常用的定量蛋白质组学技术方法有以下几类:非标记(labelfree)的定量蛋白组学技术:Label free定量蛋白组学技术是通过液质联用技术对蛋白质酶解肽段进行质谱分析,无需使用昂贵的稳定同位素标签做内部标准,只需分析大规模鉴定蛋白质时所产生的质谱数据,比较不同样品中相应肽段的信号强度,从而对肽段对应的蛋白质进行相对定量。TMT定量蛋白组学技术:这种技术采用多个(2-10)稳定同位素标签,特异性标记多肽的氨基基团进行串联质谱分析,能够同时比较多达10种不同样本中蛋白质的相对含量,可用于研究不同病理条件下或者不同发育阶段的组织样品中蛋白质表达水平的差异。Label free定量蛋白组学技术无需使用昂贵的稳定同位素标签做内部标准。哈尔滨定量乙酰化蛋白质组学价钱
iTRAQ/TMT标记定量蛋白质组介绍:iTRAQ/TMT标记定量蛋白质组研究是对一个基因组表达的全部蛋白质或一个复杂混合体系内所有蛋白质进行标记,利用标记试剂中的二级报告离子来对蛋白进行精确鉴定和定量。技术优势:1、适用范围广:可检测到的蛋白除了胞浆蛋白外,还有线粒体蛋白、膜蛋白。也能对任何类型的蛋白质进行鉴定,包括高分子量,酸性,碱性蛋白质;2、高通量:一次可以实现多个样品的定性定量分析,特别适用于采用多种处理方式或来自多个处理时间的样本的差异蛋白分析。广东常规蛋白质组学项目蛋白质组随着基因组学研究的不断深入,蛋白质组学已逐渐成为研究热点。
蛋白质组学的分析介绍:蛋白质组学的分析主要指蛋白的生信分析,依赖于数据库的建立。现在常用的蛋白质组学生信分析有GO功能分析和KEGG通路分析。GO(gene ontology)是基因本体联合会(Gene Onotology Consortium)所建立的数据库。根据基因产物的相关分子功能、生物学途径、细胞组分而给予定义,无物种相关性。是系统分析基因功能,它将基因组的信息与基因功能联系起来,旨在揭示生命现象的遗传与化学蓝图。旨在借助计算机全方面地展示细胞和生物所包含的生物学信息;根据基因组中的信息,用计算机计算或者预测出比较复杂的细胞中的通路或者生物的复杂行为。
蛋白质组学(英语:proteomics,又译作蛋白质体学),是以蛋白质组为研究对象,研究细胞、组织或生物体蛋白质组成及其变化规律的科学。蛋白质组学研究不只是探索生命奥秘的必须工作,也能为人类健康事业带来巨大的利益,是生命科学进入后基因时代的特征。蛋白质是生命存在和运动的物质基础,是细胞增殖、分化、衰老和凋亡等重大生命活动的执行者,亦是基因功能活动的之后的执行者,是生命现象复杂性和多变性的直接体现者。蛋白质组研究是为了识别及鉴定一个细胞或组织所表达的全部蛋白质以及它们的表达模式,是对基因组研究的重要补充,是对生物体在蛋白质水平上定量、动态、整体性的研究。这类研究有助于了解蛋白的结构、细胞的功能、生命的本质及活动规律,为疾病的诊断、疫苗及新药开发提供科学依据。蛋白质组学由此获得蛋白质水平上的关于疾病发生,细胞代谢等过程的整体而全方面的认识。
4D定量蛋白质组学 :目前,蛋白质组学质谱分析一般是根据保留时间(retention time)、质荷比(m/z)、离子强度(intensity)这三个维度对肽蛋白质进行鉴定和定量,即3D蛋白质组学。4D蛋白质组学在3D蛋白质组学的基础之上增加了第四维度,离子淌度(mobility),主要根据离子的形状和截面对离子进行分离,能够区分m/z差值非常小的肽段,使低丰度蛋白信号能够被区分和识别出来。蛋白质组学分析策略:蛋白质组学分析包括分析蛋白质的结构和功能、翻译后修饰情况、蛋白质定位、蛋白质表达情况以及蛋白质间的相互作用等等。基于不同的分析内容可以采用不同的蛋白质组学分析技术和分析策略。有很多蛋白质组学研究者在工业界和医院进行相关研究和日常工作。济南定量蛋白组学
质谱技术相较于传统蛋白质鉴定技术而言,拥有灵敏、准确、高通量、自动化等特点。哈尔滨定量乙酰化蛋白质组学价钱
蛋白质学组翻译后修饰的研究策略:自中而下:自中而下的分析方法是自下而上分析方法的一种替代方法,分析组蛋白时其原理类似于自下而上分析策略。在使用这种分析方法时,通常需要将被检测蛋白质消化成3-9kDa范围内的肽段,因此也无法保证检测到的肽段的完整性。但是,由于仪器的进步和保留了组蛋白尾部的组合修饰,自中而下分析法正逐渐受到欢迎。自中而下更接近于自下而上法的灵敏度。自上而下:自上而下技术可以直接对完整的蛋白质进行测序,包括翻译后修饰的蛋白质和其他大的蛋白质片段,而不只是肽段。这可以比较大程度地保留与PTMs相关的信息,使其适用于组蛋白的全方面表征和分析。哈尔滨定量乙酰化蛋白质组学价钱