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RNA-Seq，是基于新一代测序技术的转录组学研究方法：首先提取生物样品的全部转录的RNA并进行mRNA富集，然后反转录为cDNA后进行的新一代高通量测序，在此基础上进行片段的拼接组装，从而可得到一个个的转录本，进而可以形成对该生物样品当前发育状态的基因表达状...

什么是转录组测序？转录组广义上指在某一生理条件下，细胞内所有转录组产物的组合，包括：mRNA、ncRNA、rRNA等；狭义上指所有mRNA的组合。转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和，主要包括mRNA和ncRNA。转录组...

蛋白质组学研究这样做：蛋白质组与基因组相对应，也是一个整体的概念，随着基因组学研究的不断深入，蛋白质组学已逐渐成为研究热点，对蛋白组学的研究可以使我们更容易接近生命的机理本质，但探究成千上万的蛋白质特性也是一个重大的技术挑战。蛋白质组（Proteome）指的是...

蛋白质翻译后修饰在蛋白质中磷酸化位点分析时应该注意些什么问题？覆盖率：覆盖率越高，检测和鉴定含有修饰基团的肽几率就越大。修饰位点的占有率：被修饰的蛋白质的百分比低，则检测到修饰肽的机会会随之减少。如果百分比较高（> 30％），则有助于识别修饰位点。棕榈酰化蛋白...

蛋白质组学研究策略有什么？“自顶向下”策略并不依赖于蛋白酶的酶切，而是直接鉴定完整蛋白质，在翻译后修饰和蛋白质同素异构体鉴定方面有一些潜在的优势。可是该策略的缺陷是蛋白质在气相中分离、电离及碎裂都十分困难。而鸟管法蛋白质组学由于将蛋白质酶解成肽段，使其在气相中...

代谢组学研究方法：代谢组学的研究方法与蛋白质组学的方法类似，通常有两种方法。一种方法称作代谢物指纹分析 （metabolomic fingerprinting），采用液相色谱-质谱联用（LC-MS）的方法，比较不同血样中各自的代谢产物以确定其中所有的代谢产物。...

转录组及转录组测序（RNA-seq）：转录组即特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和，包括mRNA和非编码RNA。转录组测序（RNA-seq）主要通过高通量测序研究特定组织或细胞在某个时期转录出来的mRNA的表达量，进而对相关基因和表型的关系进...

蛋白质翻译后修饰在蛋白质中磷酸化位点分析时应该注意些什么问题？覆盖率：覆盖率越高，检测和鉴定含有修饰基团的肽几率就越大。修饰位点的占有率：被修饰的蛋白质的百分比低，则检测到修饰肽的机会会随之减少。如果百分比较高（> 30％），则有助于识别修饰位点。棕榈酰化蛋白...

代谢组学样本收集注意事项：（1）血液离开动物或人体后，应尽快开展血清、血浆的分离，并严格按照操作说明进行。（2）采集到的血清为黄色透明液体、血浆为淡黄色半透明液体，如果发现样本中是红色，说明在已经发生了了溶血现象，样本需重新制备。（3）血清与血浆的主要区别在于...

转录组及转录组测序（RNA-seq）：转录组即特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和，包括mRNA和非编码RNA。转录组测序（RNA-seq）主要通过高通量测序研究特定组织或细胞在某个时期转录出来的mRNA的表达量，进而对相关基因和表型的关系进...

转录组学技术路线及研究意义：转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和，包括mRNA和非编码RNA。相对于传统的芯片杂交平台，转录组测序无需预先针对已知序列设计探针，即可对任意物种的整体转录活动进行检测，提供更准确的数字化信号...

根据不同的作用位点，蛋白质乙酰化修饰分为：发生在蛋白N端的乙酰化修饰、发生在蛋白赖氨酸上的乙酰化修饰。前者发生在90%以上的真核生物新生蛋白上，对于新生蛋白的成熟和细胞定位非常重要，由N乙酰转移酶（NATs）负责；而后者是一个可逆的过程，主要由赖氨酸乙酰化酶（...

选择代谢组学作为科研技术手段的优势有哪些？代谢组学的研究处于生物信息流的中游，介于基因、蛋白质和细胞、组织之间，在生物信息的传递中起到承上启下的作用。小分子的产生和代谢是基因表达的下游产物，生物体液的代谢产物分析能够更直接，更准确的反映生物体的病理生理状态。代...

iTRAQ/TMT标记定量蛋白质组介绍：iTRAQ/TMT标记定量蛋白质组研究是对一个基因组表达的全部蛋白质或一个复杂混合体系内所有蛋白质进行标记，利用标记试剂中的二级报告离子来对蛋白进行精确鉴定和定量。技术优势：1、适用范围广：可检测到的蛋白除了胞浆蛋白外，...

什么是代谢组学？代谢组学是用来解决什么问题的？代谢组学（Metabonomics/Metabolomics）是发展起来的一门新兴学科，是研究关于生物体被扰动后（如基因的改变或环境变化后）其代谢产物（内源性代谢物质）种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究...

蛋白质糖基化修饰组学技术服务：糖基化是在酶的控制下,蛋白质或脂质附加上糖类的过程,发生于内质网和高尔基体等部位。在糖基转移酶作用下将糖转移至蛋白质,和蛋白质上的氨基酸残基共价结合。蛋白质经过糖基化作用,形成糖蛋白。糖基化是对蛋白的重要的修饰作用,有调节蛋白质功...

泛素化修饰蛋白组学研究：泛素化修饰蛋白组学是一种重要的翻译后修饰。泛素-蛋白酶体系统介导了真核生物体内80%~85%的蛋白质降解。此外，泛素化修饰还可以直接影响蛋白质的活性和定位，调控包括细胞周期、细胞凋亡、转录调控、DNA 损伤修复以及免疫应答等在内的多种细...

什么叫转录组学？广义转录组是指生命单元(通常是一种细胞)中所有按基因信息单元转录和加工的RNA分子(包括编码和非编码RNA功能单元),或者是一个特定细胞所有转录本的总和.它的研究对象就是这些RNA与蛋白质分子和它们所组成的基因功能网络以及它们与细胞功能的关系....

转录组学的概念：转录组是指特定组织或细胞在某一发育阶段或功能状态下转录出来的所有RNA的汇合，包括蛋白质编码的信使RNA和非编码RNA（rRNA、tRNA和其他ncRNAs），高通量测序技术也被称为下一代测序（NGS）技术，推进了基因组学的研究进展。该项新技术...

蛋白质组学在医疗和健康方面有什么应用？作为主要研究策略的蛋白质组学:这与题目中的描述更相关些，蛋白质组学是研究中的关键方法(甚至是唯1方法)。具体而言，蛋白质组学在此类应用中，更多地用于提供高通量蛋白质定性定量信息。作为检测手段的蛋白质组学:事实上，在当前的生...

代谢组学样品收集方法及所需样本量是什么？根据不同的检测要求，需要配合不同的样本量和样本采集方法，常规的方法和单个样本量如下：(1) 微生物和细胞样本：细胞迅速猝灭细胞并冷冻保存；单个样本细胞数量要求10^6。(2) 动物体液（如尿、血、组织、唾液）：采样后要迅...

蛋白质翻译后修饰组学技术原理：首先将蛋白样本酶解成肽段混合物，然后使用液相色谱对酶解后的肽段混合物进行组分分离以降低样本复杂程度，然后通过高质量的修饰类抗体和生物材料对修饰肽段进行富集，之后上样至液相色谱 - 串联质谱中进行分析，通过相应的数据库检索匹配，一次...

代谢组学什么类型的样本更适合，样本采集需要注意什么？绝大多数可以可靠收集的生物样本都适用于代谢组学研究。常见的样本主要有：临床和动物的血清、血浆、尿液、粪便、各类组织、体液；细胞和微生物、培养液和发酵液；植物的根、茎、叶、花等。代谢每时每刻都在发生变化，我们需...

蛋白组究竟研究的是什么呢？第1，蛋白质定性，或者说大规模检测某些蛋白质是否存在于样品当中；第2，蛋白质定量，也就是大规模检测某些蛋白质的含量（包括一定含量与相对含量）；第3，蛋白质翻译后修饰，这些修饰主要包括磷酸化，泛素化，糖基化，乙酰化等等，也包括对这些翻译...

单细胞转录组关键步骤：单细胞的分离和捕获：温和分离，稀有细胞。转录本的捕获和扩增：RNA测序需要0.1-1.0ug total RNA，捕获效率10%（5-**NA测序需要1ng DNA，极限稀释加移液分离单细胞；显微操作分选单细胞；流式分选带有表面M...

定量蛋白质组学的方法学背景和意义：从生命活动的直接执行者——蛋白质的角度研究生命现象和规律（特别是疾病防治和病理研究）已成为研究生命科学的主要手段。而这些研究往往离不开对细胞、组织中含有蛋白质种类和表达量的研究。对处不同时期、不同条件下蛋白质表达水平变化的研究...

circRNA转录组学：是一类具有闭合环状结构的非编码RNA分子，没有5′ 帽子结构和3′ poly（A）结构，主要位于细胞质或储存于外泌体中，不受RNA外切酶影响，表达更稳定且不易降解，已被证明普遍存在于多种真核生物体内。大多数circRNA是由外显子环化而...

药物代谢和代谢组学区别：代谢组学与药物代谢不同是它关注的对象不是外源性的药物而是生物体本身就有的内源性代谢物。这些代谢物是糖，脂肪，蛋白质，核酸，胆汁酸等等代谢得到的。还有共生菌代谢的，是一个庞大的混合物。目的是通过样本的对比，发现潜在标志物，指导疾病早期诊断...

转录组是特定发育阶段或生理条件下细胞内的完整转录信息的汇合，表示了基因表达的中间状态。转录组测序可以对所有转录物进行分类、确定基因的转录结构、量化转录物的表达水平。蛋白质是生命功能的直接执行者，蛋白组是一种细胞乃至一种生物所表达的全部蛋白质。整合转录组学和蛋白...

代谢组学应用方向：肠道菌群代谢组学，运用代谢组学检测肠菌代谢物的动态变化，了解肠道菌群在宿主中的代谢状态，直观的研究肠道菌群与疾病发生的发展的关系，为疾病的预防，调高宿主的健康水平提供新的思路。经典脂质组学：对生物体、组织或细胞中的脂质以及与其相互作用的分子进...