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哈尔滨非靶向代谢组学

来源: 发布时间:2022-04-23

药物代谢和代谢组学区别:代谢组学与药物代谢不同是它关注的对象不是外源性的药物而是生物体本身就有的内源性代谢物。这些代谢物是糖,脂肪,蛋白质,核酸,胆汁酸等等代谢得到的。还有共生菌代谢的,是一个庞大的混合物。目的是通过样本的对比,发现潜在标志物,指导疾病早期诊断甚至基因水平的研究。而药物代谢的目标是只要只要追踪到这种药物分子在体内变化就好,相当具有靶向性,因此使用的技术手段就是LC-MS。检测药物的中间体,和具体的药效,药代动的效应。代谢组学的概念来源于代谢组,代谢组是指某一生物或细胞在一特定生理时期内所有的低分子量代谢产物。哈尔滨非靶向代谢组学

代谢组学的研究领域有哪些?1、疾病机制研究;2、疾病诊断与防治;3、新药筛选和开发;4、药物作用机制的研究;5、药物毒性评价;6、植物的细胞代谢组学研究;7、微生物代谢组学研究。代谢组学的研究方法:代谢组学的研究方法与蛋白质组学的方法类似,通常有两种方法。一种方法称作代谢物指纹分析,采用液相色谱-质谱联用(LC-MS)的方法,比较不同血样中各自的代谢产物以确定其中所有的代谢产物。从本质上来说,代谢指纹分析涉及比较不同个体中代谢产物的质谱峰,了解不同化合物的结构,建立一套完备的识别这些不同化合物特征的分析方法。另一种方法是代谢轮廓分析,研究人员假定了一条特定的代谢途径,并对此进行更深入的研究。广东非靶向代谢组学定量分析代谢组学着重研究的是生物整体、组织代谢途径及其所受内在或者外在因素的影响及随时间变化的规律。

代谢组学技术介绍:代谢组学技术(Metabolomics) 是基因时代发展起来的系统生物学新技术,以生物体内所有代谢产物为研究对象,其主要目标是定性定量研究代谢物与机体生理病理变化之间的关系。代谢物的变化与细胞所处内外环境密切相关。与基因组学和蛋白质组学相比,代谢组学提供了一种更加直接的生理状态检测方式。就研究方法而言,代谢组学主要包括靶向(Targeted)代谢组学和非靶向(Untargeted)代谢组学两部分。非靶向代谢组学是针对一定生理状态下的全代谢组学,一目了然地发现差异性代谢物,其优势在于全方面性。而靶向代谢组学则是针对具体代谢物,以标准品为参照,进行相对的定量分析,具有更好的灵敏度和准确度。随着分辨率和扫描速度的提升,高分辨质谱仪已经应用到不同疾病的代谢组学中。可分析血浆、血清、尿液、唾液、以及细胞和组织提取液等多种样本。

代谢组学样本收集植物组织:果实、种子:1)对于含水量高、体积较大的果实(番茄、西瓜、苹果等)需要先将样品分成“均匀”的小块(≈ 200 mg/样本)分装至2 mL离心管中,标号后迅速放入液氮中冷冻处理至少15 min。2)对于细小的颗粒种子(拟南芥种子、谷物种子等),可以先将同一组的植株种子混匀后再分装(≈ 200 mg/样本)至离心管中,标号后迅速放入液氮中冷冻处理至少15 min。3)对于要求对整个果实进行提取的(整粒葡萄等),需要把果实装在50 mL离心管/自封袋中,标号后迅速放入液氮中冷冻处理至少15min,-80 ℃冻存,干冰寄送。代谢组学技术是基因时代发展起来的系统生物学新技术。

代谢组学检测的手段有哪些?主要技术手段是核磁共振(NMR ),液-质联用(LC-MS),气-质联用(GC-MS),色谱(HPLC,GC)等。通过检测一系列样品的谱图,再结合化学模式识别方法,可以判断出生物体的病理生理状态,基因的功能,药物的毒性和药效等,并有可能找出与之相关的生物标志物(biomarker)。代谢组学可以检测哪些样品?代谢组学主要研究的是作为各种代谢路径的底物和产物的小分子代谢物(MW<1000)。其样品主要是尿液,血浆或血清,唾液,以及细胞和组织的提取液。我们也做过植物,微生物提取物,脑脊液昆虫血淋巴,羊水,卵泡液,膝盖滑液,眼泪,粪便及肠道内容物提取液等。代谢组学研究已经能诊断出一些代谢类疾病,如糖尿病、肥胖症,代谢综合症。广东非靶向代谢组学定量分析

代谢组学的发展很迅速。哈尔滨非靶向代谢组学

靶向代谢组学分析成功的关键因素是准确度、高通量和可靠性。靶向代谢组学鉴定一般采用 GC/MS 系统的选择性离子监测 (SIM),或在三重串联四极杆 LC/MS 系统上用多反应离子监测 (MRM) 进行靶向 MS/MS。SIM 比全扫描图谱采集具有更高的灵敏度,在单四极杆质谱中,这种灵敏度增强的原因是延长了所选择离子的采集时间。因为监测的是一个很小的质量窗口,所以质量色谱图只表示对极为特定质量的检测。在大多数情况下,灵敏度可以提高 10 倍。MRM 是进行质谱定量的选择方法,与 SIM 相比更为灵敏、更加特异。可以产生独特的碎片离子,可对非常复杂基质中的目标化合物进行监测和定量。哈尔滨非靶向代谢组学

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