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哈尔滨蛋白质乙酰化修饰组学分析方法

来源: 发布时间:2022-05-29

蛋白质翻译后修饰介绍:蛋白质翻译后修饰(PTMs)是指蛋白质在翻译中或翻译后的化学修饰过程。蛋白质翻译后修饰(PTMs)通过给蛋白质添加磷酸酯,乙酸酯,酰胺基或甲基等官能团增加蛋白质组的功能多样性,并影响正常细胞生物学和发病机理的几乎所有方面。蛋白质翻译后修饰在许多细胞过程中起着关键作用,如细胞分化、蛋白质降解、信号传导和调节过程、基因表达调节以及蛋白质相互作用。蛋白质翻译后修饰PTMs通常包括磷酸化,糖基化,泛素化,亚硝基化,甲基化,乙酰化,脂质化和蛋白水解。因此,PTM的特征(包括修饰类别和修饰位点)在细胞生物学以及疾病诊断和预防研究中至关重要。蛋白质的翻译后修饰过程极其复杂。哈尔滨蛋白质乙酰化修饰组学分析方法

乙酰化修饰蛋白组学介绍:蛋白质乙酰化(Acetylation)是蛋白在乙酰基转移酶(或非酶)的催化下,将乙酰基团转移并添加在蛋白赖氨酸残基或蛋白N端上的过程,在调控蛋白质功能、染色质结构和基因表达中起重要作用。乙酰化修饰主要分为两类:蛋白N端的乙酰化修饰和蛋白赖氨酸上的乙酰化修饰。N端乙酰化修饰大部分发生在真核生物的蛋白上,由N乙酰转移酶(NATs)催化;赖氨酸上的乙酰化修饰是一个可逆的过程,主要由赖氨酸乙酰化酶(KATs)和赖氨酸去乙酰化酶(KDACs)催化。河南蛋白质泛素化修饰组学鉴定蛋白质翻译后修饰组学在细胞生物学以及疾病诊断和预防研究中至关重要。

定量N-糖基化蛋白质翻译修饰组学:蛋白质的N-糖基化位点修饰是重要的蛋白质翻译后修饰之一,主要在复杂的多细胞或组织形成过程中起关键作用。蛋白质的N-糖基化修饰位点具有保守的氨基酸序列NX(S/T)(其中X为除脯氨酸以外的其它氨基酸)凝集素亲和法是目前糖蛋白质组学中应用普遍的分离富集方法。凝集素(lectin)是一类糖结合蛋白质,能专一识别某一特殊结构的单糖或聚糖中特定的糖基序列而与之结合,它们与糖链可逆非共价结合,糖蛋白或糖肽被凝集素捕获之后,通常用特定的单糖通过竞争结合凝集素将糖蛋白或糖肽洗脱下来。

泛素化修饰蛋白质组学:泛素是一种由76个氨基酸组成的多肽,在真核生物中高度保守,可通过异肽键与目标蛋白赖氨酸残基的氨基进行共价连接。泛素化蛋白的富集主要基于标记,泛素用亲和标签(通常为6xHis)进行标记,并通过镍螯合色谱亲和提取泛素化蛋白。由于泛素的C端为Arg-Gly-Gly结构,经胰蛋白酶水解后,Gly-Gly保留在修饰蛋白的肽链上,使肽的质量增加114,因此可作为泛素定位位点的质量标记。用HPLC对样品进行预分离,使用针对特定残留结构的抗体富集泛素化肽,可很大程度上提高泛素化蛋白的浓度。串联质谱可以鉴定泛素化位点。糖基化蛋白质翻译修饰组学主要在复杂的多细胞或组织形成过程中起关键作用。

琥珀酰化修饰蛋白质组技术特点:采用主流抗体亲和富集方法,特异性高,富集效率好;通过高分辨率、高扫描速度的质谱,对富集的琥珀酰化肽段进行大规模鉴定;结合常用的定量技术可对不同样品间的琥珀酰化水平差异进行定量比较。适用范围:药物作用靶点研究;疾病标志物筛选;植物胁迫/抗逆研究;作用机制研究;要求物种具有蛋白质参考数据库、EST序列(转录组)或基因组注释信息。应用方向:线粒体代谢、生物合成与代谢、中心代谢途径、炎症与疾病。蛋白质翻译后修饰 (PTMs) 进一步促进了从基因组水平到蛋白质组复杂性的增加。哈尔滨蛋白质乙酰化修饰组学分析方法

大多数翻译后修饰蛋白以低化学计量和丰度存在,这限制了在分析全细胞裂解液时对其的检测。哈尔滨蛋白质乙酰化修饰组学分析方法

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