转录组及转录组测序（RNA-seq）：转录组即特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和，包括mRNA和非编码RNA。转录组测序（RNA-seq）主要通过高通量测序研究特定组织或细胞在某个时期转录出来的mRNA的表达量，进而对相关基因和表型的关系进行分析。本质上讲RNA-seq就是在用一种新的方法实现“基因决定性状”的经典思路。在RNA-seq之前用于研究基因组表达分析的主要技术是基因芯片，不过由于高通量测序成本的下降，RNA-seq的运用愈来愈普遍。狭义上转录组学的指所有mRNA的组合。单细胞转录组学研究内容

转录组学的概念：转录组是指特定组织或细胞在某一发育阶段或功能状态下转录出来的所有RNA的汇合，包括蛋白质编码的信使RNA和非编码RNA（rRNA、tRNA和其他ncRNAs），高通量测序技术也被称为下一代测序（NGS）技术，推进了基因组学的研究进展。该项新技术除了研究静态基因组，近年来也开始应用于动态转录分析，由此衍生的技术称为RNA序列分析（RNA-seq）随着DNA基因芯片技术的快速发展，开创了这个病症近十年的高通量转录组研究。RNA-Seq技术可以从转录水平检测瘤中的改变基因。通过相关软件分析，鉴定相关改变基因在瘤发生的发展中所起的作用。然后经过刷选，进一步挑选出相关靶基因进行实验研究，有望为瘤的基因医治提供新的靶点。浙江SmalIRNA转录组学技术基于高通量测序平台的转录组学测序技术能够全方面获得物种特定组织的转录本信息。

宏转录组学适用范围包括人体微生态、环境、工业、农业等领域。宏转录组学以生态环境中的全部RNA为研究对象，避开了微生物分离培养困难的问题，能有效的扩展微生物资源的利用空间。应用领域：包括肠道微生物、口腔微生物、粪便微生物、人体组织微生物。宏转录学组的概念：宏转录组是特定时期、环境样本、组织样本中所有的微生物的RNA（转录本）的汇合。通过对这些转录本进行大规模高通量测序，可以直接获得环境中可培养和不可培养的微生物转录组信息。

转录组分析是目前应用比较广的高通量测序分析技术之一。常见设计是不同样品之间比较，寻找差异基因、标志基因、协同变化基因、差异剪接和新转录本，并进行结果可视化、功能注释和网络分析等。转录组的测序分析也相对成熟，从RNA提取、构建文库、上机测序再到结果解析既可以自己完成，又可以在专业公司进行。概括来看转录组的分析流程比较简单，序列比对-转录本拼接(可选)-表达定量-差异基因-功能富集-定制分析。整个环节清晰流畅，可以作为刚开始接触高通量测序学习比较合适的技术之一。转录组学可以在单核苷酸水平对任意物种的整体转录活动进行检测。

转录组学测序比其他研究方法有哪些优势?转录组学测序具有以下优势：（1）可以直接测定每个转录本片段序列、单核苷酸分辨率的准确度，同时不存在传统微阵列杂交的荧光模拟信号带来的交叉反应和背景噪音问题；（2）灵敏度高，可以检测细胞中少至几个拷贝的稀有转录本；（3）可以对任意物种进行全基因组分析，无需预先设计特异性探针，因此无需了解物种基因信息，能够直接对任何物种进行转录组分析，同时能够检测未知基因，发现新的转录本，并准确地识别可变剪切位点及cSNP，UTR区域。（4）检测范围广，高于6个数量级的动态检测范围，能够同时鉴定和定量稀有转录本和正常转录本。转录组广义上指在某一生理条件下，细胞内所有转录组产物的组合。单细胞转录组学研究内容

转录组学能够检测未知基因，发现新的转录本。单细胞转录组学研究内容

转录组学应用领域：海洋水产：生长发育机制，渔业资源，渔业环境与水产品安全等；微生物：致病机理，耐药机制，病原体-宿主相互作用研究等；生物医药：生物标志物，疾病机理机制，疾病分型，药物开发，个性化医治等；环境科学：发酵过程优化，生物燃料生产，环境危害风险评估研究等；食品科学：食品储藏及加工条件优化，食品组分及品质鉴定，功能性食品开发，食品安全监检测等。转录组是特定发育阶段或生理条件下细胞内的完整转录信息的汇合，表示了基因表达的中间状态。单细胞转录组学研究内容