息的相似度（similarity）。不同于LC/MS的软电离源，GC/MS使用的EI源属于硬电离，能量较强且稳定，在将代谢物分子电离后，分子离子峰进一步碎裂产生丰富的碎片离子。因此，我们很难在GC/MS上看到分子离子峰。GC/MS提供的是代谢物的“指纹图谱”，将仪器得到的实际指纹图谱和质谱库（如NIST库）进行比对后，我们将会得到一个叫相似度的指标。保留指数和相似度都必须满足设定的阈值，软件才会给出色谱峰的定性结果。然后采用标准品质谱信息进行完全比对定性，也就是说只有经过标准品比对，代谢物才是被100%定性。代谢组学关注的对象是分子量在1000以下的小分子化合物。南京LC-MS／MS非靶向脂质组学方法

代谢组学疾病诊断应用： 代谢组学研究人员已经对此进行了研究。新生儿是否缺失酶基因，可以在出生时就检测出来。可检测出包括涉及合成途径中的基本成分（如氨基酸）的酶。酶缺失的结果就是相应的代谢产物过少或过多。尿症（PKU）是一种常见的婴儿疾病。这种疾病是由于缺失将苯丙氨酸水解成酪氨酸所必须的苯丙氨酸水解酶基因，导致血液中苯丙氨酸累积造成的。若是不能及时检测出这种天生的代谢缺乏，在婴儿出生后九个月内，就会引起无法挽救的大脑损伤。这种疾病通过简单的血样和尿素化验就可以确诊。而血样和尿素化验以后也将成为代谢指纹研究方法的一部分。像尿症那样的疾病，研究人员正试图从疾病的生物化学基础着手，而不是只有检测生物标记物。他们希望通过代谢组学，可以找到更好的方法去治这些疾病。南京LC-MS／MS非靶向脂质组学方法代谢组学技术可应用于疾病早期诊断。

代谢组学样本收集植物组织：果实、种子：1）对于含水量高、体积较大的果实（番茄、西瓜、苹果等）需要先将样品分成“均匀”的小块(≈ 200 mg/样本)分装至2 mL离心管中，标号后迅速放入液氮中冷冻处理至少15 min。2）对于细小的颗粒种子(拟南芥种子、谷物种子等)，可以先将同一组的植株种子混匀后再分装(≈ 200 mg/样本)至离心管中，标号后迅速放入液氮中冷冻处理至少15 min。3）对于要求对整个果实进行提取的（整粒葡萄等），需要把果实装在50 mL离心管/自封袋中，标号后迅速放入液氮中冷冻处理至少15min，-80 ℃冻存，干冰寄送。

靶向代谢组学的一般分析流程为：1. 数据采集 第1步是得到标准品。如果无法从市场上买到，就必须定制合成。然后通过优化产物离子碰撞能量以得到的信号，再通过测定三重串联四极杆测定代谢物的 MRM 跃迁值。2. 定量 接下来用定量分析软件对 MRM 数据进行处理，得到报告。3. 统计分析和解释 将定量报告输入统计分析软件包，用统计工具，如ANOVA，对数据进行处理。靶向分析：在基于质谱的代谢组学分析中，要意识到离子强度和色谱保留时间都会随着时间的推移而产生漂移，所以在实验中，要按随机顺序对样本进行检测，且数据需要在同天同一批次进行采集，以减少误差。代谢组学是要涉及研究每一个代谢组分的共性、特性和规律。

代谢组学样本收集注意事项：（1）血液离开动物或人体后，应尽快开展血清、血浆的分离，并严格按照操作说明进行。（2）采集到的血清为黄色透明液体、血浆为淡黄色半透明液体，如果发现样本中是红色，说明在已经发生了了溶血现象，样本需重新制备。（3）血清与血浆的主要区别在于血清中不含纤维蛋白原。血清和血浆中脂质，氨基酸，核苷酸等代谢谱存在差别。粪便样本收集：1.人粪便：（1）用无菌勺挖取新鲜的，排泄中后部的内侧粪便（避免尿液及其他壁对样本污染）；（2）分装样本20mg/管。（3）迅速放入液氮中冷冻处理至少15min.（4）-80℃冰箱冻存。寄样需足量干冰。代谢组学的代谢产物是基因表达的产物。杭州脂质代谢组学多服务

代谢组学研究对象大是相对分子质量1000以内的小分子物质。南京LC-MS／MS非靶向脂质组学方法

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