代谢组学研究,2021年12月威尔康奈尔医学中心和纪念斯隆凯特琳**中心的Linda T. Vahdat 和 Vivek Mittal教授课题组在Nature Communications期刊发表的题为 “Copper depletion modulates mitochondrial oxidative phosphorylation to impair triple negative breast cancer metastasis”的研究成果,通过蛋白质组学和代谢组学研究方法,发现了高度转移性 SOX2/OCT4+ 细胞的离散亚群表现出细胞内铜水平升高特征,探究了TM 介导的复合物 IV 失活确定为 SOX2/OCT4+ 细胞群中的主要代谢缺陷,AMPK/mTORC1 能量传感器为重要的下游途径。描绘了铜-代谢-转移轴,为高风险三阴性乳腺*患者的下一代治疗方法提供了理论依据。欧易生物代谢组学专业分析检测技术**。江苏代谢组学 上海
本研究通过LC-MS和GC-MS双平台代谢组学研究方法,对92例样品5个时间点的尿液样品进行分析,分别找到了33种和155种与PM和生物气溶胶相关的差异标志物,结果揭示了年轻健康人在五个不同时间点的尿液代谢谱的动态变化,采用KEGG通路富集分析和时间序列分析确定了与短期共同暴露于空气中PM和生物气溶胶相关的几种潜在代谢物生物标志物,发现短期高浓度暴露于PM可能会导致代谢改变并降低应激***水平,这可能是与下丘脑-垂体-肾上腺和交感-肾上腺-髓质轴的***有关;而生物气溶胶剂则通过***系统对病理性成瘾有重要作用。其中尿液中的16-脱氢孕酮可能是PM暴露的潜在生物标志物;4-羟基苯乙醇可能是生物气溶胶的潜在生物标志物,可用于分别预测或诊断PM或生物气溶胶相关疾病。江苏非靶向代谢组学价格代谢组学——后基因组时代新热点。
LC-MS+GC-MS双平台代谢组学研究案例,中文标题:使用无偏差代谢组学方法鉴定短期暴露于颗粒物和微生物气溶胶中的青年人尿液生物标志物研究对象:年轻健康志愿者发表期刊:EnvironmentalPollution影响因子:8.071发表时间:2022年4月17日合作单位:中国医学科学院医药生物技术研究所卫计委***生物工程重点实验室、中国中医科学院广安门医院运用生物技术:LC-MS代谢组学、GC-MS代谢组学(由鹿明生物提供技术支持)。本研究旨在使用LC-MS+GC-MS双平台代谢组学研究方法探索 92 名年轻健康个体的尿液代谢组学特征,并确定与短期共暴露相关的潜在生物标志物。
代谢组学等多组学研究,2021年12月30日复旦大学附属中山医院樊嘉院士、中国科学院上海药物研究所周虎研究员、中国科学院分子细胞科学***创新中心高大明研究员、复旦大学附属中山医院**教授课题组合作在Cancer Cell上发表题为“Proteogenomic characterization identifies clinically relevant subgroups of intrahepatic cholangiocarcinoma”的研究论文,通过基因组学、转录组学、蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学、微生物组学研究方法对262例肝内胆管*(iCCA)患者的配对**和*旁组织进行了分析,通过绘制肝内胆管*的多维分子图谱为进一步鉴定iCCA的分子发病机制、分子分型、预后等提供了宝贵的资源。代谢组学 研究一站式服务平台。
GC-MS非靶向代谢组:随着纳米材料的产业化,各种形式的纳米材料将以不同途径进入人们的生活,纳米材料的生物安全性问题正受到世界各国科学家的***关注,本篇为2020年2月,南京大学环境学院课题组在Environmental Science & Technology杂志(IF=9.028)发表题为“Silver Nanoparticles Alter Soil Microbial Community Compositions and Metabolite Profiles in Unplanted and Cucumber-planted Soil”的研究论文。该研究运用16S rRNA基因测序、GC-MS非靶向代谢组技术对土壤微生物组和代谢组学分析技术的独特结合,提供了对AgNPs生态影响的全新视角,***了解了AgNPs暴露对土壤微生物的影响。标题:银纳米颗粒改变种植和未种植黄瓜土壤中的微生物群落组成和代谢物谱期刊:EnvironmentalScience&Technology影响因子:9.028发表时间:2020年2月合作单位:南京大学环境学院运用生物技术:16SrRNA基因测序、GC-MS非靶向代谢组(由鹿明生物提供技术支持)。代谢组学专区 系统生物学驱动的功能代谢组学方法,具有高灵敏、高分辨和高通量。浙江医学代谢组学
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非靶向GC-MS代谢组学、LC-MS代谢组学研究标题:中国浓香白酒生产过程中人工窖泥中原核生物群落的结构和功能变化研究对象:浓香白酒、人工窖泥期刊:mSystems影响因子:6.469发表时间:2020年3月合作单位:四川省农业科学院水稻高粱研究所运用欧易/鹿明生物技术:TMT标记定量蛋白质组学、PRM靶向验证、非靶向GC-MS代谢组学、LC-MS代谢组学、16SrRNA测序,本篇非靶向代谢组学分析共鉴定出7,478种代谢物。GC-MS代谢组学和LC-MS代谢组学方法在OP***A中均可明确分离批次(图5a至d)。在第四批人工窖泥样品中,分别上调和下调了491和523种代谢物。差异代谢产物被分为16个功能类别(图5f)。脂质和类脂质分子(38.07%)**多,其次是有机杂环化合物(16.17%)和有机酸及其衍生物(13.11%)。江苏代谢组学 上海
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