RNA-Seq转录组学技术优势:相比基因芯片和标记的碱基序列的测序方法,RNA-seq具有一定的优越性。与基因芯片相比,RNA-Seq不只可以在更高的分辨率下用来测量基因的表达水平情况,还可以揭示未知的转录组和拼接亚型,并为选择性拼接亚型提供定量分析。相对于传...
蛋白质组学在医疗和健康方面有什么应用?作为主要研究策略的蛋白质组学:这与题目中的描述更相关些,蛋白质组学是研究中的关键方法(甚至是唯1方法)。具体而言,蛋白质组学在此类应用中,更多地用于提供高通量蛋白质定性定量信息。作为检测手段的蛋白质组学:事实上,在当前的生...
转录组学测序流程:1、样品RNA准备。2、测序文库构建。3、DNA成簇(Cluster)扩增。4、高通量测序(Illumina)。5、数据分析。转录组的分析大致有以下几种情况:1、同一物种在发育过程中的各时间节点的基因表达特点及存在的差异;2、不同品系之间存在...
我国科学家已经在重大疾病如肝病、维甲酸诱导白血病细胞凋亡启动模型及维甲酸定向诱导胚胎干细胞向神经系统分化的模型等比较蛋白质组研究以及一些重要生理和病理体系的蛋白质组成分研究方面获得了重要成就。蛋白质组学的重要应用领域有:在临床疾病中的应用、在微生物蛋白质组学中...
蛋白质组学技术方法介绍:蛋白质组学技术方法:生物质谱:生物质谱技术是蛋白质组学研究中比较重要的鉴定技术,其基本原理是样品分子离子化后,根据不同离子之间的荷质比(M/E)的差异来分离并确定分子量。对于经过双向电泳分离的目标蛋白质用胰蛋白酶酶解(水解Lys或Arg...
蛋白质翻译后修饰组学技术原理:首先将蛋白样本酶解成肽段混合物,然后使用液相色谱对酶解后的肽段混合物进行组分分离以降低样本复杂程度,然后通过高质量的修饰类抗体和生物材料对修饰肽段进行富集,之后上样至液相色谱 - 串联质谱中进行分析,通过相应的数据库检索匹配,一次...
代谢组学技术介绍:代谢组学技术(Metabolomics) 是基因时代发展起来的系统生物学新技术,以生物体内所有代谢产物为研究对象,其主要目标是定性定量研究代谢物与机体生理病理变化之间的关系。代谢物的变化与细胞所处内外环境密切相关。与基因组学和蛋白质组学相比,...
翻译后修饰蛋白组分析:蛋白质翻译后修饰是影响蛋白质功能并调节整个细胞过程的重要方式,几乎在每个细胞过程中都是不可或缺的。分析和鉴定翻译后修饰蛋白质对揭示蛋白质的功能和深入了解各种生理现象具有重要意义。大多数翻译后修饰蛋白以低化学计量和丰度存在,这限制了在分析全...
转录组学,基因组学,蛋白质组学的区别:蛋白组学针对的是全体蛋白,组要以2D-Gel和质谱为主,分为top-down和bottom-up分析方法。理念和基因组类似,将蛋白用特定的物料化学手段分解成小肽段,在通过质量反推蛋白序列,之后进行搜索,标识已知未知的蛋白序...
蛋白质组学主要以全蛋白组(组织、细胞)、线粒体蛋白组、叶绿体蛋白组和外泌体蛋白组为研究对象,通过对蛋白组进行定性、定量、分子功能分析、通路互作分析和蛋白互作分析,揭示生物学功能、作用机制、疾病诊断的标志物以及预测蛋白的上、下游变化关系。蛋白质组学可以克服核酸水...
根据不同的作用位点,蛋白质乙酰化修饰分为:发生在蛋白N端的乙酰化修饰、发生在蛋白赖氨酸上的乙酰化修饰。前者发生在90%以上的真核生物新生蛋白上,对于新生蛋白的成熟和细胞定位非常重要,由N乙酰转移酶(NATs)负责;而后者是一个可逆的过程,主要由赖氨酸乙酰化酶(...
定量N-糖基化蛋白质组学:蛋白质的N-糖基化位点修饰是重要的蛋白质翻译后修饰之一,主要在复杂的多细胞或组织形成过程中起关键作用。蛋白质的N-糖基化修饰位点具有保守的氨基酸序列NX(S/T)(其中X为除脯氨酸以外的其它氨基酸)凝集素亲和法是目前糖蛋白质组学中应用...
蛋白质组研究:蛋白质组研究是指系统研究在某一特定时间、特定条件下,某一种特定组织中的所有蛋白质。对蛋白质的研究也不只是局限于蛋白质的氨基酸序列,而是包括了蛋白质的表达量,蛋白质活性,被修饰的状况以及和其他蛋白质或分子的相互作用情况、亚细胞定位和三维结构。这些信...
单细胞RNA-seq转录组学工作流程:单细胞RNA测序等高通量单细胞转录组学技术通常从针对不同瘤和组织类型(解离、分选和分离细胞等)量身定制的实验工作流程开始,然后产生可以比对的序列,量化、质量控制(QC)过滤和以不同方式标准化,以实现许多下游计算分析,例如聚...
泛素化修饰蛋白质组学技术原理:尽管质谱仪器的分析能力近年来有了长足的发展,但是由于蛋白翻译后修饰化学计量值低、复杂性大,直接将蛋白组(如全细胞裂解产物,组织匀浆产物或全血清蛋白)的酶解肽段送入质谱鉴定和定量PTM是非常困难的。因此,很多翻译后修饰的富集方法会被...
定量蛋白质组学分析(QuantitativeProteomics)是对一个基因组表达的全部蛋白质或一个复杂混合体系内所有蛋白质进行精确鉴定和定量。可用于筛选和寻找任何因素引起的样本之间的差异表达蛋白,结合生物信息学揭示细胞生理病理等功能,同时也可对某些关键蛋白...
代谢组学样本收集指南:1.血浆样本收集:(1)从合适的静脉采集血液(典型10mL)到标记的肝素锂血浆收集管中(肝素锂用作抗凝剂)。(2)立即于4 °C离心(3000g)20min,上清液即为血浆。(3)离心完毕,取出血浆收集管,取上清液(血浆),分等份(0.5...
代谢组学样本收集植物组织:叶片、茎、花:1)取整片叶片/一段茎/一朵花,放入离心管或锡箔纸中并标记,迅速放入液氮中冷冻处理至少15 min。2)将装有样本的离心管迅速放入自封袋中(每组一袋),在自封袋中放入标签纸注明样本信息。3)迅速放入-80 ℃冰箱冻存。足...
定量蛋白质组学技术:定量蛋白质组学是蛋白质组研究的重要内容,通过对基因表达产物——蛋白质的定量分析,以了解基因在不同的生理、病理和逆境条件下的表达情况。近年来,随着非凝胶技术的发展,蛋白质组学(“Shotgun”proteomics)技术,特别是多维蛋白质鉴定...
蛋白质翻译后修饰加入的官能团反应有:1、乙酰化——通常于蛋白质的N末端加入乙酰。2、烷基化——加入如甲基或乙基等烷基。3、甲基化——烷基化中常见的一种,在赖氨酸、精氨酸等的侧链氨基上加入甲基。4、生物素化——用生物素附加物令保存的赖氨酸酰化。5、谷氨酸化——在...
代谢组学(英语:metabolomics)是对细胞,生物流体,组织或生物体内的小分子(通常称为代谢物,metabolites)的大规模研究。 这些小分子及其在生物系统中的相互作用统称为代谢组。能够对生物样本中的代谢物进行全方面分析的一项新兴技术,被定义为代谢组...
泛素化修饰蛋白质组学样品要求:1、动物组织的样品量湿重不少于200mg。2、植物细菌、噬菌体等微生物类样品量湿重不少于2g。3、富含杂质或蛋白质含量低的样品量湿重不少于5g;如植物的根,木质部、韧皮部组织等。4、体液类(唾液、羊水、脑脊液等)10mL以上,要保...
代谢组学究竟是一门什么样的研究方向?首先定义什么是代谢组学。简单的说就是研究生物体对内外刺激的整体代谢应答规律。那么为什么代谢组学是基因组,转录组,蛋白质组的下游。我们研究它到底有什么意义。中心法则告诉我们了遗传信息的流向,的执行者蛋白质中很多酶参与了体内的代...
泛素化修饰蛋白质组技术原理:首先将蛋白样本酶解成肽段混合物,然后使用液相色谱对酶解后的肽段混合物进行组分分离以降低样本复杂程度,然后通过高质量的泛素化修饰类抗体和生物材料对修饰肽段进行富集,之后上样至液相色谱-串联质谱中进行分析定量。技术优势:1、高特异性的修...
蛋白质组研究内容:1.蛋白质鉴定:可以利用一维电泳和二维电泳并结合Western等技术,利用蛋白质芯片和抗体芯片及免疫共沉淀等技术对蛋白质进行鉴定研究。2.翻译后修饰:很多mRNA表达产生的蛋白质要经历翻译后修饰如磷酸化,糖基化,酶原刺激等。翻译后修饰是蛋白质...
代谢组学概念:基因与蛋白质的表达紧密相连,而代谢物则更多地反映了细胞所处的环境,这又与细胞的营养状态,药物和环境污染物的作用,以及其它外界因素的影响密切相关。因此有人认为,“基因组学和蛋白质组学告诉你什么可能会发生,而代谢组学则告诉你什么确实发生了。”代谢组学...
翻译后修饰蛋白组分析:蛋白质翻译后修饰是影响蛋白质功能并调节整个细胞过程的重要方式,几乎在每个细胞过程中都是不可或缺的。分析和鉴定翻译后修饰蛋白质对揭示蛋白质的功能和深入了解各种生理现象具有重要意义。大多数翻译后修饰蛋白以低化学计量和丰度存在,这限制了在分析全...
蛋白质翻译后修饰组学技术原理:首先将蛋白样本酶解成肽段混合物,然后使用液相色谱对酶解后的肽段混合物进行组分分离以降低样本复杂程度,然后通过高质量的修饰类抗体和生物材料对修饰肽段进行富集,之后上样至液相色谱 - 串联质谱中进行分析,通过相应的数据库检索匹配,一次...
转录组分析是目前应用比较广的高通量测序分析技术之一。常见设计是不同样品之间比较,寻找差异基因、标志基因、协同变化基因、差异剪接和新转录本,并进行结果可视化、功能注释和网络分析等。转录组的测序分析也相对成熟,从RNA提取、构建文库、上机测序再到结果解析既可以自己...
蛋白质组学样品寄样要求:动物组织的样本蛋白量相对较高,送样量的要求也相对比较宽松,一般提供50~100mg的量即可。此外,组织上有血迹、脂肪、结缔组织的还需要用PBS和组织剪将其清理干净。送样前将样品用液氮速冻5min,放置在-80℃保存,送样时需要置于干冰环...