蛋白质组研究内容：1.蛋白质鉴定：可以利用一维电泳和二维电泳并结合Western等技术，利用蛋白质芯片和抗体芯片及免疫共沉淀等技术对蛋白质进行鉴定研究。2.翻译后修饰：很多mRNA表达产生的蛋白质要经历翻译后修饰如磷酸化，糖基化，酶原刺激等。翻译后修饰是蛋白质调节功能的重要方式，因此对蛋白质翻译后修饰的研究对阐明蛋白质的功能具有重要作用。基-受体结合分析。可以利用基因敲除和反义技术分析基因表达产物-蛋白质的功能。另外对蛋白质表达出来后在细胞内的定位研究也在一定程度上有助于蛋白质功能的了解。蛋白质组学的分析主要指蛋白的生信分析，依赖于数据库的建立。浙江DIA定量蛋白质组学领域

LabelFree(非标记蛋白质组学技术)：在非标记策略的定量模型中，主要涉及两种不同的算法：其一，以肽段的色谱峰积分面积为基础，通过比较一对生物样品中相对应到蛋白质酶解多肽的色谱积分面积而得到两者的相对丰度；其二，以肽段被质谱检测的计数为基础，通过归一化来表征被检测蛋白质的相对丰度。非标记技术认为肽段在质谱中被捕获检测的频率（Counts）与其在混合物中的丰度成正相关，因此蛋白质被质谱检测的计数反映了蛋白质的丰度，通过适当的数学公式可以将质谱检测计数与蛋白质的量联系起来，从而对蛋白质进行定量。广州常规蛋白质组学鉴定蛋白质组意指“一种基因组所表达的全套蛋白质”，即包括一种细胞乃至一种生物所表达的全部蛋白质。

蛋白质组学：蛋白质组一词，源于蛋白质与基因组两个词的组合，意指“一种基因组所表达的全套蛋白质”，即包括一种细胞乃至一种生物所表达的全部蛋白质。蛋白质组学本质上指的是在大规模水平上研究蛋白质的特征，包括蛋白质的表达水平，翻译后的修饰，蛋白与蛋白相互作用等，由此获得蛋白质水平上的关于疾病发生，细胞代谢等过程的整体而全方面的认识。蛋白质组的研究不只能为生命活动规律提供物质基础，也能为众多种疾病机理的阐明及攻克提供理论根据和解决途径。通过对正常个体及病理个体间的蛋白质组比较分析，我们可以找到某些“疾病特异性的蛋白质分子”，它们可成为新药物设计的分子靶点，或者也会为疾病的早期诊断提供分子标志。确实，那些世界范围内销路*的药物本身是蛋白质或其作用靶点为某种蛋白质分子。因此，蛋白质组学研究不只是探索生命奥秘的必须工作，也能为人类健康事业带来巨大的利益。

蛋白质组的研究不但能为生命活动规律提供物质基础，也能为众多种疾病机理的阐明及攻克提供理论根据和解决途径。通过对正常个体及病理个体间的蛋白质组比较分析，我们可以找到某些“疾病特异性的蛋白质分子”，它们可成为新药物设计的分子靶点，或者也会为疾病的早期诊断提供分子标志。确实，那些世界范围内销路比较好的药物本身是蛋白质或其作用靶点为某种蛋白质分子。因此，蛋白质组学研究不只是探索生命奥秘的必须工作，也能为人类健康事业带来巨大的利益。蛋白质组学的研究是生命科学进入后基因时代的特征。对人类而言，蛋白质组学的研究终究要服务于人类的健康。

常用的定量蛋白质组学技术方法有以下几类：非标记（labelfree）的定量蛋白组学技术：Label free定量蛋白组学技术是通过液质联用技术对蛋白质酶解肽段进行质谱分析，无需使用昂贵的稳定同位素标签做内部标准，只需分析大规模鉴定蛋白质时所产生的质谱数据，比较不同样品中相应肽段的信号强度，从而对肽段对应的蛋白质进行相对定量。TMT定量蛋白组学技术：这种技术采用多个（2-10）稳定同位素标签，特异性标记多肽的氨基基团进行串联质谱分析，能够同时比较多达10种不同样本中蛋白质的相对含量，可用于研究不同病理条件下或者不同发育阶段的组织样品中蛋白质表达水平的差异。蛋白质组学的研究方法主要有：蛋白质双向电泳、氨基酸序列测定（包括N端测序和C端测序）、生物信息学。哈尔滨4D定量蛋白质组学鉴定

蛋白质组研究技术涉及到各种重要的生物学现象，如信号转导、细胞分化、蛋白质折叠等等。浙江DIA定量蛋白质组学领域

蛋白质组学研究策略：蛋白质组学研究主要分为自底向上（Bottom-Up），自顶向下（Top-Down）和自中向下（Middle-Down）三种策略。“自底向上”策略是指通过分析由蛋白质酶解生成的肽段来鉴定蛋白质。当应用该策略来分析蛋白质组混合物时，因其类似于基因组测序的鸟管法，所以又被称为鸟管法蛋白质组学（Shotgun Proteomics），该策略依赖于蛋白酶的酶切。“自中向下”策略也依赖于蛋白酶的酶切，但是由于采用了另外的酶，比如OmpT，只能酶切(Lys/Arg-Lys/Arg)，因此酶切之后的分子量较大，更利于后续的蛋白组装环节。浙江DIA定量蛋白质组学领域