GC-MS非靶向代谢组学和转录组学研究方法，2021年11月，上海交通大学医学院附属新华医院冯丽萍教授课题组在Science of the Total Environment期刊发表了题为“Transcriptomics integrated with metabolomics reveals the effect of Bisphenol F (BPF) exposure on intestinal inflflammation ”的研究成果，通过GC-MS非靶向代谢组学和转录组学研究方法，发现了BPF暴露的肠道毒性的特征，探究了可能的发病机理。中文标题：转录组学结合代谢组学揭示了双酚F(BPF)暴露对肠道炎症的影响研究对象：人结肠粘膜上皮细胞系(NCM460)发表期刊：ScienceoftheTotalEnvironment影响因子：7.963发表时间：2021年11月合作单位：上海交通大学附属新华医院运用生物技术：GC-MS非靶向代谢组学（由鹿明生物提供技术支持）、转录组学、qRT-PCR专注代谢组学研究 欧易生物。上海代谢组学和脂质组学
非靶向代谢组学研究:利用番茄的自然变异确定番茄复合体中果实多酚的途径结构和代谢调控ExploitingNaturalVariationinTomatotoDefinePathwayStructureandMetabolicRegulationofFruitPolyphenolicsintheLycopersicumComplex研究对象：番茄组织发表期刊：MolecularPlant影响因子：13.164组学技术：LC-MS靶向代谢组学、GC-MS非靶代谢组(双平台代谢组学),本研究通过表征构成八种不同番茄多酚代谢网络的潜在生物合成和修饰反应，阐明了八种番茄复合体多酚生物合成的整个生物合成框架，并对相关代谢物和结构基因进行了详细注释，并运用LC-MS/GC-MS双平台代谢组学方法为辅助育种提供帮助。此外，番茄果实成熟过程中的代谢变化为今后基于遗传的代谢工程设计提供了研究方向，并为研究其他重要植物物种中特定的代谢物的功能提供了理论依据。上海代谢组学和脂质组学代谢组学研究技术与应用、代谢组学数据库。
代谢组学数据提供了COVID-19患者各阶段循环代谢物特征的综合观点，并确定了葡萄糖代谢和尿素循环的代谢重编程是COVID-19的潜在病理机制。在****病程的不同阶段，靶向宿主代谢可能是一种可行的方法。非靶向代谢组学分析中，发现队列中的样品共鉴定出2466个代谢物峰，负离子模式631个、正离子模式下的1835个；通过筛选，鉴定出240种代谢物。轻症组的代谢物与正常组部分重合，而重症组和恢复组很容易区分(图1B)。240个代谢物中有193个与COVID-19***相关(图1C)。火山图显示了不同组代谢物与正常组相比上调下调的情况(图1D)；与正常组对比，***上调的代谢物：轻症组有48个，严重组有59个，恢复组有64个；***下调的代谢物：轻症组有33个，重症组有29个，恢复组有34个。使用靶向代谢组学分析；首先根据发现队列中59名受试者的血清代谢物(4个样本因体积小而被排除)；定量到了199种代谢物。根据不同组的浓度，将199个代谢物分为16个簇；然后根据恢复组的代谢物是否恢复到正常水平将这些簇分为三组。
代谢组学研究：浓香型白酒（SFB）在窖泥窖内发酵过程中，获得了其特有的风味。窖泥中的微生物是产生风味酯的关键前提物。本篇为欧易/鹿明生物合作客户四川省农业科学院水稻高粱研究所（一作：刘茂柯）于2020年3月在微生物学专刊《mSystems》（IF=6.469）发表的题为“Structural and Functional Changes in Prokaryotic Communities in Artificial Pit Mud during Chinese Baijiu Production”的研究报道，该研究对酿造微生态系统进行了***16S rRNA测序，蛋白质组学和代谢组学联合分析。运用多组学方法能够更***地了解高质量浓香白酒生产过程中人工窖泥微生物群落发生的代谢过程变化，这将有助于进一步优化人工窖泥培养技术和改善浓香白酒的质量。**话代谢、代谢组学实验设计、数据解读分析、数据库介绍及使用流程。
非靶代谢组学研究：2022年03月,欧易/鹿明生物合作客户重庆医科大学附属第二医院消化内科周智航团队在International Journal of Biological Sciences期刊发表的题为 “Enhanced pentose phosphate pathway activity promotes pancreatic ductal adenocarcinoma progression via activating YAP/MMP1 axis under chronic acidosis”的研究成果，通过采用非靶代谢组学和基因表达芯片，发现了适应酸性微环境的胰腺导管腺* (PDAC)细胞具有更强的转移和增殖能力。
代谢组学显示适应酸性微环境的 PDAC 细胞中葡萄糖增加、糖酵解减少，而转录组学发现适应酸性微环境细胞中的差异表达基因主要为细胞外基质修饰和 Hippo 信号传导相关基因。MMP1 在在适应酸性微环境细胞中上调**为明显，实验验证了其由 YAP/TAZ 通路介导，而被 AMPK抑制。该研究确认了代谢重编程通过AMPK/ YAP /MMP1轴促进适应酸性微环境的 PDAC 细胞的增殖和转移。 代谢组学——寻找代谢物与生理病理变化的相对关系研究方式。北京药物代谢组学
代谢组学行业解决方案和技术服务流程。上海代谢组学和脂质组学
非靶向代谢组学研究：通过在三个成熟阶段收获两个东方甜瓜品种的果实作者使用非靶代谢组学联合转录组学发现可溶性糖和有机酸在转录组水平和代谢组水平的差异现象。这项研究运用多组学技术联合揭示了两个品种成熟过程中关键的代谢和转录特征。在本研究中，通过代谢和转录组分析的综合分析，研究了控制两个东方甜瓜品种'甜宝'和'小翠瓜'中糖和有机酸代谢的基因网络。筛选了与糖和有机酸代谢相关的关键代谢物和候选基因，并讨论了甜瓜品种甜度不同的可能解释。研究结果提高了对决定甜瓜发育和成熟过程中糖和有机酸积累和代谢的分子机制的理解。上海代谢组学和脂质组学
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