代谢组学有哪些特点?(1) 代谢处于系统生物学的末端,更能反映基因与外部环境互作的真实情况,因此,在多数生物表型研究上更加适用。(2) 常规代谢组学只关注内源性化合物,也有使用代谢组学技术测定外源性化合物的。内源性化合物的上调和下调指示了与疾病、毒性、基因修饰或环境因子的影响。(3) 高通量定量和定性研究生物小分子化合物。(4) 内源性化合物的结果可以作为疾病的诊断、药物筛选或者其他分型评估等潜在生物标志物。谢组学通过揭示内在和外在因素影响下,生物体的代谢整体的变化轨迹来反映某种生理或病理的一系列发展过程。靶向代谢组学(Trgeted metabolomics)则为目标性代谢组学。武汉个性化定制靶向代谢组学技术服务
选择代谢组学作为科研技术手段的优势有哪些?1、代谢组学的研究处于生物信息流的中游,介于基因、蛋白质和细胞、组织之间,在生物信息的传递中起到承上启下的作用。2、小分子的产生和代谢是基因表达的下游产物,生物体液的代谢产物分析能够更直接,更准确的反映生物体的病理生理状态。3、代谢物的种类少,大约在103个数量级,要远小于基因和蛋白质的数据,物质的分子结构要简单得多,分析起来更简单明了。4、代谢组学的代谢物信息库简单,它远没有全基因组测序及大量表达序列标签的数据库那么复杂。5、基因和蛋白质表达的有效微小变化会在代谢物上得到放大,从而使检测更容易。6、代谢产物在各个生物体系中都是类似的,所以代谢组学研究中采用的技术更容易在各个领域中通用,也更容易被人接受。武汉个性化定制靶向代谢组学技术服务代谢组学先进分析检测技术结合模式识别和**系统等计算分析方法是代谢组学研究的基本方法。
代谢组学可以检测的样品种类有哪些?代谢组学主要研究的是作为各种代谢路径的底物和产物的小分子代谢物(分子量<1000)。其样品主要是血浆或血清,尿液,唾液,以及细胞和组织的提取液。我们也和一些公司或单位(如茶叶公司、制酒公司、酸奶公司、医院等)合作,做过植物,微生物提取物,脑脊液,昆虫血淋巴,羊水,卵泡液,膝盖滑液,眼泪,胎盘,粪便及肠道内容物提取液等。一般代谢组学能检测出多少物质?不同的质谱平台灵敏度及偏向性都不一样,而且不同平台之间具有互补性。一般来说GC/MS检测血清样品能准确定性的物质约200个左右,检测尿液样品定性的物质约200个左右,其他样品(如肝脏,粪便,肠道内容物)也在几百这个数量级。
为什么选择代谢组学作为科研技术手段?1)小分子的产生和代谢是生物机体作用的结果,生物体液的代谢产物分析能够更直接,更准确的反映生物体的病理生理状态。2)基因和蛋白质表达的有效微小变化会在代谢物上得到放大,从而使检测更容易;3)代谢组学的代谢物信息库简单,但它远没有全基因组测序及大量表达序列标签的数据库那么复杂;4)代谢物的种类少,要远小于基因和蛋白质的数据,物质的分子结构要简单得多。5)代谢产物在各个生物体系中都是类似的,所以代谢组学研究中采用的技术更容易在各个领域中通用,也更容易被人接受。代谢组学是系统生物学的组成部分。
代谢组学样本收集指南:1.血浆样本收集:(1)从合适的静脉采集血液(典型10mL)到标记的肝素锂血浆收集管中(肝素锂用作抗凝剂)。(2)立即于4 °C离心(3000g)20min,上清液即为血浆。(3)离心完毕,取出血浆收集管,取上清液(血浆),分等份(0.5mL或0.1mL),转移到冻存管中(冰上),旋盖。(4)保存于-80℃冰箱。寄样需足量干冰。2.血清样本收集:(1)从合适的静脉采集血液(典型10mL)到血清收集管中。(2)将血清收集管冰水浴(4℃)凝集至少1h(2h以内),记录凝集时间。(3)将血清收集管放到冷冻离心机中低温(4℃)离心15min(2500 g)。(4)离心完毕,取出血清收集管,取上清液,分等份(0.5mL或0.1mL),转移到冻存管中(冰上),旋盖。(5)保存于-80℃冰箱。寄样需足量干冰。代谢组学主要研究的是产物的小分子代谢物(MW<1000)。贵州靶向代谢组学
与基因组学和蛋白质组学相比,代谢组学的研究侧重于相关特定组分的共性。武汉个性化定制靶向代谢组学技术服务
代谢组学尿液样本收集:1)取空腹晨尿、中段尿(临床)或晨间1 h尿(动物)于50 mL离心管中;2)4 ℃ 下10000 rpm离心10 min取上清,用1.5 mL离心管分装,保存于-80 ℃。3)动物1 h尿量不够的情况下,可分多次收集尿液;如需收取24 h尿液,需要使用带低温装置的代谢笼收集,并且及时冻存样本。4)收集完尿液样本后,建议使用液氮淬灭15 min后,再分装多管后于-80 ℃冻存。组织样本收集:动物组织(包括脑、心、肝、脾、肺、肾、肌肉和皮肤等;软体动物如血吸虫):1)取适量组织,用预冷的PBS缓冲液或生理盐水清洗干净;2)迅速剥去非必需的脂肪和结缔组织,再用PBS缓冲液或生理盐水冲洗干净;3)用干净的无尘吸水纸吸干水分,将组织分成50-100 mg / 管分装待用;4)管子上做好标记后迅速放入液氮中冷冻处理至少15 min,-80 ℃冻存;干冰运输。武汉个性化定制靶向代谢组学技术服务