土壤代谢物可以间接反映微生物代谢过程的变化,使用基于GC-MS的非靶向代谢组学,在土壤样品***鉴定272种代谢物并对其进行非靶向代谢组学定量,定量结果表明AgNPs暴露***改变了土壤代谢物的分布。通过参数VIP>1.5,在土壤中鉴定出20种具有重要变化的代谢物(图3I),除少数几个代谢物上调,大多数代谢物减少,表明AgNPs暴露通常会对土壤微生物的代谢产生负面影响。土壤代谢组学可以揭示土壤微生物群落如何在分子水平上应对AgNPs并作出反应,包括毒性机制和***策略。代谢组学生物解析 非靶代谢组学研究 靶向代谢组学研究。江苏代谢 代谢组学双平台代谢组学研究,2022年4月,鹿明生物合作客户中...
GC-MS非靶向代谢组学等研究方法:2021年10月,广东石油化工大学环境科学与工程学院孙建腾教授课题组在《Chemosphere》期刊发表的题为“Metabolomic analysis and oxidative stress response reveals the toxicity in Escherichia coli induced by organophosphate flame retardants tris (2-chloroethyl) phosphate and triphenyl phosphate”的研究成果,通过GC-MS非靶向代谢组学等研究方法,发现包括糖酵解/糖...
LC-MS非靶向代谢组学,中文标题:TNT、RDX、HMX(三种物)在苜蓿中的生物降解和植物毒性机制分析研究对象:苜蓿根发表期刊:Chemosphere影响因子:7.086发表时间:2021.05.18合作单位:西南科技大学运用关键技术:LC-MS非靶向代谢组学文章中LC-MS非靶向代谢组学由欧易/鹿明生物提供技术支持2021年5月,西南科技大学罗学刚教授团队在Chemosphere期刊发表的研究成果,通过LC-MS非靶向代谢组学研究方法,探索了物暴露对植物的毒性机制,验证了植物体内被降解的TNT、RDX和HMX残留物和中间产物干扰植物正常生理代谢的假设。描绘了在三种物影响下苜蓿代谢组图谱,为...
LC-MS+GC-MS双平台代谢组学研究案例,中文标题:使用无偏差代谢组学方法鉴定短期暴露于颗粒物和微生物气溶胶中的青年人尿液生物标志物研究对象:年轻健康志愿者发表期刊:EnvironmentalPollution影响因子:8.071发表时间:2022年4月17日合作单位:中国医学科学院医药生物技术研究所卫计委***生物工程重点实验室、中国中医科学院广安门医院运用生物技术:LC-MS代谢组学、GC-MS代谢组学(由鹿明生物提供技术支持)。本研究旨在使用LC-MS+GC-MS双平台代谢组学研究方法探索 92 名年轻健康个体的尿液代谢组学特征,并确定与短期共暴露相关的潜在生物标志物。代谢组学-对生...
LC-MS非靶向代谢组学研究方法,2021年11月,宁波大学海洋科学学院王春琳团队在Frontiers in Marine Science期刊发表了题为“Metabolic Changes in Scylla paramamosain During Adaptation to an Acute Decrease in Salinity”的研究成果,通过LC-MS非靶向代谢组学研究方法,发现了氨基酸和能量代谢是参与青蟹适应盐度变化的主要因素,而脂质代谢物起辅助作用。中文标题:青蟹在适应盐度急剧下降过程中的代谢变化研究对象:青蟹发表期刊:FrontiersinMarineScience影响因子:4...
代谢组学经典研究:本篇小鹿将为各位看官推荐4篇使用代谢组学的经典研究,***篇文章运用LC-MS/GC-MS双平台代谢组学探究番茄果实成熟过程中的代谢变化。第二篇文章运用16S rRNA测序+代谢组学技术研究不同分子量的PE颗粒干扰玉米生长和根际微环境的机制。第三篇文章运用GC-MS顶空代谢组学探究新等位基因系和野生型的成熟种子中发现了几种不同的挥发性化合物。第四篇文章运用GC-MS非靶向代谢组学技术对对全氟辛酸(PFOA)暴露土壤栽培的黄瓜组织代谢途径变化进行了研究。代谢组学行业解决方案和技术服务流程。浙江lc ms代谢组学双平台代谢组学研究,2022年4月,鹿明生物合作客户中国医学科学院医...
非靶向代谢组学研究:2022年5月,欧易/鹿明生物合作客户甘肃省农业科学院程鸿团队和中国农业大学林涛团队在Frontiers in Plant Science期刊发表的题为 “Identification of Key Gene Networks Controlling Soluble Sugar and Organic Acid Metabolism During Oriental Melon Fruit Development by Integrated Analysis of Metabolic and Transcriptomic Analyses”的研究成果,采用非靶代谢组学和转录组...
代谢组学+转录组学,中文标题:基于代谢组学分析的百菌清、多菌灵、咪鲜胺及其二元和三元混合物对斑马鱼胚胎和仔鱼的健康风险研究对象:斑马鱼胚胎和仔鱼发表期刊:JournalofHazardousMaterials影响因子:10.588运用生物技术:代谢组学环境毒理学浙江省农科院农产品质量营养所风险评估研究团队联合浙江工业大学在农药联合暴露效应机制研究中取得新进展,作者:杨桂玲,王彦华,李健,王豆,鲍志伟,王强(通讯作者),靳远详(共同通讯作者),在JournalofHazardousMaterials期刊发表的文章,通过代谢组学+转录组学的多组学整合分析技术来阐明几种杀菌剂或其混合物在斑马鱼早期发...
土壤代谢物可以间接反映微生物代谢过程的变化,使用基于GC-MS的非靶向代谢组学,在土壤样品***鉴定272种代谢物并对其进行非靶向代谢组学定量,定量结果表明AgNPs暴露***改变了土壤代谢物的分布。通过参数VIP>1.5,在土壤中鉴定出20种具有重要变化的代谢物(图3I),除少数几个代谢物上调,大多数代谢物减少,表明AgNPs暴露通常会对土壤微生物的代谢产生负面影响。土壤代谢组学可以揭示土壤微生物群落如何在分子水平上应对AgNPs并作出反应,包括毒性机制和***策略。常用的代谢组学相关数据库有人类代谢组数据库KEGG数据库、Reactome数据库。上海代谢组学重要GC-MS非靶向代谢组学等研...
尿液代谢组学研究案例,空气中PM和生物气溶胶共同暴露的尿液代谢组学特征采用LC-MS+GC-MS双平台代谢组学方法对尿液样品进行分析,其中GC-MS检测102种代谢物,LC-MS检测到1271种。作者通过使用亚组来分析差异代谢物是否具有性别或季节性,结果表明性别和季节对本研究的结果没有明显的混杂影响。差异分析表明,Pu1和Po1之间的差异代谢物数量大于Po1和C之间的差异,LC-MS分析比GC-MS分析检测到更多的差异代谢物,体现出不同平台的检测特点。为了确定尿液中与空气污染PM暴露相关的代谢生物标志物,使用综合分析获得候选差异代谢物,其中C-Po1和Po1-Pu1比较中的重叠差异代谢物作为短...
代谢组学数据提供了COVID-19患者各阶段循环代谢物特征的综合观点,并确定了葡萄糖代谢和尿素循环的代谢重编程是COVID-19的潜在病理机制。在****病程的不同阶段,靶向宿主代谢可能是一种可行的方法。非靶向代谢组学分析中,发现队列中的样品共鉴定出2466个代谢物峰,负离子模式631个、正离子模式下的1835个;通过筛选,鉴定出240种代谢物。轻症组的代谢物与正常组部分重合,而重症组和恢复组很容易区分(图1B)。240个代谢物中有193个与COVID-19***相关(图1C)。火山图显示了不同组代谢物与正常组相比上调下调的情况(图1D);与正常组对比,***上调的代谢物:轻症组有48个,严重...
代谢组学经典研究:本篇小鹿将为各位看官推荐4篇使用代谢组学的经典研究,***篇文章运用LC-MS/GC-MS双平台代谢组学探究番茄果实成熟过程中的代谢变化。第二篇文章运用16S rRNA测序+代谢组学技术研究不同分子量的PE颗粒干扰玉米生长和根际微环境的机制。第三篇文章运用GC-MS顶空代谢组学探究新等位基因系和野生型的成熟种子中发现了几种不同的挥发性化合物。第四篇文章运用GC-MS非靶向代谢组学技术对对全氟辛酸(PFOA)暴露土壤栽培的黄瓜组织代谢途径变化进行了研究。代谢组学组学领域新方法和思路。上海医学代谢组学双平台代谢组学研究,2022年4月,鹿明生物合作客户中国医学科学院医药生物技术研...
代谢组学+转录组学研究:2022年2月,中国海洋大学食品科学与工程学院刘尊英教授课题组在《Foods》期刊发表的题为“Dissecting of the AI-2/LuxS Mediated Growth Characteristics and Bacteriostatic Ability of Lactiplantibacillus plantarum SS-128 by Integration of Transcriptomics and Metabolomics”的研究成果,通过转录组学和代谢组学等研究方法,发现植物乳孢杆菌可以通过AI-2/luxs介导的群体感应(QS)系统来调节其生长...
GC-MS代谢组学和 LC-MS代谢组学研究:盐度的变化会影响甲壳类动物的生长、***和疾病状态。文章作者通过非靶代谢组学对青蟹适应盐度急性下降过程中的代谢变化进行了研究,利用GC-MS和LC-MS数据联合分析了青蟹应对盐度急性下降情况的主要代谢途径。研究结果表明,在急性低盐胁迫下,青蟹通过甘油磷脂代谢物调节生物膜的结构发生变化,然后通过ABCs转运蛋白运输氨基酸和碳水化合物,实现细胞内外的渗透平衡。此项研究体现了组学技术在机制研究中的重要作用。王春琳课题组深耕青蟹研究,近些年来探索青蟹对环境的适应变化也在各大期刊上发表:项目文章|iTRAQ蛋白组学助力宁波大学越冬期间拟穴青蟹代谢变化研究项目...
非靶代谢组学研究:2022年03月,欧易/鹿明生物合作客户重庆医科大学附属第二医院消化内科周智航团队在International Journal of Biological Sciences期刊发表的题为 “Enhanced pentose phosphate pathway activity promotes pancreatic ductal adenocarcinoma progression via activating YAP/MMP1 axis under chronic acidosis”的研究成果,通过采用非靶代谢组学和基因表达芯片,发现了适应酸性微环境的胰腺导管腺* (P...
GC-MS非靶向代谢组学等研究方法:2021年10月,广东石油化工大学环境科学与工程学院孙建腾教授课题组在《Chemosphere》期刊发表的题为“Metabolomic analysis and oxidative stress response reveals the toxicity in Escherichia coli induced by organophosphate flame retardants tris (2-chloroethyl) phosphate and triphenyl phosphate”的研究成果,通过GC-MS非靶向代谢组学等研究方法,发现包括糖酵解/糖...
GC-MS非靶向代谢组学研究,2022年2月,上海市农业科学院食用菌研究所鲍大鹏研究员课题组在《Frontiers in Microbiology》期刊发表的题为“Oxidative Stress and Autophagy Are Important Processes in Post Ripeness and Brown Film Formation in Mycelium of Lentinula edodes”的研究成果,通过iTRAQ标记定量蛋白组学、GC-MS非靶向代谢组学等技术对香菇菌丝进行定量蛋白质组学和代谢组学分析,发现氧化应激和自噬是香菇菌丝后熟转色重要过程,并对其在蛋白质...
**靶向代谢组学研究,中文标题:代谢组学分析揭示了COVID-19新的发展特征研究对象:****患者发表期刊:EuropeanRespiratoryJournal影响因子:16.671发表时间:2021.7.21运用生物技术:LC-MS非靶代谢组学+靶向代谢组学,****已经***了1.6亿多人,并导致全世界数以百万的人死亡;至少部分原因是它的病理生理尚不清楚。所以,识别****的潜在分子机制对于战胜**是至关重要的。此外,代谢物通过在疾病进展过程中获得***的病理生理学意义来反映个体的疾病进展。因此,中国广州多家研究机构的科研人员使用了非靶向和靶向代谢组学分析对****患者所有阶段血清的代谢...
代谢组学研究:浓香白酒占中国白酒总产量的70%以上。自1960年代以来,在中国白酒酿造行业中,人工窖泥被***用于建造发酵窖以生产高质量的浓香白酒。为了深入了解人工窖泥原核生物分类和功能动力学机制,以及这种变化与生产高质量浓香白酒之间的联系,本文对该酿造微生态系统进行了***进行了16S rRNA测序,蛋白质组学和代谢组学联合分析。多组学方法能够更***地了解高质量浓香白酒生产过程中人工窖泥微生物群落发生的代谢过程变化,这将有助于进一步优化人工窖泥培养技术和改善浓香白酒的质量。代谢组学数据分析教程 代谢组学一般测几个样。上海非靶标代谢组学的样品前处理GC-MS代谢组学和 LC-MS代谢组学研究...
作者研究发现**酸过量会导致葡萄酒颜色变浅,但**酸干扰对酵母细胞繁殖和β-葡萄糖苷酶活性均无***影响,随后通过非靶代谢组学、靶向代谢组学等技术研究**酸干扰过程中葡萄酒代谢物的变化,发现**酸过量会干扰酒精发酵过程中花青素的代谢,通过加速其异构化来削弱花青素浓度,从而影响葡萄酒色泽,因而在葡萄酒生产中过程中应避免**酸过量。通过非靶代谢组学技术,能够了解发酵过程中,发酵液代谢物的变化情况。了解到在糖酵解过程中,多余的PA会扰乱糖酵解和三羧酸循环的过程,从而深入了解葡萄酒发酵过程中颜色变化的原因。上海鹿明生物科技有限公司多年来,一直专注于生命科学和生命技术领域,是国内早期开展以蛋白组和代谢组...
GC-MS非靶向代谢组学研究,2022年2月,上海市农业科学院食用菌研究所鲍大鹏研究员课题组在《Frontiers in Microbiology》期刊发表的题为“Oxidative Stress and Autophagy Are Important Processes in Post Ripeness and Brown Film Formation in Mycelium of Lentinula edodes”的研究成果,通过iTRAQ标记定量蛋白组学、GC-MS非靶向代谢组学等技术对香菇菌丝进行定量蛋白质组学和代谢组学分析,发现氧化应激和自噬是香菇菌丝后熟转色重要过程,并对其在蛋白质...
通过转录组学和代谢组学(GC-MS非靶向代谢组学)对BPF暴露和对照组的细胞进行分析,筛选到差异的基因和代谢物。分别通过富集分析,找到差异基因或代谢物参与的条目或通路。***通过差异转录本、代谢物和促炎细胞因子的综合分析,揭露了它们之间的关系。本文通过多组学分析和体外模型的方式,发现了BPF暴露后肠上皮细胞转录组和代谢组谱的改变,揭露了BPF可能在肠道炎症发病机制的作用。中文标题:转录组学结合代谢组学揭示了双酚F(BPF)暴露对肠道炎症的影响研究对象:人结肠粘膜上皮细胞系(NCM460)发表期刊:ScienceoftheTotalEnvironment影响因子:7.963发表时间:2021年1...
代谢组学研究,2021年12月威尔康奈尔医学中心和纪念斯隆凯特琳**中心的Linda T. Vahdat 和 Vivek Mittal教授课题组在Nature Communications期刊发表的题为 “Copper depletion modulates mitochondrial oxidative phosphorylation to impair triple negative breast cancer metastasis”的研究成果,通过蛋白质组学和代谢组学研究方法,发现了高度转移性 SOX2/OCT4+ 细胞的离散亚群表现出细胞内铜水平升高特征,探究了TM 介导的复合物 IV...
GC-MS非靶向代谢组,标题:银纳米颗粒改变种植和未种植黄瓜土壤中的微生物群落组成和代谢物谱期刊:EnvironmentalScience&Technology影响因子:9.028发表时间:2020年2月合作单位:南京大学环境学院运用生物技术:16SrRNA基因测序、GC-MS非靶向代谢组(由鹿明生物提供技术支持)。银纳米颗粒(AgNPs)是使用*****的工程纳米材料之一,泄露可能导致颗粒在土壤中积累,并对环境造成未知风险。有报告指出AgNPs可能通过影响根系分泌物间接对微生物群落功能和基因组多样性产生***影响,但对其机理了解甚少。土壤代谢物可作为土壤微生物群落变化的表型特征,但当前有关N...
GC-MS代谢组学结果:通过GC-MS代谢组学观察到 92种化合物,其中,49种与数据库中可用的化合物相匹配,包括重要的发酵代谢物,如葡萄糖、**酸、琥珀酸和几种 (n=10) 初级氨基酸。NMR也观察到了七种已鉴定的化合物。通过 GC-MS 测量,表面(15 厘米)SOM 中的糖和氨基酸浓度随温度处理而变化,随着温度的升高,通常趋向于更高的糖浓度和更低的游离氨基酸浓度(图 3)。谷氨酰胺在氨基酸中是一个明显的例外,在浓度与温度处理中观察到了积极的趋势(图 3)。此外,与植物应激反应相关的化合物(油酸、肌醇、半乳糖醇和 4-羟基-3-甲氧基苯甲酸)随温度升高而增加(SI 附录,图 S5)。代谢...
非靶向代谢组学研究:通过在三个成熟阶段收获两个东方甜瓜品种的果实作者使用非靶代谢组学联合转录组学发现可溶性糖和有机酸在转录组水平和代谢组水平的差异现象。这项研究运用多组学技术联合揭示了两个品种成熟过程中关键的代谢和转录特征。在本研究中,通过代谢和转录组分析的综合分析,研究了控制两个东方甜瓜品种'甜宝'和'小翠瓜'中糖和有机酸代谢的基因网络。筛选了与糖和有机酸代谢相关的关键代谢物和候选基因,并讨论了甜瓜品种甜度不同的可能解释。研究结果提高了对决定甜瓜发育和成熟过程中糖和有机酸积累和代谢的分子机制的理解。代谢组学-欧易生物/鹿明生物 客户好评 专注代谢组学研究。北京代谢组学研究的内容非靶向代谢组学...
顶空GC-MS代谢组学,中文标题:利用BADH2新等位基因生产芳香三系杂交稻研究对象:水稻发表期刊:PlantBiotechnologyJournal影响因子:9.803发表时间:2021.08.31发表单位:中国水稻研究所运用生物技术:GC-MS顶空代谢组学(由鹿明生物提供技术支持)、基因编辑技术香味是决定稻米烹饪和食用特性的独特和关键指标之一。2021年8月,中国水稻研究所胡培松院士团队在PlantBiotechnologyJournal期刊发表的研究成果,依靠GC-MS顶空代谢组学的平台对BADH2等位基因系成熟籽粒进行性状分析。研究新型BADH2等位基因生产芳香杂交水稻机理,加快了水稻...
LC-MS靶向代谢组学研究本篇文章通过LC-MS靶向代谢组学和16S rRNA基因序列分析,探究谷物在加工传统饮料ogi过程中******的减少和细菌群落的动态变化。同时,从粮食安全方面考虑,谷物的污染水平低、较安全,又优于玉米,可以代替受******污染的玉米品种。欧易/鹿明生物推出的16s+代谢组学的多层组学研究思路继本篇文章前已先后助力了浙江工业大学、中国农科院、青岛农业大学等在微生物一区顶刊Microbiome、医学一区顶刊GUT发表文章。项目文章PBP | 浙江工业大学傅正伟运用GC-MS非靶向代谢组学和16S探究水稻根际微生物群落影响项目文章 | 恭喜中国农科院及青岛农业大学团队继...
非靶代谢组学研究:2022年03月,欧易/鹿明生物合作客户重庆医科大学附属第二医院消化内科周智航团队在International Journal of Biological Sciences期刊发表的题为 “Enhanced pentose phosphate pathway activity promotes pancreatic ductal adenocarcinoma progression via activating YAP/MMP1 axis under chronic acidosis”的研究成果,通过采用非靶代谢组学和基因表达芯片,发现了适应酸性微环境的胰腺导管腺* (P...
GC-MS非靶向代谢组学和转录组学研究方法,2021年11月,上海交通大学医学院附属新华医院冯丽萍教授课题组在Science of the Total Environment期刊发表了题为“Transcriptomics integrated with metabolomics reveals the effect of Bisphenol F (BPF) exposure on intestinal inflflammation ”的研究成果,通过GC-MS非靶向代谢组学和转录组学研究方法,发现了BPF暴露的肠道毒性的特征,探究了可能的发病机理。中文标题:转录组学结合代谢组学揭示了双酚F(...