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南京糖基化修饰蛋白质组学主要技术

来源: 发布时间:2022-05-27

乙酰化修饰蛋白组学实验流程:1)组织/细胞破碎,提取蛋白质;2)蛋白酶解成多肽片段;3)对多肽片段进行 iTRAQ 标记;4)高效特异性乙酰化抗体富集乙酰化修饰肽段;5)使用 LC-MS/MS 对富集的乙酰化肽段进行序列分析;5)数据分析,比对不同样本中蛋白乙酰化修饰水平差异,并对产生变化的生物学意义进行解释。乙酰化是一个普遍而重要的蛋白质翻译后修饰,不仅集中在对细胞染色体结构的影响以及对核内转录调控因子方面,而且还影响参与细胞周期和新陈代谢、肌动蛋白聚合控制及多聚谷氨酰胺疾病等方方面面。乙酰化不仅存在于真核细胞中,而且越来越多的证据也表明乙酰化同样影响许多原核细胞的生理生化过程。蛋白质糖基化修饰组学技术怎么确定位点?南京糖基化修饰蛋白质组学主要技术

泛素化修饰蛋白质组学介绍: 蛋白质泛素化修饰(Ubiquitylation)是一种常见的蛋白质翻译后修饰,是指一个或多个泛素分子(Ubiquitin,由76个氨基酸组成的多肽)在一系列特殊的酶作用下,将细胞内的蛋白质分类,从中选出靶蛋白分子,并对靶蛋白进行特异性修饰的过程。泛素化修饰是一种重要的翻译后修饰,泛素-蛋白酶体系统介导了真核生物80%~85%的蛋白质降解。除参与蛋白质降解之外,泛素化修饰还参与了细胞周期、增殖、细胞凋亡、分化、转录调控、基因表达、转录调节、信号传递、损伤修复、炎症免疫等几乎一切生命活动的调控。广州棕榈酰化修饰蛋白质组学研究蛋白质翻译后修饰PTMs通常包括磷酸化,糖基化,泛素化,亚硝基化,甲基化,乙酰化,脂质化和蛋白水解。

蛋白质翻译后修饰的重要性:翻译后修饰可以发生在蛋白质生命周期的任何阶段。例如,许多蛋白质在翻译完成后不久就被修饰,以介导适当的蛋白质折叠或稳定,或将新生蛋白质引导到不同的细胞区室(例如,细胞核、膜)。折叠和定位完成后发生其他修饰,以刺激或灭活催化活性或以其他方式影响蛋白质的生物活性。蛋白质也与靶向降解蛋白质的标签共价连接。除了单一的修饰外,蛋白质通常还通过翻译后切割和通过蛋白质成熟的分步机制增加功能基团的组合进行修饰。分析蛋白质及其翻译后修饰对于心脏病、神经退行性疾病和糖尿病的研究尤为重要。PTMs 的特征,虽然具有挑战性,但提供了对病因学过程下的细胞功能的无价的洞察。在技术上,研究翻译后修饰蛋白的主要挑战是开发特异性的检测和纯化方法。幸运的是,这些技术障碍正在用各种新的和精炼的蛋白质组学技术来克服。

蛋白质翻译后修饰组学技术原理:首先将蛋白样本酶解成肽段混合物,然后使用液相色谱对酶解后的肽段混合物进行组分分离以降低样本复杂程度,然后通过高质量的修饰类抗体和生物材料对修饰肽段进行富集,之后上样至液相色谱 - 串联质谱中进行分析,通过相应的数据库检索匹配,一次可鉴定成百上千个修饰位点。蛋白质磷酸化位点分析样品经酶解后,用 TiO2 微球对磷酸化肽段进行富集,富集后的产物由质谱分析,并通过软件完成数据检索。琥珀酰化修饰蛋白质组技术特点:采用主流抗体亲和富集方法,特异性高,富集效率好。蛋白质的翻译后修饰是一个复杂的过程。

蛋白质翻译后修饰加入的官能团反应有:1、乙酰化——通常于蛋白质的N末端加入乙酰。2、烷基化——加入如甲基或乙基等烷基。3、甲基化——烷基化中常见的一种,在赖氨酸、精氨酸等的侧链氨基上加入甲基。4、生物素化——用生物素附加物令保存的赖氨酸酰化。5、谷氨酸化——在谷氨酸与导管素及其他蛋白质之间建立共价键。6、甘氨酸化——在一个至超过40种甘氨酸与导管素的C末端建立共价键。7、糖化——将糖基加入天冬酰胺、羟离氨酸、丝氨酸或苏氨酸,形成糖蛋白。8、异戊二烯化——加入如法呢醇及四异戊二烯等异戊二烯。9、硫辛酸化——附着硫辛酸的功能性。大多数翻译后修饰蛋白以低化学计量和丰度存在,这限制了在分析全细胞裂解液时对其的检测。广州棕榈酰化修饰蛋白质组学研究

泛素化修饰蛋白组学是一种重要的翻译后修饰。南京糖基化修饰蛋白质组学主要技术

翻译后修饰蛋白组分析:蛋白质翻译后修饰是影响蛋白质功能并调节整个细胞过程的重要方式,几乎在每个细胞过程中都是不可或缺的。分析和鉴定翻译后修饰蛋白质对揭示蛋白质的功能和深入了解各种生理现象具有重要意义。大多数翻译后修饰蛋白以低化学计量和丰度存在,这限制了在分析全细胞裂解液时对其的检测。蛋白质是各种细胞功能比较重要的执行者,其功能正常与否决定着生命活动能否有序、高效的进行,而其中翻译后修饰起着至关重要的作用。翻译后修饰改变了蛋白质中不同氨基酸残基上的生物化学官能团,进而改变其化学性质或结构,使得蛋白质具有更为复杂的结构和更为完善的功能,实现更为精细的调节。蛋白质的翻译后修饰过程极其复杂,已知的翻译后修饰种类有20多种。但其中较为常见的主要是磷酸化、泛素化、SUMO化、酰(含乙酰)化、甲基化以及糖基化。南京糖基化修饰蛋白质组学主要技术

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