蛋白质组研究:蛋白质组研究是指系统研究在某一特定时间、特定条件下,某一种特定组织中的所有蛋白质。对蛋白质的研究也不只是局限于蛋白质的氨基酸序列,而是包括了蛋白质的表达量,蛋白质活性,被修饰的状况以及和其他蛋白质或分子的相互作用情况、亚细胞定位和三维结构。这些信息对于全方面了解复杂的生物系统有着重要的意义。因此,蛋白质组学研究目标是大规模、系统化地研究蛋白质的特性,以期望在蛋白质水平上解释控制复杂的生命活动的分子网络。蛋白质组学将成为寻找疾病分子标记和药物靶标比较有效的方法之一。湖北定量N糖基化蛋白质组学一般流程
蛋白质组结果一般需要做哪些方面的生物信息学分析?目前一般文献中的分析主要为维恩图分析、热图分析、火山图分析、层次聚类分析、蛋白质功能分析(GO分类为主)、蛋白质所属代谢通路富集分析(基于KEGG的pathway)、差异蛋白互作网络构建、转录因子预测等方面。其它一些比较特异的高级分析包括多组数据关联分析、多pathway延伸分析、磷酸蛋白激酶预测分析、互作网络及生物调控模型构建分析。定量蛋白质组学技术主要分为标记(label)和非标记(labelfree)定量策略,标记策略又分为体内标记和体外标记两种。细胞内蛋白质组丰度的动态变化对各种生命过程有重要影响。例如在许多疾病的发生和发展进程中,常常伴随着某些蛋白质的表达异常。定量蛋白质组学就是把一个基因组表达的全部蛋白质或一个复杂的混合体系中所有的蛋白质进行精确的定量和鉴定。北京TMT/iTRAQ标记定量蛋白质组学分析研究蛋白质组学在医疗和健康方面有什么应用呢?
蛋白质组学技术:蛋白质组学技术的发展已经成为现代的生物技术快速发展的重要支撑,并将带领生物技术取得关键性的突破。为帮助生命科学领域的工作者全方面掌握蛋白质组学的技术与方法、实验难点与关键点、研究前沿与热点,包括双向凝胶电泳、等电聚焦、生物质谱分析及非凝胶技术。双向凝胶电泳:双向凝胶电泳的原理是第1向基于蛋白质的等电点不同用等电聚焦分离,第二向则按分子量的不同用SDS-PAGE分离,把复杂蛋白混合物中的蛋白质在二维平面上分开。由于双向电泳技术在蛋白质组与医学研究中所处的重要位置,它可用于蛋白质转录及转录后修饰研究,蛋白质组的比较和蛋白质间的相互作用,细胞分化凋亡研究,致病机制及耐药机制的研究,疗效监测,新药开发,病症研究,蛋白纯度检查,小量蛋白纯化,新替代疫苗的研制等许多方面。近年来经过多方面改进已成为研究蛋白质组的比较有使用价值的关键方法。
定量蛋白质组学技术:定量蛋白质组学是蛋白质组研究的重要内容,通过对基因表达产物——蛋白质的定量分析,以了解基因在不同的生理、病理和逆境条件下的表达情况。近年来,随着非凝胶技术的发展,蛋白质组学(“Shotgun”proteomics)技术,特别是多维蛋白质鉴定(MultidimensionalProteinIdentification,MudPIT)已成为研究复杂生物样本中大规模蛋白质表达和定性和定量分析的强有力工具。蛋白质组学在医学的研究应用:蛋白质组学是研究细胞、组织或生物体中蛋白质组成、定位、变化及其相互作用规律的科学。蛋白质组学技术的本质(从分析化学角度来看),就是对蛋白质的定性定量分析。
iTRAQ/TMT 标记定量蛋白质组学:iTRAQ 和 TMT 技术采用多种同位素标记,可与氨基反应实现连接,实现多个样本蛋白组的定性与定量。技术优点:适用范围广、高通量、结果可靠。灵敏度高,分离能力强,自动化程度高。 Label Free 非标记定量蛋白质组学:Label Free 技术不依赖同位素标记,可通过液质联用对蛋白质酶解肽段进行分析,分析大规模鉴定蛋白质时所产生的质谱数据,对被检测到的离子峰强度进行积分,以积分面积进行相对定量。蛋白质组学,指对某一基因组所表达的所有蛋白质及其特征进行大规模、系统化地研究,以期望在蛋白质水平上解释控制复杂的生命活动的分子网络。蛋白质组学的研究是生命科学进入后基因时代的特征。广东蛋白质定量组学价钱
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蛋白质组学技术:生物质谱:生物质谱技术是蛋白质组学研究中比较重要的鉴定技术,其基本原理是样品分子离子化后,根据不同离子之间的荷质比(M/E)的差异来分离并确定分子量。对于经过双向电泳分离的目标蛋白质用胰蛋白酶酶解(水解Lys或Arg的-C端形成的肽键)成肽段,对这些肽段用质谱进行鉴定与分析。目前常用的质谱包括两种:基质辅助激光解吸电离-飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)和电喷雾质谱(ESI-MS)。蛋白质组的研究不但能为生命活动规律提供物质基础,也能为众多种疾病机理的阐明及攻克提供理论根据和解决途径。湖北定量N糖基化蛋白质组学一般流程