RNA-Seq转录组学技术优势：相比基因芯片和标记的碱基序列的测序方法，RNA-seq具有一定的优越性。与基因芯片相比，RNA-Seq不只可以在更高的分辨率下用来测量基因的表达水平情况，还可以揭示未知的转录组和拼接亚型，并为选择性拼接亚型提供定量分析。相对于传统的芯片杂交平台，转录组测序无需预先针对已知序列设计探针，即可对任意物种的整体转录活动进行检测，提供更精确的数字化信号、更高的检测通量以及更普遍的检测范围，是目前深入研究复杂性转录组的强大工具。鉴于这些优势，RNA-Seq很快就被应用到关于瘤病相关研究的多个方面。转录组是干什么用的，和表达谱有什么区别？四川高通量转录组学质谱分析

RNA-Seq转录组学技术优势：相比基因芯片和标记的碱基序列的测序方法，RNA-seq具有一定的优越性。与基因芯片相比，RNA-Seq不只可以在更高的分辨率下用来测量基因的表达水平情况，还可以揭示未知的转录组和拼接亚型，并为选择性拼接亚型提供定量分析。转录组学(Transcriptomics)，是一门在真整体水平上研究细胞中基因转录的情况及转录调控规律的学科，从RNA水平研究基因的表达情况。转录组测序是通过二代测序平台快速全方面地获得某一物种特定细胞或组织在某一状态下的几乎所有的转录本及基因序列，可以用来研究基因表达量、基因功能、结构、可变剪接和预测新的转录本等等。四川高通量转录组学质谱分析转录学组测序可对任意物种的整体转录活动进行检测。

全转录组学测序技术优势：文库优化：针对不同长度的序列采用两种文库构建方法，采用去核糖体的链特异性文库可以获得mRNA、lncRNA和circRNA的序列信息。数据全：全转录组测序完成后可获取4类主要RNA（miRNA，mRNA，lncRNA，circRNA）数据，可对这些数据进行标准分析及整合分析。关联全：通过对mRNA/miRNA/lncRNA/circRN序列测定及后续分析，深入开展全转录组调控网络(ceRNA网络)分析。样本类型：细胞，组织，体液、血清、血浆、全血，总RNA等。建议总RNA起始量：＞15μg，浓度≥200ng/μL）。

转录组学研究的方法：在早期，由于测序价格昂贵、基因序列数目有限，转录组学研究者只能进行极少数特定基因的结构功能分析和表达研究。近十几年，分子生物学技术的快速发展使高通量分析成为可能，这为真正意义上的转录组学的研究奠定了基础。这些高通量研究方法主要可以分为两类：一类是基于这类方法包括表达序列标签技术、基因表达系列分析技术、大规模平行测序技术、RNA测序技术其中，Microarray和EST技术是较早发展起来的先驱技术，SAGE、MPSS和RNA-sea是高通量测序条件下的转录组学研究方法转录组学研究有助于了解特定生命过程中相关基因的整体表达情况，进而从转录水平初步揭示该生命过程的代谢网络及其调控机理。转录组具有时间特异性的特点。

全转录组测序为什么需要构建两个文库？全转录组测序需要构建2个测序文库，一个小RNA文库和一个去除核糖体RNA的链特异性文库，然后分别上机测序。小RNA长度较短，一般小于50nt，采用测序策略为50SE。其他三类RNA序列一般大于200，通常在1000以上，可达几万，通过片段化构建150PE测序文库。然后小RNA文库可以获得miRNA序列信息，去核糖体的链特异性文库可以获得mRNA、lncRNA和circRNA的序列信息。转录组学即特定细胞在某一功能状态下转录出来的所有RNA的总和，包括mRNA和非编码RNA。转录组学测序必须做生物学重复么？浙江外泌体转录组学研究

转录组学即一个活细胞所能转录出来的所有RNA的总和。四川高通量转录组学质谱分析

RNA-seq转录组学技术优势有：1、可以直接测定每个转录本片段序列、单核苷酸分辨率的准确度;2、灵敏度高，可以检测细胞中少至几个拷贝的稀有转录本;3、可以对任意物种进行全基因组分析，能够检测未知基因，发现新的转录本，并准确地识别可变剪切位点及cSNP，UTR区域;4、检测范围广，能够同时鉴定和定量稀有转录本和正常转录本。RNA-seq转录组学是需要生物学重复的，至少需要两次生物学重复，3次以上的生物学重复更好。以3个重复为例，加上对照的三个生物学重复，一次RNA-seq需要6个样本。四川高通量转录组学质谱分析