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北京什么是代谢组学

来源: 发布时间:2022-09-23

代谢组学+转录组学,中文标题:基于代谢组学分析的百菌清、多菌灵、咪鲜胺及其二元和三元混合物对斑马鱼胚胎和仔鱼的健康风险研究对象:斑马鱼胚胎和仔鱼发表期刊:JournalofHazardousMaterials影响因子:10.588运用生物技术:代谢组学环境毒理学浙江省农科院农产品质量营养所风险评估研究团队联合浙江工业大学在农药联合暴露效应机制研究中取得新进展,作者:杨桂玲,王彦华,李健,王豆,鲍志伟,王强(通讯作者),靳远详(共同通讯作者),在JournalofHazardousMaterials期刊发表的文章,通过代谢组学+转录组学的多组学整合分析技术来阐明几种杀菌剂或其混合物在斑马鱼早期发育阶段的复杂病理生理和毒性通路。研究认为获得的数据可以为不同类型杀菌剂及其混合物对水生生物的毒性提供理论依据。代谢组学热图聚类分析 火山图 散点图如何绘制。北京什么是代谢组学

非靶代谢组学研究:2022年03月,欧易/鹿明生物合作客户重庆医科大学附属第二医院消化内科周智航团队在International Journal of Biological Sciences期刊发表的题为 “Enhanced pentose phosphate pathway activity promotes pancreatic ductal adenocarcinoma progression via activating YAP/MMP1 axis under chronic acidosis”的研究成果,通过采用非靶代谢组学和基因表达芯片,发现了适应酸性微环境的胰腺导管腺* (PDAC)细胞具有更强的转移和增殖能力。


代谢组学显示适应酸性微环境的 PDAC 细胞中葡萄糖增加、糖酵解减少,而转录组学发现适应酸性微环境细胞中的差异表达基因主要为细胞外基质修饰和 Hippo 信号传导相关基因。MMP1 在在适应酸性微环境细胞中上调**为明显,实验验证了其由 YAP/TAZ 通路介导,而被 AMPK抑制。该研究确认了代谢重编程通过AMPK/ YAP /MMP1轴促进适应酸性微环境的 PDAC 细胞的增殖和转移。 浙江代谢组学 关联分析常用的代谢组学相关数据库有人类代谢组数据库KEGG数据库、Reactome数据库。

LC-MS非靶向代谢组学研究方法,2021年11月,宁波大学海洋科学学院王春琳团队在Frontiers in Marine Science期刊发表了题为“Metabolic Changes in Scylla paramamosain During Adaptation to an Acute Decrease in Salinity”的研究成果,通过LC-MS非靶向代谢组学研究方法,发现了氨基酸和能量代谢是参与青蟹适应盐度变化的主要因素,而脂质代谢物起辅助作用。中文标题:青蟹在适应盐度急剧下降过程中的代谢变化研究对象:青蟹发表期刊:FrontiersinMarineScience影响因子:4.912发表时间:2021年11月2日合作单位:宁波大学应用海洋生物技术教育部重点实验室运用生物技术:LC-MS非靶向代谢组(由鹿明生物提供技术支持)

LC-MS靶向代谢组+16S微生物多样性检测研究。题目:粪便微生物可以区分酒精性肝炎引起的酒精摄入量,但不能区分疾病的严重程度期刊:HepatologyIF=17.425研究思路:*样本类型:人粪便*检测平台:LC-MS靶向代谢组、16S微生物多样性检测为了表征酒精性肝炎有关的粪便微生物生态学,考察微生物组变化和疾病严重程度的关系,推断微生物生态学变化的功能相关性,本文作者将中度或重度酒精性肝炎患者(MAH和SAH)的粪便微生物组与健康(HC)和重度饮酒对照组(HDC)进行比较,通过16SrRNA基因测序鉴定微生物群分类,使用LC/MS平台测量粪便短链脂肪酸(SCFA)含量。重度饮酒患者与健康对照组相比、重度饮酒组与酒精性肝炎相比,均可以发现明显的微生物组特征分布。但微生物分类不能区分中度和重度酒精性肝炎。在酒精性肝炎患者中,粪便中短链脂肪酸与产生SCFA的微生物菌群均减少,可以推断出,酒精性肝炎患者的粪便微生物组有明显的变化,与酒精性肝炎的严重程度无关。代谢组学——研究对象大都是相对分子质量1000以内的小分子物质。

LC-MS+GC-MS双平台代谢组学研究案例,中文标题:***通络***通过***和抗氧化作用预防及延缓糖尿病视网膜病变发展的机制研究研究对象:大鼠发表期刊:Biomedicine&Pharmacotherapy影响因子:6.529发表时间:2022年2月合作单位:中国中医科学院广安门医院运用生物技术:LC-MS+GC-MS双平台代谢组学(由鹿明生物提供技术支持)。文章通过对中药***—***通络方改善糖尿病病理方面的深入研究,表明在预防及***方面和微观层面均起到了***效果。同时,也探究出***通络方的内在作用机制。也为糖尿病视网膜病变的早期***,提供***、有效的***方法。其中LC-MS+GC-MS双平台代谢组学有助于对中药成分进行***的分析,为药物机制提供参考。代谢组学——后基因组时代新热点。浙江靶向定量代谢组学

非靶标代谢组学预实验,周期短,报告快,专业可信耐。北京什么是代谢组学

GC-MS非靶向代谢组:随着纳米材料的产业化,各种形式的纳米材料将以不同途径进入人们的生活,纳米材料的生物安全性问题正受到世界各国科学家的***关注,本篇为2020年2月,南京大学环境学院课题组在Environmental Science & Technology杂志(IF=9.028)发表题为“Silver Nanoparticles Alter Soil Microbial Community Compositions and Metabolite Profiles in Unplanted and Cucumber-planted Soil”的研究论文。该研究运用16S rRNA基因测序、GC-MS非靶向代谢组技术对土壤微生物组和代谢组学分析技术的独特结合,提供了对AgNPs生态影响的全新视角,***了解了AgNPs暴露对土壤微生物的影响。标题:银纳米颗粒改变种植和未种植黄瓜土壤中的微生物群落组成和代谢物谱期刊:EnvironmentalScience&Technology影响因子:9.028发表时间:2020年2月合作单位:南京大学环境学院运用生物技术:16SrRNA基因测序、GC-MS非靶向代谢组(由鹿明生物提供技术支持)。北京什么是代谢组学

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