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上海代谢组学的数据特点

来源: 发布时间:2022-09-01

代谢组学经典研究:本篇小鹿将为各位看官推荐4篇使用代谢组学的经典研究,***篇文章运用LC-MS/GC-MS双平台代谢组学探究番茄果实成熟过程中的代谢变化。第二篇文章运用16S rRNA测序+代谢组学技术研究不同分子量的PE颗粒干扰玉米生长和根际微环境的机制。第三篇文章运用GC-MS顶空代谢组学探究新等位基因系和野生型的成熟种子中发现了几种不同的挥发性化合物。第四篇文章运用GC-MS非靶向代谢组学技术对对全氟辛酸(PFOA)暴露土壤栽培的黄瓜组织代谢途径变化进行了研究。代谢组学——寻找代谢物与生理病理变化的相对关系研究方式。上海代谢组学的数据特点

LC-MS非靶向代谢组学研究方法,2021年11月,宁波大学海洋科学学院王春琳团队在Frontiers in Marine Science期刊发表了题为“Metabolic Changes in Scylla paramamosain During Adaptation to an Acute Decrease in Salinity”的研究成果,通过LC-MS非靶向代谢组学研究方法,发现了氨基酸和能量代谢是参与青蟹适应盐度变化的主要因素,而脂质代谢物起辅助作用。中文标题:青蟹在适应盐度急剧下降过程中的代谢变化研究对象:青蟹发表期刊:FrontiersinMarineScience影响因子:4.912发表时间:2021年11月2日合作单位:宁波大学应用海洋生物技术教育部重点实验室运用生物技术:LC-MS非靶向代谢组(由鹿明生物提供技术支持)浙江代谢组学 富集分析代谢组学行业解决方案和技术服务流程。

代谢组学数据提供了COVID-19患者各阶段循环代谢物特征的综合观点,并确定了葡萄糖代谢和尿素循环的代谢重编程是COVID-19的潜在病理机制。在****病程的不同阶段,靶向宿主代谢可能是一种可行的方法。非靶向代谢组学分析中,发现队列中的样品共鉴定出2466个代谢物峰,负离子模式631个、正离子模式下的1835个;通过筛选,鉴定出240种代谢物。轻症组的代谢物与正常组部分重合,而重症组和恢复组很容易区分(图1B)。240个代谢物中有193个与COVID-19***相关(图1C)?;鹕酵枷允玖瞬煌榇晃镉胝W橄啾壬系飨碌鞯那榭?图1D);与正常组对比,***上调的代谢物:轻症组有48个,严重组有59个,恢复组有64个;***下调的代谢物:轻症组有33个,重症组有29个,恢复组有34个。使用靶向代谢组学分析;首先根据发现队列中59名受试者的血清代谢物(4个样本因体积小而被排除);定量到了199种代谢物。根据不同组的浓度,将199个代谢物分为16个簇;然后根据恢复组的代谢物是否恢复到正常水平将这些簇分为三组。

LC-MS+GC-MS双平台代谢组学研究案例,中文标题:***通络***通过***和抗氧化作用预防及延缓糖尿病视网膜病变发展的机制研究研究对象:大鼠发表期刊:Biomedicine&Pharmacotherapy影响因子:6.529发表时间:2022年2月合作单位:中国中医科学院广安门医院运用生物技术:LC-MS+GC-MS双平台代谢组学(由鹿明生物提供技术支持)。文章通过对中药***—***通络方改善糖尿病病理方面的深入研究,表明在预防及***方面和微观层面均起到了***效果。同时,也探究出***通络方的内在作用机制。也为糖尿病视网膜病变的早期***,提供***、有效的***方法。其中LC-MS+GC-MS双平台代谢组学有助于对中药成分进行***的分析,为药物机制提供参考。代谢组学-欧易生物/鹿明生物 客户好评 专注代谢组学研究。

GC-MS非靶向代谢组学研究:不同分子量聚乙烯颗粒改变了玉米根际土壤微生物群落组成和代谢谱AlterationsoftherhizospheresoilmicrobialcommunitycompositionandmetaboliteprofilesofZeamaysbypolyethylene-particlesofdifferentmolecularweights研究对象:聚乙烯颗粒、玉米、根际土壤发表期刊:JournalofHazardousMaterials影响因子:10.588组学技术:GC-MS非靶向代谢组学和16SrRNA测序(由欧易/鹿明生物提供技术支持);这项研究的重点是确定不同分子量的PE颗粒干扰玉米生长和根际微环境的机制。本文运用非靶向代谢组学,微生物16SrRNA测序等方法研究的结果证实,不同分子量的PE颗粒对土壤-植物系统有不利影响。不同分子量的PE颗粒在形状和表面微观结构上存在明显差异。土壤蔗糖酶和过氧化物酶对不同分子量的PE颗粒有***响应。代谢组学 寻找代谢物与生理病理的研究方式。北京代谢组学数据的分析

常用的代谢组学相关数据库有人类代谢组数据库KEGG数据库、Reactome数据库。上海代谢组学的数据特点

LC-MS靶向代谢组+16S微生物多样性检测研究。题目:粪便微生物可以区分酒精性肝炎引起的酒精摄入量,但不能区分疾病的严重程度期刊:HepatologyIF=17.425研究思路:*样本类型:人粪便*检测平台:LC-MS靶向代谢组、16S微生物多样性检测为了表征酒精性肝炎有关的粪便微生物生态学,考察微生物组变化和疾病严重程度的关系,推断微生物生态学变化的功能相关性,本文作者将中度或重度酒精性肝炎患者(MAH和SAH)的粪便微生物组与健康(HC)和重度饮酒对照组(HDC)进行比较,通过16SrRNA基因测序鉴定微生物群分类,使用LC/MS平台测量粪便短链脂肪酸(SCFA)含量。重度饮酒患者与健康对照组相比、重度饮酒组与酒精性肝炎相比,均可以发现明显的微生物组特征分布。但微生物分类不能区分中度和重度酒精性肝炎。在酒精性肝炎患者中,粪便中短链脂肪酸与产生SCFA的微生物菌群均减少,可以推断出,酒精性肝炎患者的粪便微生物组有明显的变化,与酒精性肝炎的严重程度无关。上海代谢组学的数据特点

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