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湖北蛋白质亚硝基化修饰组学质谱分析

来源: 发布时间:2021-12-23

蛋白质乙酰化修饰的功能:目前对乙酰化修饰的功能研究主要集中在对细胞转录调控,以及对代谢通路的调控这两个方面。在众多乙酰化修饰的蛋白质中,研究较多的要数细胞核中包围DNA的组蛋白了。组蛋白和DNA缠绕构成核小体,组蛋白的甲基化、乙酰化修饰能够调节DNA缠绕的松紧度,从而对基因表达进行调控,因此,组蛋白的翻译后修饰是表观遗传学研究中的重要一环。另外,研究也发现乙酰化修饰普遍存在于人的多种代谢酶之中,并且参与调控代谢通路以及代谢酶的活性。其中在肝脏这样的代谢中就存在着多种代谢酶被高度乙酰化。蛋白质乙酰化修饰组学技术对细胞核内转录调控因子的刺激有着重要的作用。湖北蛋白质亚硝基化修饰组学质谱分析

蛋白质翻译后修饰组学:翻译后修饰自下而上分析策略:自下而上蛋白质组学是一种基于肽段分析的技术。对于不同类型的翻译后修饰,具体的分析策略存在差异。蛋白质的糖基化具有异质性。不同的糖链可以连接到同一位点上,不同位点可以连接到同一蛋白质上的不同糖链上。糖基化的异质性严重阻碍了糖蛋白的分离和分析。不同糖类型的相同蛋白质,在电泳上会出现分散的条带,导致信号分散。此外,对低丰度蛋白质的识别性差导致糖蛋白在色谱图中分离不佳,质谱中有一簇分子量不准确的分辨不清的峰。目前,蛋白糖基化研究的主要策略是利用现有的技术体系对糖基化蛋白的糖基化肽段进行分离和富集,消除糖基化的异质性及其对质谱的影响,标记糖基化位点。深圳蛋白质棕榈酰化修饰组学分析价格乙酰化修饰是体内高度保守的可逆转的蛋白修饰。

蛋白质学组翻译后修饰的类型:翻译后修饰的类型包括N端fMet或Met的去除、二硫键的形成、化学修饰和肽键的裂解,其中磷酸化是比较常见的。蛋白质的化学修饰反应是在维持蛋白质的完整性和功能性的基础上,通过基于其氨基酸残基的化学反应获得新的生物结合物。翻译后修饰在哪里发生?翻译后修饰主要发生在氨基酸侧链或蛋白质的C端或N端。现有的官能团或新官能团的引入可被用于修饰蛋白质,以扩展20个标准氨基酸的化学组成。翻译后修饰的位点通常带有可以在化学反应中充当亲核试剂的官能团,如丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸的羟基;赖氨酸、精氨酸和组氨酸胺形式;同时,在蛋白质的N端和C端,天冬酰胺也可作为翻译后修饰中的一种聚糖连接点。翻译后修饰也发生在氧化的蛋氨酸和侧链位点的一些亚甲基上。

蛋白质乙酰化修饰组学定量分析:1. SILAC细胞标记,组织/细胞破碎,提取、提纯目的蛋白质(基于SILAC的乙酰化修饰组学定量)。2. 使用胰蛋白酶将目的蛋白酶解成多肽片段。3. 对多肽片段进行iTRAQ标记(基于iTRAQ的乙酰化修饰组学定量)。4. 使用高效特异性乙酰化抗体对乙酰化修饰肽段进行免疫富集。5. 使用LC-MS/MS对富集的乙酰化肽段进行序列分析。6. 数据分析,比对不同样本中蛋白乙酰化修饰水平差异,并对产生变化的生物学意义进行解释。蛋白质翻译后修饰可以改变蛋白质的物理、化学性质。

蛋白质磷酸化修饰定义?在哺乳动物细胞生命周期中,大约有1/3的蛋白质发生过磷酸化修饰,在脊椎动物基因中,约有5%的基因编码的蛋白质是参与磷酸化和去磷酸化过程的蛋白激酶和磷酸酶。它可以通过激发、调节诸多信号通路进而参与调控生物体的生长、发育、逆境应激、疾病发生等多种生命过程,一直是生物学研究的重点与热点。蛋白磷酸化是指在激酶催化作用下把ATP或者GTP的磷酸基团(P04)转移到不同种类的氨基酸上(主要包括丝氨酸S、苏氨酸T、酪氨酸Y),从而使蛋白质发生翻译后修饰的过程。常见的蛋白质翻译后修饰包括乙酰化。深圳蛋白质棕榈酰化修饰组学分析价格

蛋白质磷酸化修饰的免疫印迹技术优点:检测特异性高。湖北蛋白质亚硝基化修饰组学质谱分析

蛋白磷酸化检测方法:一、Western Blot检测方法优势:1. WB方法简便,多数实验室具备Western Blot设备条件。2. 许多磷酸化抗体十分灵敏,能够检测低至10ug的蛋白样品。3. 对于丰度低的蛋白,可以先通过IP使用目标蛋白的抗体对目标蛋白进行富集,再进行WB检测被磷酸化的蛋白,检测效率可以提高几倍甚至几十倍。二、质谱检测方法:Western Blot的方法虽然简便,但是对于大规模分析复杂的生物样品的磷酸化水平就不再适用了。而质谱却能很好的解决这一问题。依靠高准确度质谱仪,如今快速准确分析细胞中高丰度蛋白的磷酸化修饰已是非常简单的事。具体的检测方法为先通过SDS-PAGE胶,或者2D-PAGE胶等分离目标蛋白,将含有目标蛋白的条带切下,胰酶消化,LC-MS/MS检测分析蛋白序列和相应位点的磷酸化修饰。这个方法适用于同时检测多个目标蛋白的磷酸化水平。湖北蛋白质亚硝基化修饰组学质谱分析

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