LC-MS非靶向代谢组学:LCMS非靶向是通过液质联用(LC–MS)方法检测生物体受扰动或刺激前后大量代谢产物的动态变化,从中找出表达差异的代谢物,进而阐明生物体代谢相关过程的代谢组学技术。LCMS非靶向代谢组学适用于分析难挥发或热稳定性差的代谢产物,具有高通量、高分辨率、高灵敏度的特点。超高压液相色谱或超高效液相色谱(UPLC)通过采用更小粒径的色谱填料配合更高的压力,实现了更好的分离,具体包括更高的分离能力、更快的分离速度以及更好的灵敏度;串联质谱仪在MS扫描模式下,可实现高低碰撞能量快速切换,同时采集代谢物的一二级质谱信息,结合代谢组学数据处理软件对质谱信息的解析,在单次分析中可检测和鉴定几百至几千种代谢物。代谢组学与临床化学较为相似。四川靶向代谢组学定性分析
代谢组学的研究领域有哪些?1、疾病机制研究。2、疾病诊断与防治。3、新药筛选和开发。4、药物作用机制的研究。5、药物毒性评价。6、植物的细胞代谢组学研究。7、微生物代谢组学研究。代谢组能够检测到的代谢物含量是多少?不同检测平台的灵敏度不一样,灵敏度比较高,可达到fM级。另外,相同含量的不同物质,由于自身化学性质不同,质谱的离子化效率、信号响应强度会差异很大。物质的检测灵敏度跟自身的化学性质有关,化学性质的影响主要表现在离子化效率和质谱碎裂行为两方面。因此,相同含量的不同物质,可能一个能检测出来,另一个检测不出来。四川靶向代谢组学定性分析与基因组学和蛋白质组学相比,代谢组学的研究侧重于相关特定组分的共性。
为什么选择代谢组学作为科研技术手段?1)小分子的产生和代谢是生物机体作用的结果,生物体液的代谢产物分析能够更直接,更准确的反映生物体的病理生理状态。2)基因和蛋白质表达的有效微小变化会在代谢物上得到放大,从而使检测更容易;3)代谢组学的代谢物信息库简单,但它远没有全基因组测序及大量表达序列标签的数据库那么复杂;4)代谢物的种类少,要远小于基因和蛋白质的数据,物质的分子结构要简单得多。5)代谢产物在各个生物体系中都是类似的,所以代谢组学研究中采用的技术更容易在各个领域中通用,也更容易被人接受。
代谢组学的研究领域有哪些?1、疾病机制研究;2、疾病诊断与防治;3、新药筛选和开发;4、药物作用机制的研究;5、药物毒性评价;6、植物的细胞代谢组学研究;7、微生物代谢组学研究。代谢组学的研究方法:代谢组学的研究方法与蛋白质组学的方法类似,通常有两种方法。一种方法称作代谢物指纹分析,采用液相色谱-质谱联用(LC-MS)的方法,比较不同血样中各自的代谢产物以确定其中所有的代谢产物。从本质上来说,代谢指纹分析涉及比较不同个体中代谢产物的质谱峰,了解不同化合物的结构,建立一套完备的识别这些不同化合物特征的分析方法。另一种方法是代谢轮廓分析,研究人员假定了一条特定的代谢途径,并对此进行更深入的研究。代谢组学的研究方法与蛋白质组学的方法类似,通常有两种方法。
代谢组学的研究分为靶向和非靶向。通俗说就是你有没有目标分子。传统代谢组学研究利用的是GC-MS,因为代谢物大多数都不是高沸点的,而且GC-MS有庞大的数据库检索。然后发展的LC-MS差不多,就是克服了一些高沸点物质难以检测的弊端。NMR用于代谢组学不是很多,一方面是NMR这个东西入行起点有点高,另一方面是样品太复杂而且灵敏度不高。但是NMR样品处理简单,无损。不需要各种衍生化。而且NMR对于物质结构的指认要比MS更精确(比如异构体)因此对定性非常有用,成为非靶向代谢组学的重要方法。代谢组学可与生物表型变化建立直接相关性。广东常规靶向代谢组学方法
代谢组学作为系统生物学的重要组成部分,在临床医学领域具有普遍的应用前景。四川靶向代谢组学定性分析
代谢组学疾病诊断应用:与基因组学和蛋白质组学相比,代谢组学的研究侧重于相关特定组分的共性,是要涉及研究每一个代谢组分的共性、特性和规律,目前据此目标相距甚远。尽管充满了挑战,研究人员仍然坚信,与基因组学和蛋白质组学相比,代谢组学与生理学的联系更加紧密。疾病导致机体病理生理过程变化,引起代谢产物发生相应的改变,通过对某些代谢产物进行分析,并与正常人的代谢产物比较,寻找疾病的生物标记物,将提供一种较好的疾病诊断方法。四川靶向代谢组学定性分析