代谢组学究竟是一门什么样的研究方向?首先定义什么是代谢组学。简单的说就是研究生物体对内外刺激的整体代谢应答规律。那么为什么代谢组学是基因组,转录组,蛋白质组的下游。我们研究它到底有什么意义。中心法则告诉我们了遗传信息的流向,的执行者蛋白质中很多酶参与了体内的代谢过程。基因测序数量太大,而且基因水平解释问题往往很吃力。因为基因的调控和生物学事件之间隔了一个很漫长的信号转导过程。蛋白同理,一是蛋白种类巨大,二是蛋白组学发展进入瓶颈;发展代谢组是因为代谢物种类只有不到1w种,建立它的差异分析更加简单,同时在价格等方面更有推广的意义。代谢组学的研究方法与蛋白质组学的方法类似。山东LC-MS/MS非靶向脂质组学质谱鉴定
代谢组学适用范围:1、体液:血清、血浆、尿液、唾液、膝盖滑液、脑脊液、卵泡液、牛奶、痰液、舌苔液、胆汁等。2、组织:各种动物组织和植物组织。3、细胞:细胞及细胞培养液等。3、微生物:大肠杆菌、链球菌等。4、其他:粪便、食糜、肠道内容物等。应用领域:1、非靶向代谢物组学结果的验证。2、代谢相关生理、病理研究。3、发酵工艺研究。4、食品科学与营养学研究。非靶向代谢组学分析内容:非靶向代谢组学分析内容大致包括数据的预处理(包括质谱峰提取和质谱峰校正)-数据质控(包括t-检验、主成分分析等)--差异代谢物分析(包括聚类分析、通路注释分析、多组学关联分析等)。脂质代谢组学多质谱鉴定代谢组学是在基因组学和蛋白质组学之后新近发展起来的一门学科。
为什么选择代谢组学作为科研技术手段?1)小分子的产生和代谢是生物机体作用的结果,生物体液的代谢产物分析能够更直接,更准确的反映生物体的病理生理状态。2)基因和蛋白质表达的有效微小变化会在代谢物上得到放大,从而使检测更容易;3)代谢组学的代谢物信息库简单,但它远没有全基因组测序及大量表达序列标签的数据库那么复杂;4)代谢物的种类少,要远小于基因和蛋白质的数据,物质的分子结构要简单得多。5)代谢产物在各个生物体系中都是类似的,所以代谢组学研究中采用的技术更容易在各个领域中通用,也更容易被人接受。
什么是代谢组学?代谢组学是用来解决什么问题的?代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是发展起来的一门新兴学科,是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生物整体或组织的内源性代谢物质的代谢途径及其所受内在或者外在因素的影响及随时间变化的规律。代谢组学通过揭示内在和外在因素影响下代谢整体的变化轨迹来反映某种病理生理过程中所发生的一系列生物事件。代谢组学与临床化学较为相似。
LC-MS非靶向代谢组的优势有什么?1、定性分析结果可靠,可以同时给出每一个组分的分子量和丰富的结构信息;2、检测限低,MS具备高灵敏度,通过选择离子检测(SIM)方式,其检测能力还可以提高一个数量级以上;3、分析时间快,HPLC-MS使用的液相色谱柱为窄径柱,缩短了分析时间,提高了分离效果;4、自动化程度高,HPLC-MS具有高度的自动化。关于质谱,根据质谱的工作原理,质谱又分成了双聚焦质谱仪,四极杆质谱仪,飞行时间质谱仪,离子阱质谱仪,傅立叶变换质谱仪等不同种类。而在实验时,我们可以根据不同需要适当调整仪器组和以及仪器附件。较低的费用,是促使代谢组学在临床上易于接受的另一个原因。四川非靶向代谢组学质谱分析
为什么选择代谢组学作为科研技术手段?山东LC-MS/MS非靶向脂质组学质谱鉴定
代谢组学有哪些研究方式?根据有没有研究目标或方向来确定,在不确定代谢物或者代谢途径时可使用非靶向代谢组学寻找切入点,在有目标时则使用靶向定量进行深入研究,针对性研究脂质的则可以使用脂质组学技术。另外比较新的,谱领生物还提供基于稳定性同位素示踪技术的代谢流组学技术服务来研究代谢流量问题。什么是代谢组学?代谢组学是末期发展起来的一门新兴学科,是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生物整体、组织的内源性代谢物质的代谢途径及其所受内在或者外在因素的影响及随时间变化的规律。代谢组学通过揭示内在和外在因素影响下,生物体的代谢整体的变化轨迹来反映某种生理或病理的一系列发展过程。山东LC-MS/MS非靶向脂质组学质谱鉴定