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南京泛素化修饰蛋白质组学分析研究

来源: 发布时间:2022-04-25

泛素化修饰蛋白组学研究:泛素化修饰蛋白组学是一种重要的翻译后修饰。泛素-蛋白酶体系统介导了真核生物体内80%~85%的蛋白质降解。此外,泛素化修饰还可以直接影响蛋白质的活性和定位,调控包括细胞周期、细胞凋亡、转录调控、DNA 损伤修复以及免疫应答等在内的多种细胞活动。由于翻译后修饰的蛋白质在生物样本中含量低、动态范围广,质谱分析前需要对修饰进行富集以提高其丰度,然后利用传统的定量蛋白组分析手段对富集得到的泛素化肽段样品进行定量分析。蛋白质翻译后修饰组学对于蛋白质修饰位点的发现及研究对阐明蛋白质的功能具有重要作用。南京泛素化修饰蛋白质组学分析研究

乙酰化修饰蛋白组学实验流程:1)组织/细胞破碎,提取蛋白质;2)蛋白酶解成多肽片段;3)对多肽片段进行 iTRAQ 标记;4)高效特异性乙酰化抗体富集乙酰化修饰肽段;5)使用 LC-MS/MS 对富集的乙酰化肽段进行序列分析;5)数据分析,比对不同样本中蛋白乙酰化修饰水平差异,并对产生变化的生物学意义进行解释。乙酰化是一个普遍而重要的蛋白质翻译后修饰,不仅集中在对细胞染色体结构的影响以及对核内转录调控因子方面,而且还影响参与细胞周期和新陈代谢、肌动蛋白聚合控制及多聚谷氨酰胺疾病等方方面面。乙酰化不仅存在于真核细胞中,而且越来越多的证据也表明乙酰化同样影响许多原核细胞的生理生化过程。深圳蛋白质丙酰化修饰组学分析研究蛋白质乙酰化修饰,顾名思义指的就是在蛋白质原有基础上面嫁接上乙酰化基团。

泛素化修饰PRM定量验证:原理: 泛素化修饰是一种重要的翻译后修饰。泛素-蛋白酶体系统介导了真核生物体内80%~85%的蛋白质降解。此外,泛素化修饰还可以直接影响蛋白质的活性和定位,调控包括细胞周期、细胞凋亡、转录调控、DNA 损伤修复以及免疫应答等在内的多种细胞活动。首先对泛素化的蛋白进行胰酶消化,在赖氨酸的修饰位点上会产生两个甘氨酸的残基(K-GG),利用对泛素化赖氨酸(K-GG)具有高亲和力的基序抗体,特异性富集复杂样本中的泛素化肽段,结合LC-MS/MS蛋白质定量方法,实现大规模泛素化蛋白质定性定量分析。

乙酰化修饰蛋白组学应用方向:1、乙酰化修饰与细胞基因表达调控、表观调控、细胞凋亡、细胞代谢、信号转导、蛋白质稳定性等生理过程研究。2、乙酰化引起的代谢疾病、代谢紊乱发生等疾病机理研究。乙酰化生物学意义:1、调节DNA-蛋白、蛋白-蛋白相互作用;2、与其他PTMs发生crosstalk;3、调节酶活性;4、调控蛋白亚细胞定位。生物领域各个研究方面,如:1、农林领域:抗逆胁迫机制,生长发育机制,育种保护研究等;2、 畜牧业:肉类及乳品质研究,致病机理研究等。蛋白质翻译后修饰组学泛素化修饰是一种重要的翻译后修饰。

蛋白质翻译后修饰组学:翻译后修饰(Post-translational modification, PTM)是指对翻译后的蛋白质进行共价加工的过程。它通过在一个或多个氨基酸残基加上修饰基团,可以改变蛋白质的物理、化学性质,进而影响蛋白质的空间构象和活性状态、亚细胞定位、折叠及其稳定性以及蛋白质-蛋白质相互作用。蛋白质翻译后修饰的丰度变化在生命活动研究中具有重大意义,异常的翻译后修饰会导致多种疾病的发生。质谱可以分辨蛋白质修饰前和修饰后分子量上的变化,因此只要知道靶蛋白翻译后修饰前后分子量的变化,就能对翻译后修饰方式进行鉴定和定量。蛋白质磷酸化修饰组学具有有效性。广州蛋白质棕榈酰化修饰组学一般流程

蛋白质翻译后修饰在许多细胞过程中起着关键作用。南京泛素化修饰蛋白质组学分析研究

蛋白质翻译后修饰介绍:蛋白质翻译后修饰(PTMs)是指蛋白质在翻译中或翻译后的化学修饰过程。蛋白质翻译后修饰(PTMs)通过给蛋白质添加磷酸酯,乙酸酯,酰胺基或甲基等官能团增加蛋白质组的功能多样性,并影响正常细胞生物学和发病机理的几乎所有方面。蛋白质翻译后修饰在许多细胞过程中起着关键作用,如细胞分化、蛋白质降解、信号传导和调节过程、基因表达调节以及蛋白质相互作用。蛋白质翻译后修饰PTMs通常包括磷酸化,糖基化,泛素化,亚硝基化,甲基化,乙酰化,脂质化和蛋白水解。因此,PTM的特征(包括修饰类别和修饰位点)在细胞生物学以及疾病诊断和预防研究中至关重要。南京泛素化修饰蛋白质组学分析研究

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