蛋白质组学主要以全蛋白组（组织、细胞）、线粒体蛋白组、叶绿体蛋白组和外泌体蛋白组为研究对象，通过对蛋白组进行定性、定量、分子功能分析、通路互作分析和蛋白互作分析，揭示生物学功能、作用机制、疾病诊断的标志物以及预测蛋白的上、下游变化关系。蛋白质组学可以克服核酸水平预测的不确定性、反映核酸翻译后修饰情况。常用技术：非靶向蛋白组学：蛋白质定性（胶条鉴定和溶液鉴定），高通量定量蛋白组（Labelfree、iTRAQ/TMT和DIA定量），多肽组学。蛋白质组的研究能为众多种疾病机理的阐明及攻克提供理论根据和解决途径。北京修饰蛋白组学研究

蛋白组学研究怎么做？PRM:平行反应监测(ParallelReactionMonitoring)是一种基于高分辨、高精度质谱的离子监视技术，能够对目标蛋白质、目标肽段（如发生翻译后修饰的肽段）进行选择性检测，从而实现对目标蛋白质/肽段进行一定定量，因此也被称之为基于液相色谱质谱联用技术的WesternBlot（LC-MSMSbasedWesternBlot,L-WB）。PRM技术基于Q-Orbitrap为表示的高分辨、高精度质谱平台，首先利用四级杆质量分析器的选择能力，用Q1选择目标肽段的母离子，随后在Collisioncell中对母离子进行碎裂，之后利用Orbitrap分析器在二级质谱中检测所选择的母离子窗口内的所有碎片信息。这样即可对复杂样本中的目标蛋白质/肽段进行准确地特异性分析。济南DIA定量蛋白质组学项目蛋白质组与基因组相对应，也是一个整体的概念。

蛋白质组学的目标是要回答关于蛋白质的4个方面的问题:①细胞中蛋白质的含量。②定位。③活性。④修饰。蛋白质组学的研究方法主要有:①蛋白质双向电泳。②氨基酸序列测定（包括N端测序和C端测序)。③质谱。④生物信息学。发育蛋白质组学指在某一特定的生长发育时期，在特定的生长条件下，特定的细胞、组织中所表达的所有蛋白质。发育蛋白质组学揭示了在每个特定时期所表达的蛋白质和这些不同的蛋白质在特殊的生长时期可能发挥的作用，是进一步了解和深入研究蛋白质功能的基础。

蛋白质组学与基因组学的差异：蛋白质组和基因组（genome）在概念上有相关性，某一个蛋白质组的蛋白质是由其基因组所编码的，然而蛋白质组学和基因组学在研究对象和研究方法上有很大的区别。基因组在所有的细胞中几乎都是完整的，与之不同，蛋白质组具有很高的细胞和组织特异性，不同的细胞组织表达不同的蛋白质组。蛋白质组的复杂性也远远高于基因组，这是因为一个基因≠一个转录产物≠一个蛋白质。比如据估计人的基因组由30000个基因组成，经mRNA剪切和蛋白质翻译后修饰将产生20万~200万个蛋白质。由于不同的转录起始和mRNA剪切使同一基因产生了不同的转录产物。同样由于不同的翻译起始，一个mRNA可以翻译成不同的蛋白质。蛋白质组研究技术涉及到各种重要的生物学现象，如信号转导、细胞分化、蛋白质折叠等。

什么样本能做蛋白组学检测？大概可以测到多少的蛋白种类？原则上只要能提取到蛋白，就可以做蛋白组检测。样本测到的蛋白种类跟数据库和样本本身蛋白浓度有关，一般数据库越大，可以鉴定到的蛋白质数量越多。也与样本的类型有关，通常，组织细胞相比于体液样本，能够鉴定到更多的蛋白。蛋白组学样本寄送前是否需要精确计数或是称量？不同样本寄送会有不同的送样要求，按照收集方法提供可以保证实验用量充足。不需要精确计数或是称量，项目开展前会进行蛋白浓度的测定，后续也是不同样本等蛋白量处理、上机检测，但是要保证每个样本的寄样量达到实验要求。蛋白质组学的研究方法将出现多种技术并存，各有优势和局限的特点。广东定量乙酰化蛋白质组学一般流程

蛋白质组学为农业作物的进一步开发利用提供巨大的参考价值。北京修饰蛋白组学研究

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