翻译后修饰蛋白组分析:蛋白质翻译后修饰是影响蛋白质功能并调节整个细胞过程的重要方式,几乎在每个细胞过程中都是不可或缺的。分析和鉴定翻译后修饰蛋白质对揭示蛋白质的功能和深入了解各种生理现象具有重要意义。大多数翻译后修饰蛋白以低化学计量和丰度存在,这限制了在分析全细胞裂解液时对其的检测。蛋白质是各种细胞功能比较重要的执行者,其功能正常与否决定着生命活动能否有序、高效的进行,而其中翻译后修饰起着至关重要的作用。翻译后修饰改变了蛋白质中不同氨基酸残基上的生物化学官能团,进而改变其化学性质或结构,使得蛋白质具有更为复杂的结构和更为完善的功能,实现更为精细的调节。蛋白质的翻译后修饰过程极其复杂,已知的翻译后修饰种类有20多种。但其中较为常见的主要是磷酸化、泛素化、SUMO化、酰(含乙酰)化、甲基化以及糖基化。蛋白磷酸化修饰过程是通过蛋白激酶催化,将磷酸基团从ATP转移到多肽底物的丝氨酸、或酪氨酸残基上。济南棕榈酰化修饰蛋白质组学有哪些
蛋白质翻译后修饰自中而下分析策略:自中而下的蛋白质组学技术可用于组蛋白修饰的分析。样品制备与普遍使用的自下而上的分析策略相同,直到得到纯化的组蛋白。提取组蛋白后,用GluC进行消化。然后用弱阳离子交换/亲水相互作用色谱(WCX-HILIC)与配备电子转移解离(ETD)的高分辨率质谱联机联用,对样品进行理想的分离。谱识别可以用传统的软件进行,但是由于估计适当的错误发现率的问题,需要对结果进行过滤。自上而下分析策略:自上而下的技术可以直接引入完整的蛋白质并在串联质谱仪上对其进行片段化,不需要蛋白质水解消化。目前,有两种完全分离蛋白质的方法:离线和在线。前者用四维分离法,后者用WCX-HILIC。上海乙酰化修饰蛋白质组学质谱分析蛋白质磷酸化修饰组学具有探索性。
琥珀酰化修饰蛋白质组鉴定:蛋白质琥珀酰化修饰是新近发现的一种蛋白质翻译后修饰,是在琥珀酰辅酶 A 的介导下将一个负电荷四碳琥珀酰基转移到赖氨酸残基的伯胺上的过程。赖氨酸琥珀酰化在真核细胞及原核细胞中普遍存在,参与调控包括三羧酸循环,氨基酸代谢以及脂肪酸代谢在内的多个代谢信号通路。琥珀酰化蛋白质组以组织、细胞等较为复杂样本为研究对象,目的在于鉴定样品中发生琥珀酰化修饰的蛋白质以及相应的琥珀酰化修饰位点。琥珀酰化修饰蛋白质组技术特点:采用主流抗体亲和富集方法,特异性高,富集效率好。
磷酸化修饰蛋白质组学:在有机体内,磷酸化是蛋白翻译后修饰中比较普遍的共价修饰形式,同时也是原核生物和真核生物中比较重要的调控修饰形式。磷酸化对蛋白质功能的正常发挥起着重要的调节作用,该过程是由蛋白质激酶(Kinase)催化的把ATP或GTP的γ位磷酸基转移到底物蛋白质的氨基酸残基,如丝氨酸(Serine,Ser,S)、苏氨酸(Threonine,Thr,T)和酪氨酸(Tyrosine,Tyr,Y)等上的过程,而其逆向过程则是由蛋白质磷酸酶去除相应的磷酸基团。正是这两种酶的相反作用及其中所涉及到的能量消耗与生成使磷酸化成为体内很多生理活动调控的首先选择方式。蛋白质糖基化是一种常见的蛋白质翻译后修饰。
泛素化修饰蛋白质组学样品要求:1、动物组织的样品量湿重不少于200mg。2、植物细菌、噬菌体等微生物类样品量湿重不少于2g。3、富含杂质或蛋白质含量低的样品量湿重不少于5g;如植物的根,木质部、韧皮部组织等。4、体液类(唾液、羊水、脑脊液等)10mL以上,要保证不能溶血;血清要求500μl以上;尿液要求50mL以上。5、如直接提供蛋白质提取物,浓度不少于2 mg/mL,总量不少于1 mg。为保证实验效果,请尽量告知缓冲液成分,如是否有硫脲、SDS、强离子盐等等。另样品中应不含核酸、脂类、多糖等影响分离效果的成分。6、在细胞器蛋白质组学方面,提取细胞器或亚细胞器后,蛋白沉淀量在1 mg以上。蛋白质乙酰化修饰,顾名思义指的就是在蛋白质原有基础上面嫁接上乙酰化基团。河南蛋白质丙二酰化修饰组学研究
在细胞中,乙酰化修饰的反应由乙酰基转移酶所催化,将乙酰辅酶A的乙酰基转移并添加在蛋白质赖氨酸残基上。济南棕榈酰化修饰蛋白质组学有哪些
泛素化修饰蛋白质组学有些什么?泛素化可以生产出单泛素化或多泛素化蛋白质。后者在当7个赖氨酸残基的泛素与另一个泛素的甘氨酸C端连接形成。这种泛素分子链接在生物过程中起到重要的作用。共价结合泛素的蛋白质能被蛋白酶识别并降解,这是细胞内短寿命蛋白质和一些异常蛋白降解的普遍途径。泛素化及类泛素化蛋白在细胞分裂,自噬,DNA修复,免疫应答,细胞消亡等方面同样起到关键作用。与消化道内进行的蛋白质水解不同,从泛素与蛋白的结合到将蛋白水解成小的肽段,整个水解过程需要能量参与。人们开始意识到泛素-蛋白酶系统是一个对于真核细胞非常重要的调节系统。济南棕榈酰化修饰蛋白质组学有哪些