土壤代谢物可以间接反映微生物代谢过程的变化,使用基于GC-MS的非靶向代谢组学,在土壤样品***鉴定272种代谢物并对其进行非靶向代谢组学定量,定量结果表明AgNPs暴露***改变了土壤代谢物的分布。通过参数VIP>1.5,在土壤中鉴定出20种具有重要变化的代谢物(图3I),除少数几个代谢物上调,大多数代谢物减少,表明AgNPs暴露通常会对土壤微生物的代谢产生负面影响。土壤代谢组学可以揭示土壤微生物群落如何在分子水平上应对AgNPs并作出反应,包括毒性机制和***策略。常用的代谢组学相关数据库有人类代谢组数据库KEGG数据库、Reactome数据库。上海代谢组学重要
GC-MS非靶向代谢组学等研究方法:2021年10月,广东石油化工大学环境科学与工程学院孙建腾教授课题组在《Chemosphere》期刊发表的题为“Metabolomic analysis and oxidative stress response reveals the toxicity in Escherichia coli induced by organophosphate flame retardants tris (2-chloroethyl) phosphate and triphenyl phosphate”的研究成果,通过GC-MS非靶向代谢组学等研究方法,发现包括糖酵解/糖异生、磷酸戊糖代谢、嘌呤代谢、谷胱甘肽代谢、胺素代谢,丙氨酸和天冬氨酸等代谢途径被破坏。大多数差异表达的代谢物被下调,表明有机磷阻燃剂对代谢功能和关键代谢途径有抑制作用。本研究揭示了生物中有机磷阻燃剂对环境产生的风险提供了新的见解。北京代谢组学 与中医以代谢组学为研究对象,探究细胞、组织或其变化规律的科学。
非靶向和靶向代谢组学研究方法,2021年7月,广州多家研究机构科研人员在EuropeanRespiratoryJournal期刊发表了题为“Metabolomicanalysesrevealsnewstage-specificfeaturesoftheCOVID-19”的研究成果,该研究以****患者为研究对象,运用非靶向和靶向代谢组学研究方法,提供了****患者所有阶段循环代谢物特征的综合视图,并确定糖代谢和尿素循环的代谢重新编程是****的潜在病理机制;提出以宿主代谢为靶点可能是在病程不同阶段对抗****的一种可行的方法。
LC-MS+GC-MS双平台代谢组学研究案例,中文标题:使用无偏差代谢组学方法鉴定短期暴露于颗粒物和微生物气溶胶中的青年人尿液生物标志物研究对象:年轻健康志愿者发表期刊:EnvironmentalPollution影响因子:8.071发表时间:2022年4月17日合作单位:中国医学科学院医药生物技术研究所卫计委***生物工程重点实验室、中国中医科学院广安门医院运用生物技术:LC-MS代谢组学、GC-MS代谢组学(由鹿明生物提供技术支持)。本研究旨在使用LC-MS+GC-MS双平台代谢组学研究方法探索 92 名年轻健康个体的尿液代谢组学特征,并确定与短期共暴露相关的潜在生物标志物。代谢组学-欧易生物/鹿明生物 客户好评 专注代谢组学研究。
非靶向GC-MS代谢组学、LC-MS代谢组学研究标题:中国浓香白酒生产过程中人工窖泥中原核生物群落的结构和功能变化研究对象:浓香白酒、人工窖泥期刊:mSystems影响因子:6.469发表时间:2020年3月合作单位:四川省农业科学院水稻高粱研究所运用欧易/鹿明生物技术:TMT标记定量蛋白质组学、PRM靶向验证、非靶向GC-MS代谢组学、LC-MS代谢组学、16SrRNA测序,本篇非靶向代谢组学分析共鉴定出7,478种代谢物。GC-MS代谢组学和LC-MS代谢组学方法在OP***A中均可明确分离批次(图5a至d)。在第四批人工窖泥样品中,分别上调和下调了491和523种代谢物。差异代谢产物被分为16个功能类别(图5f)。脂质和类脂质分子(38.07%)**多,其次是有机杂环化合物(16.17%)和有机酸及其衍生物(13.11%)。代谢组学生物解析 非靶代谢组学研究 靶向代谢组学研究。北京代谢组学 与中医
代谢组学,代谢组数据库,代谢组分析,基因检测。上海代谢组学重要
粪便LC-MS代谢组学研究方法,2022年,复旦大学上海市第五人民医院创伤急危重症医学科唐建国教授课题组在FrontiersinCellularandInfectionMicrobiology期刊发表的题为“DiallylDisulfide(DADS)AmelioratesIntestinalCandidaalbicansInfectionbyModulatingtheGutmicrobiotaandMetabolitesandProvidingIntestinalProtectioninMice”的研究成果,通过粪便微生物16SrRNA测序和粪便LC-MS代谢组学研究方法,发现了DADS***减轻了DSS诱导下肠道白色念珠菌***,并改变了小鼠肠道微生物群落结构和代谢特征,探究了DADS可以调节肠道微生物群和代谢物并保护肠道屏障的内在机理,为***白色念珠菌***提供了理论依据。上海代谢组学重要
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