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非靶代谢组学研究：2022年03月,欧易/鹿明生物合作客户重庆医科大学附属第二医院消化内科周智航团队在International Journal of Biological Sciences期刊发表的题为 “Enhanced pentose phosphate pathway activity promotes pancreatic ductal adenocarcinoma progression via activating YAP/MMP1 axis under chronic acidosis”的研究成果，通过采用非靶代谢组学和基因表达芯片，发现了适应酸性微环境的胰腺导管腺* (P...

代谢组学+转录组学，中文标题：基于代谢组学分析的百菌清、多菌灵、咪鲜胺及其二元和三元混合物对斑马鱼胚胎和仔鱼的健康风险研究对象：斑马鱼胚胎和仔鱼发表期刊：JournalofHazardousMaterials影响因子：10.588运用生物技术：代谢组学环境毒理学浙江省农科院农产品质量营养所风险评估研究团队联合浙江工业大学在农药联合暴露效应机制研究中取得新进展，作者：杨桂玲，王彦华，李健，王豆，鲍志伟，王强（通讯作者），靳远详（共同通讯作者），在JournalofHazardousMaterials期刊发表的文章，通过代谢组学+转录组学的多组学整合分析技术来阐明几种杀菌剂或其混合物在斑马鱼早期发...

GC-MS非靶向代谢组研究，随着纳米材料的产业化,各种形式的纳米材料将以不同途径进入人们的生活,纳米材料的生物安全性问题正受到世界各国科学家的***关注，本篇为2020年2月，南京大学赵丽娟课题组在Environmental Science & Technology杂志发表题为“Silver Nanoparticles Alter Soil Microbial Community Compositions and Metabolite Profiles in Unplanted and Cucumber-planted Soil”的研究论文。该研究运用16S rRNA基因测序、GC-MS非靶向...

LC-MS靶向代谢组学研究本篇文章通过LC-MS靶向代谢组学和16S rRNA基因序列分析，探究谷物在加工传统饮料ogi过程中******的减少和细菌群落的动态变化。同时，从粮食安全方面考虑，谷物的污染水平低、较安全，又优于玉米，可以代替受******污染的玉米品种。欧易/鹿明生物推出的16s+代谢组学的多层组学研究思路继本篇文章前已先后助力了浙江工业大学、中国农科院、青岛农业大学等在微生物一区顶刊Microbiome、医学一区顶刊GUT发表文章。项目文章PBP | 浙江工业大学傅正伟运用GC-MS非靶向代谢组学和16S探究水稻根际微生物群落影响项目文章 | 恭喜中国农科院及青岛农业大学团队继...

非靶向代谢组学研究：对于代谢物分析，作者对非靶代谢组学测定，共检测到4,346种代谢物。根据所有检测到的代谢物的投影中变量重要性（VIP）>1和p<0.05的筛选标准，在不同的比较组***研究了961种差异累积代谢物（DAM）（表1）。在A果实(AF)与B果实(BF)的相同成熟阶段，发现S3的DAM比S1和S2更丰富，这意味着DAM的主要变化发生在S3。随后，利用京都基因和基因组百科全书（KEGG）富集分析进一步了解与两个东方甜瓜品种相关的生物学机制。其中，参与蔗糖和有机酸代谢的代谢物在果实中的积累差异更大，包括“半乳糖代谢”、“磷酸戊糖途径”、“果糖和甘露糖代谢”、“亚油酸代谢”和“花生四烯...

LC-MS非靶向代谢组学研究方法，2021年11月，宁波大学海洋科学学院王春琳团队在Frontiers in Marine Science期刊发表了题为“Metabolic Changes in Scylla paramamosain During Adaptation to an Acute Decrease in Salinity”的研究成果，通过LC-MS非靶向代谢组学研究方法，发现了氨基酸和能量代谢是参与青蟹适应盐度变化的主要因素，而脂质代谢物起辅助作用。中文标题：青蟹在适应盐度急剧下降过程中的代谢变化研究对象：青蟹发表期刊：FrontiersinMarineScience影响因子：4...

GC-MS非靶向代谢组学和转录组学研究方法，2021年11月，上海交通大学医学院附属新华医院冯丽萍教授课题组在Science of the Total Environment期刊发表了题为“Transcriptomics integrated with metabolomics reveals the effect of Bisphenol F (BPF) exposure on intestinal inflflammation ”的研究成果，通过GC-MS非靶向代谢组学和转录组学研究方法，发现了BPF暴露的肠道毒性的特征，探究了可能的发病机理。中文标题：转录组学结合代谢组学揭示了双酚F(...

有机酸靶向代谢组学研究：中文标题：通过代谢和转录组分析的综合分析鉴定控制东方甜瓜果实发育过程中可溶性糖和有机酸代谢的关键基因网络研究对象：甜瓜发表期刊：Front.PlantSci.影响因子：5.753发表时间：2022年5月12日合作单位:甘肃省农业科学院蔬菜研究所，中国农业大学园艺学院运用生物技术：非靶向代谢组学（由鹿明生物提供技术支持）、转录组学（由欧易生物提供技术支持）在本研究中，通过***的转录组分析和代谢物分析，作者发现东方甜瓜品种'甜宝'（A）的果实含糖量高，'小翠瓜'（B）的果实含糖量低，并同时在不同的发展阶段进行了比较。研究有助于阐明与甜瓜中糖和有机酸代谢相关的基因的动态和差...

GC-MS非靶向代谢组，标题：银纳米颗粒改变种植和未种植黄瓜土壤中的微生物群落组成和代谢物谱期刊：EnvironmentalScience&Technology影响因子：9.028发表时间：2020年2月合作单位：南京大学环境学院运用生物技术：16SrRNA基因测序、GC-MS非靶向代谢组（由鹿明生物提供技术支持）。银纳米颗粒（AgNPs）是使用*****的工程纳米材料之一，泄露可能导致颗粒在土壤中积累，并对环境造成未知风险。有报告指出AgNPs可能通过影响根系分泌物间接对微生物群落功能和基因组多样性产生***影响，但对其机理了解甚少。土壤代谢物可作为土壤微生物群落变化的表型特征，但当前有关N...

**靶向代谢组学研究，中文标题：代谢组学分析揭示了COVID-19新的发展特征研究对象：****患者发表期刊：EuropeanRespiratoryJournal影响因子：16.671发表时间：2021.7.21运用生物技术：LC-MS非靶代谢组学+靶向代谢组学，****已经***了1.6亿多人，并导致全世界数以百万的人死亡；至少部分原因是它的病理生理尚不清楚。所以，识别****的潜在分子机制对于战胜**是至关重要的。此外，代谢物通过在疾病进展过程中获得***的病理生理学意义来反映个体的疾病进展。因此，中国广州多家研究机构的科研人员使用了非靶向和靶向代谢组学分析对****患者所有阶段血清的代谢...

尿液代谢组学研究案例，空气中PM和生物气溶胶共同暴露的尿液代谢组学特征采用LC-MS+GC-MS双平台代谢组学方法对尿液样品进行分析，其中GC-MS检测102种代谢物，LC-MS检测到1271种。作者通过使用亚组来分析差异代谢物是否具有性别或季节性，结果表明性别和季节对本研究的结果没有明显的混杂影响。差异分析表明，Pu1和Po1之间的差异代谢物数量大于Po1和C之间的差异，LC-MS分析比GC-MS分析检测到更多的差异代谢物，体现出不同平台的检测特点。为了确定尿液中与空气污染PM暴露相关的代谢生物标志物，使用综合分析获得候选差异代谢物，其中C-Po1和Po1-Pu1比较中的重叠差异代谢物作为短...

非靶向代谢组学研究：对于代谢物分析，作者对非靶代谢组学测定，共检测到4,346种代谢物。根据所有检测到的代谢物的投影中变量重要性（VIP）>1和p<0.05的筛选标准，在不同的比较组***研究了961种差异累积代谢物（DAM）（表1）。在A果实(AF)与B果实(BF)的相同成熟阶段，发现S3的DAM比S1和S2更丰富，这意味着DAM的主要变化发生在S3。随后，利用京都基因和基因组百科全书（KEGG）富集分析进一步了解与两个东方甜瓜品种相关的生物学机制。其中，参与蔗糖和有机酸代谢的代谢物在果实中的积累差异更大，包括“半乳糖代谢”、“磷酸戊糖途径”、“果糖和甘露糖代谢”、“亚油酸代谢”和“花生四烯...

LC-MS靶向代谢组学研究本篇文章通过LC-MS靶向代谢组学和16S rRNA基因序列分析，探究谷物在加工传统饮料ogi过程中******的减少和细菌群落的动态变化。同时，从粮食安全方面考虑，谷物的污染水平低、较安全，又优于玉米，可以代替受******污染的玉米品种。欧易/鹿明生物推出的16s+代谢组学的多层组学研究思路继本篇文章前已先后助力了浙江工业大学、中国农科院、青岛农业大学等在微生物一区顶刊Microbiome、医学一区顶刊GUT发表文章。项目文章PBP | 浙江工业大学傅正伟运用GC-MS非靶向代谢组学和16S探究水稻根际微生物群落影响项目文章 | 恭喜中国农科院及青岛农业大学团队继...

土壤代谢物可以间接反映微生物代谢过程的变化，使用基于GC-MS的非靶向代谢组学，在土壤样品***鉴定272种代谢物并对其进行非靶向代谢组学定量，定量结果表明AgNPs暴露***改变了土壤代谢物的分布。通过参数VIP>1.5，在土壤中鉴定出20种具有重要变化的代谢物（图3I），除少数几个代谢物上调，大多数代谢物减少，表明AgNPs暴露通?；岫酝寥牢⑸锏拇徊好嬗跋?。土壤代谢组学可以揭示土壤微生物群落如何在分子水平上应对AgNPs并作出反应，包括毒性机制和***策略。代谢组学热图聚类分析 火山图 散点图如何绘制。北京代谢组学药物靶点代谢组学+转录组学研究：2022年2月，中国海洋大学食品科学...

土壤代谢物可以间接反映微生物代谢过程的变化，使用基于GC-MS的非靶向代谢组学，在土壤样品***鉴定272种代谢物并对其进行非靶向代谢组学定量，定量结果表明AgNPs暴露***改变了土壤代谢物的分布。通过参数VIP>1.5，在土壤中鉴定出20种具有重要变化的代谢物（图3I），除少数几个代谢物上调，大多数代谢物减少，表明AgNPs暴露通?；岫酝寥牢⑸锏拇徊好嬗跋?。土壤代谢组学可以揭示土壤微生物群落如何在分子水平上应对AgNPs并作出反应，包括毒性机制和***策略。常用的代谢组学相关数据库有人类代谢组数据库KEGG数据库、Reactome数据库。浙江植物代谢组学的研究GC-MS非靶向代谢组...

代谢组学+转录组学研究：2022年2月，中国海洋大学食品科学与工程学院刘尊英教授课题组在《Foods》期刊发表的题为“Dissecting of the AI-2/LuxS Mediated Growth Characteristics and Bacteriostatic Ability of Lactiplantibacillus plantarum SS-128 by Integration of Transcriptomics and Metabolomics”的研究成果，通过转录组学和代谢组学等研究方法，发现植物乳孢杆菌可以通过AI-2/luxs介导的群体感应(QS)系统来调节其生长...

粪便LC-MS代谢组学研究方法，2022年，复旦大学上海市第五人民医院创伤急危重症医学科唐建国教授课题组在FrontiersinCellularandInfectionMicrobiology期刊发表的题为“DiallylDisulfide(DADS)AmelioratesIntestinalCandidaalbicansInfectionbyModulatingtheGutmicrobiotaandMetabolitesandProvidingIntestinalProtectioninMice”的研究成果，通过粪便微生物16SrRNA测序和粪便LC-MS代谢组学研究方法，发现了DADS**...

代谢组学研究：浙江省农科院农产品质量营养所风险评估研究团队联合浙江工业大学在农药联合暴露效应机制研究中取得新进展，作者：杨桂玲，王彦华，李健，王豆，鲍志伟，王强（通讯作者），靳远详（共同通讯作者），在Journal of Hazardous Materials期刊发表了题为“Health risks of chlorothalonil, carbendazim, prochloraz, their binary and ternary mixtures on embryonic and larval zebrafish based on metabolomics analysis”的研究成果，...

本研究通过LC-MS和GC-MS双平台代谢组学研究方法，对92例样品5个时间点的尿液样品进行分析，分别找到了33种和155种与PM和生物气溶胶相关的差异标志物，结果揭示了年轻健康人在五个不同时间点的尿液代谢谱的动态变化，采用KEGG通路富集分析和时间序列分析确定了与短期共同暴露于空气中PM和生物气溶胶相关的几种潜在代谢物生物标志物，发现短期高浓度暴露于PM可能会导致代谢改变并降低应激***水平，这可能是与下丘脑-垂体-肾上腺和交感-肾上腺-髓质轴的***有关；而生物气溶胶剂则通过***系统对病理性成瘾有重要作用。其中尿液中的16-脱氢孕酮可能是PM暴露的潜在生物标志物；4-羟基苯乙醇可能是生物...

代谢组学经典研究：本篇小鹿将为各位看官推荐4篇使用代谢组学的经典研究，***篇文章运用LC-MS/GC-MS双平台代谢组学探究番茄果实成熟过程中的代谢变化。第二篇文章运用16S rRNA测序+代谢组学技术研究不同分子量的PE颗粒干扰玉米生长和根际微环境的机制。第三篇文章运用GC-MS顶空代谢组学探究新等位基因系和野生型的成熟种子中发现了几种不同的挥发性化合物。第四篇文章运用GC-MS非靶向代谢组学技术对对全氟辛酸（PFOA）暴露土壤栽培的黄瓜组织代谢途径变化进行了研究。非靶向代谢组学数据分析 靶向代谢组学数据分析。上海代谢组学 分析LC-MS+GC-MS双平台代谢组学研究案例，中文标题：使用无...

代谢组学经典研究：本篇小鹿将为各位看官推荐4篇使用代谢组学的经典研究，***篇文章运用LC-MS/GC-MS双平台代谢组学探究番茄果实成熟过程中的代谢变化。第二篇文章运用16S rRNA测序+代谢组学技术研究不同分子量的PE颗粒干扰玉米生长和根际微环境的机制。第三篇文章运用GC-MS顶空代谢组学探究新等位基因系和野生型的成熟种子中发现了几种不同的挥发性化合物。第四篇文章运用GC-MS非靶向代谢组学技术对对全氟辛酸（PFOA）暴露土壤栽培的黄瓜组织代谢途径变化进行了研究。代谢组学——寻找代谢物与生理病理变化的相对关系研究方式。上海代谢组学的数据特点LC-MS非靶向代谢组学研究方法，2021年11...

双平台代谢组学研究，2022年02月，中国中医科学院广安门医院李敏教授课题组在Biomedicine & Pharmacotherapy发表的题为 “Yiqi Tongluo Fang could preventive and delayed development and formation of diabetic retinopathy through antioxidant and anti-inflammatory effects ”的研究成果，发现了***通络方可有效地防治糖尿病并发症形成与发展，探究了***通络方防治糖尿病视网膜病变的作用机制，***通络方可改善糖尿病大鼠视网膜组织...

非靶向代谢组学研究：对于代谢物分析，作者对非靶代谢组学测定，共检测到4,346种代谢物。根据所有检测到的代谢物的投影中变量重要性（VIP）>1和p<0.05的筛选标准，在不同的比较组***研究了961种差异累积代谢物（DAM）（表1）。在A果实(AF)与B果实(BF)的相同成熟阶段，发现S3的DAM比S1和S2更丰富，这意味着DAM的主要变化发生在S3。随后，利用京都基因和基因组百科全书（KEGG）富集分析进一步了解与两个东方甜瓜品种相关的生物学机制。其中，参与蔗糖和有机酸代谢的代谢物在果实中的积累差异更大，包括“半乳糖代谢”、“磷酸戊糖途径”、“果糖和甘露糖代谢”、“亚油酸代谢”和“花生四烯...

土壤代谢组学：银纳米颗粒（AgNPs）是使用*****的工程纳米材料之一，泄露可能导致颗粒在土壤中积累，并对环境造成未知风险。有报告指出AgNPs可能通过影响根系分泌物间接对微生物群落功能和基因组多样性产生***影响，但对其机理了解甚少。土壤代谢物可作为土壤微生物群落变化的表型特征，但当前有关NPs暴露对土壤微生物群落影响的研究不包括对土壤代谢产物的分析。16S rRNA基因序列可以提供改变的土壤微生物群相关信息，鉴于它们的已知功能，人们可以对土壤生物化学的变化提出合理假设。本文作者利用16S rRNA基因测序和非靶向代谢组学方法，研究了AgNPs对土壤微生物群落的长期影响?？占浯蛔檠?代谢...

**靶向代谢组学研究，中文标题：代谢组学分析揭示了COVID-19新的发展特征研究对象：****患者发表期刊：EuropeanRespiratoryJournal影响因子：16.671发表时间：2021.7.21运用生物技术：LC-MS非靶代谢组学+靶向代谢组学，****已经***了1.6亿多人，并导致全世界数以百万的人死亡；至少部分原因是它的病理生理尚不清楚。所以，识别****的潜在分子机制对于战胜**是至关重要的。此外，代谢物通过在疾病进展过程中获得***的病理生理学意义来反映个体的疾病进展。因此，中国广州多家研究机构的科研人员使用了非靶向和靶向代谢组学分析对****患者所有阶段血清的代谢...

代谢组学数据提供了COVID-19患者各阶段循环代谢物特征的综合观点，并确定了葡萄糖代谢和尿素循环的代谢重编程是COVID-19的潜在病理机制。在****病程的不同阶段，靶向宿主代谢可能是一种可行的方法。非靶向代谢组学分析中，发现队列中的样品共鉴定出2466个代谢物峰，负离子模式631个、正离子模式下的1835个；通过筛选，鉴定出240种代谢物。轻症组的代谢物与正常组部分重合，而重症组和恢复组很容易区分(图1B)。240个代谢物中有193个与COVID-19***相关(图1C)。火山图显示了不同组代谢物与正常组相比上调下调的情况(图1D)；与正常组对比，***上调的代谢物：轻症组有48个，严重...

GC-MS非靶向代谢组研究，随着纳米材料的产业化,各种形式的纳米材料将以不同途径进入人们的生活,纳米材料的生物安全性问题正受到世界各国科学家的***关注，本篇为2020年2月，南京大学赵丽娟课题组在Environmental Science & Technology杂志发表题为“Silver Nanoparticles Alter Soil Microbial Community Compositions and Metabolite Profiles in Unplanted and Cucumber-planted Soil”的研究论文。该研究运用16S rRNA基因测序、GC-MS非靶向...

GC-MS非靶向代谢组：随着纳米材料的产业化,各种形式的纳米材料将以不同途径进入人们的生活,纳米材料的生物安全性问题正受到世界各国科学家的***关注，本篇为2020年2月，南京大学环境学院课题组在Environmental Science & Technology杂志（IF=9.028）发表题为“Silver Nanoparticles Alter Soil Microbial Community Compositions and Metabolite Profiles in Unplanted and Cucumber-planted Soil”的研究论文。该研究运用16S rRNA基因测序...

代谢组学研究：浓香型白酒（SFB）在窖泥窖内发酵过程中，获得了其特有的风味。窖泥中的微生物是产生风味酯的关键前提物。本篇为欧易/鹿明生物合作客户四川省农业科学院水稻高粱研究所（一作：刘茂柯）于2020年3月在微生物学专刊《mSystems》（IF=6.469）发表的题为“Structural and Functional Changes in Prokaryotic Communities in Artificial Pit Mud during Chinese Baijiu Production”的研究报道，该研究对酿造微生态系统进行了***16S rRNA测序，蛋白质组学和代谢组学联合分析...

粪便代谢组分析，中文标题：二烯丙基二硫化物(DADS)通过调节肠道微生物群和代谢物来?；ば∈蟪Φ兰案纳瓢咨钪榫?**研究对象：小鼠粪便发表期刊：FrontiersinCellularandInfectionMicrobiology影响因子：5.293发表时间：2022年1月7日合作单位：复旦大学上海市第五人民医院创伤急危重症医学科运用生物技术：粪便代谢组分析（由鹿明生物提供技术支持）、微生物16SrRNA测序。文章通过建立DSS 诱导的肠道白色念珠菌小鼠模型，模拟人类肠道******。一方面证实了白色念珠菌可以增强 DSS 结肠炎的严重程度，另一方面通过微生物组学和代谢组学等手段确认了 DA...