蛋白质组学技术：等电聚焦：等电聚焦（isoelectricfocusing，IEF）是一种利用有pH梯度的介质分离等电点不同的蛋白质的电泳技术。等电聚焦凝胶电泳依据蛋白质分子的静电荷或等电点进行分离，等电聚焦中，蛋白质分子在含有载体两性电解质形成的一个连续而稳定的线性pH梯度中电泳。载体两性电解质是脂肪族多氨基多羧酸，在电场中形成正极为酸性，负极为碱性的连续的pH梯度。蛋白质分子在偏离其等电点的pH条件下带有电荷，因此可以在电场中移动；当蛋白质迁移至其等电点位置时，其静电荷数为零，在电场中不再移动，据此将蛋白质分离。蛋白质组结果一般需要做哪些方面的生物信息学分析？湖北TMT／iTRAQ标记定量蛋白质组学研究

蛋白质组学应用领域：1.蛋白质鉴定：能够应用一维电泳和二维电泳并分离相关的技术，应用蛋白质芯片和抗体芯片及共沉淀等技术对蛋白质停止审定研讨。2.修饰：很多mRNA表达产生的蛋白质要阅历后修饰如磷酸化，糖基化，酶原刺激等。修饰是蛋白质调理功用的重要方式，因而对蛋白质后修饰的研讨对说明蛋白质的功用具有重要作用。3、蛋白质功用：如剖析酶活性和酶底物，细胞因子的生物剖析/配基-受体分离剖析。能够应用基因敲除和反义技术剖析基因表达产物-蛋白质的功用。另外对蛋白质表达出来后在细胞内的定位研讨也在水平上有助于蛋白质功用的理解。哈尔滨PRM靶向定量蛋白质组学研究方法蛋白质组研究技术在研究对象上，覆盖了原核微生物、真核微生物、植物和动物等范围。

蛋白质组学植物篇样品寄样要求：植物相较于动物，蛋白占比不高，所以送样在量上面的要求会多一些，推荐送500mg以上的量可以确保实验能够提取到充足的蛋白。如果是种仁、豆类等蛋白含量比较高的，200mg足以完成抽提。处理样本需要用PBS将样本表面的泥土等杂质冲洗干净，去除掉多余的组织。尽量能够保证样本的形态和纯度，不推荐用锡纸包裹，放在EP管中使其形态完整为比较好。用液氮急速冷冻5min后置于-80℃环境中保存，送样时需要添加干冰。

蛋白质组学有什么用，能给我实验带来什么？可以大规模鉴定特定组织、细胞等各种样本的蛋白质种类、修饰状态以及蛋白质之间的相互作用，以及对这些蛋白质功能分析、分类；可以对不同条件下某一特定样本进行大规模的蛋白质(包括翻译后修饰蛋白)表达量变化分析，筛选潜在biomarker，筛选重要信号通路；依托大样本量，可以实现疾病的分子分型分析、重要潜在靶标鉴定。质谱的蛋白质组学和芯片哪个更好出结果？若有对应物种的全基因组并有预测的全蛋白序列库，可优先选择全蛋白序列库；若无全蛋白序列库，有对应物种对应组织的转录组测序结果并，可以使用转录组的测序结果（mRNA三框翻译或者预测CDS，并翻译成氨基酸序列）；若基因组、转录组数据库都没有，优先选择同源性比较接近的物种的全蛋白数据库，若近源物种没有合适的全蛋白库，则选择更大的蛋白全库（如动物全库、绿色植物全库、微生物库等）。我们通过研究蛋白质组，可以为患者提供有用的疾病诊断、预后评估信息。

LabelFree(非标记蛋白质组学技术)：在非标记策略的定量模型中，主要涉及两种不同的算法：其一，以肽段的色谱峰积分面积为基础，通过比较一对生物样品中相对应到蛋白质酶解多肽的色谱积分面积而得到两者的相对丰度；其二，以肽段被质谱检测的计数为基础，通过归一化来表征被检测蛋白质的相对丰度。非标记技术认为肽段在质谱中被捕获检测的频率（Counts）与其在混合物中的丰度成正相关，因此蛋白质被质谱检测的计数反映了蛋白质的丰度，通过适当的数学公式可以将质谱检测计数与蛋白质的量联系起来，从而对蛋白质进行定量。蛋白质组的概念与基因组的概念有许多差别。哈尔滨PRM靶向定量蛋白质组学研究方法

蛋白质组学技术有生物质谱。湖北TMT／iTRAQ标记定量蛋白质组学研究

蛋白组学常见研究模式主要有两种：1.通过蛋白质组学寻找疾病发生的发展的新型标志物；2.结合其它组学建立疾病或者研究主题的表达谱和分子机制。蛋白质组学( proteomics) 是指系统研究某一基因组所表达的所有蛋白质，包括组成蛋白质一级结构的氨基酸序列，蛋白质的丰度，蛋白质的修饰以及蛋白质之间的相互作用。蛋白质组和基因组( genome)在概念上有相关性，表示某一个蛋白质组的蛋白质是由基因组所编码的，然而蛋白质组学和基因组学在研究对象和研究方法上有很大的区别。湖北TMT／iTRAQ标记定量蛋白质组学研究