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北京代谢组学测序

来源: 发布时间:2022-10-25

非靶代谢组学研究:2022年03月,欧易/鹿明生物合作客户重庆医科大学附属第二医院消化内科周智航团队在International Journal of Biological Sciences期刊发表的题为 “Enhanced pentose phosphate pathway activity promotes pancreatic ductal adenocarcinoma progression via activating YAP/MMP1 axis under chronic acidosis”的研究成果,通过采用非靶代谢组学和基因表达芯片,发现了适应酸性微环境的胰腺导管腺* (PDAC)细胞具有更强的转移和增殖能力。


代谢组学显示适应酸性微环境的 PDAC 细胞中葡萄糖增加、糖酵解减少,而转录组学发现适应酸性微环境细胞中的差异表达基因主要为细胞外基质修饰和 Hippo 信号传导相关基因。MMP1 在在适应酸性微环境细胞中上调**为明显,实验验证了其由 YAP/TAZ 通路介导,而被 AMPK抑制。该研究确认了代谢重编程通过AMPK/ YAP /MMP1轴促进适应酸性微环境的 PDAC 细胞的增殖和转移。 读懂代谢组学 代谢组学的研究范畴。北京代谢组学测序

GC-MS非靶向代谢组学研究:不同分子量聚乙烯颗粒改变了玉米根际土壤微生物群落组成和代谢谱AlterationsoftherhizospheresoilmicrobialcommunitycompositionandmetaboliteprofilesofZeamaysbypolyethylene-particlesofdifferentmolecularweights研究对象:聚乙烯颗粒、玉米、根际土壤发表期刊:JournalofHazardousMaterials影响因子:10.588组学技术:GC-MS非靶向代谢组学和16SrRNA测序(由欧易/鹿明生物提供技术支持);这项研究的重点是确定不同分子量的PE颗粒干扰玉米生长和根际微环境的机制。本文运用非靶向代谢组学,微生物16SrRNA测序等方法研究的结果证实,不同分子量的PE颗粒对土壤-植物系统有不利影响。不同分子量的PE颗粒在形状和表面微观结构上存在明显差异。土壤蔗糖酶和过氧化物酶对不同分子量的PE颗粒有***响应。北京代谢组学测序非靶标代谢组学预实验,周期短,报告快,专业可信耐。

GC-MS代谢组学和 LC-MS代谢组学研究:盐度的变化会影响甲壳类动物的生长、***和疾病状态。文章作者通过非靶代谢组学对青蟹适应盐度急性下降过程中的代谢变化进行了研究,利用GC-MS和LC-MS数据联合分析了青蟹应对盐度急性下降情况的主要代谢途径。研究结果表明,在急性低盐胁迫下,青蟹通过甘油磷脂代谢物调节生物膜的结构发生变化,然后通过ABCs转运蛋白运输氨基酸和碳水化合物,实现细胞内外的渗透平衡。此项研究体现了组学技术在机制研究中的重要作用。王春琳课题组深耕青蟹研究,近些年来探索青蟹对环境的适应变化也在各大期刊上发表:项目文章|iTRAQ蛋白组学助力宁波大学越冬期间拟穴青蟹代谢变化研究项目文章|两篇背靠背,王春琳、王欢课题组揭示拟穴青蟹适应盐度骤降的代谢机理

代谢组学研究:浙江省农科院农产品质量营养所风险评估研究团队联合浙江工业大学在农药联合暴露效应机制研究中取得新进展,作者:杨桂玲,王彦华,李健,王豆,鲍志伟,王强(通讯作者),靳远详(共同通讯作者),在Journal of Hazardous Materials期刊发表了题为“Health risks of chlorothalonil, carbendazim, prochloraz, their binary and ternary mixtures on embryonic and larval zebrafish based on metabolomics analysis”的研究成果,通过代谢组学+转录组学的多组学整合分析技术来阐明几种杀菌剂或其混合物在斑马鱼早期发育阶段的复杂病理生理和毒性通路。代谢组学——寻找代谢物与生理病理变化的相对关系研究方式。

GC-MS非靶向代谢组研究,随着纳米材料的产业化,各种形式的纳米材料将以不同途径进入人们的生活,纳米材料的生物安全性问题正受到世界各国科学家的***关注,本篇为2020年2月,南京大学赵丽娟课题组在Environmental Science & Technology杂志发表题为“Silver Nanoparticles Alter Soil Microbial Community Compositions and Metabolite Profiles in Unplanted and Cucumber-planted Soil”的研究论文。该研究运用16S rRNA基因测序、GC-MS非靶向代谢组技术对土壤微生物组和代谢组学分析技术的独特结合,提供了对AgNPs生态影响的全新视角,***了解了AgNPs暴露对土壤微生物的影响。常用的代谢组学相关数据库有人类代谢组数据库KEGG数据库、Reactome数据库。北京代谢组学测序

代谢组学专区 系统生物学驱动的功能代谢组学方法,具有高灵敏、高分辨和高通量。北京代谢组学测序

代谢组学等多组学研究,2021年12月30日复旦大学附属中山医院樊嘉院士、中国科学院上海药物研究所周虎研究员、中国科学院分子细胞科学***创新中心高大明研究员、复旦大学附属中山医院**教授课题组合作在Cancer Cell上发表题为“Proteogenomic characterization identifies clinically relevant subgroups of intrahepatic cholangiocarcinoma”的研究论文,通过基因组学、转录组学、蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学、微生物组学研究方法对262例肝内胆管*(iCCA)患者的配对**和*旁组织进行了分析,通过绘制肝内胆管*的多维分子图谱为进一步鉴定iCCA的分子发病机制、分子分型、预后等提供了宝贵的资源。北京代谢组学测序

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