蛋白质磷酸化修饰定义?在哺乳动物细胞生命周期中,大约有1/3的蛋白质发生过磷酸化修饰,在脊椎动物基因中,约有5%的基因编码的蛋白质是参与磷酸化和去磷酸化过程的蛋白激酶和磷酸酶。它可以通过激发、调节诸多信号通路进而参与调控生物体的生长、发育、逆境应激、疾病发生等多种生命过程,一直是生物学研究的重点与热点。蛋白磷酸化是指在激酶催化作用下把ATP或者GTP的磷酸基团(P04)转移到不同种类的氨基酸上(主要包括丝氨酸S、苏氨酸T、酪氨酸Y),从而使蛋白质发生翻译后修饰的过程。蛋白质的翻译后修饰通过可逆的共价键将小分子或蛋白质与底物蛋白质上特定的氨基酸结合。上海蛋白质乙酰化修饰组学鉴定
琥珀酰化修饰蛋白质组鉴定:蛋白质琥珀酰化修饰是新近发现的一种蛋白质翻译后修饰,是在琥珀酰辅酶 A 的介导下将一个负电荷四碳琥珀酰基转移到赖氨酸残基的伯胺上的过程。赖氨酸琥珀酰化在真核细胞及原核细胞中普遍存在,参与调控包括三羧酸循环,氨基酸代谢以及脂肪酸代谢在内的多个代谢信号通路。琥珀酰化蛋白质组以组织、细胞等较为复杂样本为研究对象,目的在于鉴定样品中发生琥珀酰化修饰的蛋白质以及相应的琥珀酰化修饰位点。琥珀酰化修饰蛋白质组技术特点:采用主流抗体亲和富集方法,特异性高,富集效率好。上海蛋白质琥珀酰化修饰组学鉴定蛋白质翻译后修饰组学有什么重要的作用呢?
琥珀酰化修饰蛋白质组技术特点:采用主流抗体亲和富集方法,特异性高,富集效率好;通过高分辨率、高扫描速度的质谱,对富集的琥珀酰化肽段进行大规模鉴定;结合常用的定量技术可对不同样品间的琥珀酰化水平差异进行定量比较。适用范围:药物作用靶点研究;疾病标志物筛选;植物胁迫/抗逆研究;作用机制研究;要求物种具有蛋白质参考数据库、EST序列(转录组)或基因组注释信息。应用方向:线粒体代谢、生物合成与代谢、中心代谢途径、炎症与疾病。
乙酰化修饰蛋白组学介绍:蛋白质乙酰化(Acetylation)是蛋白在乙酰基转移酶(或非酶)的催化下,将乙酰基团转移并添加在蛋白赖氨酸残基或蛋白N端上的过程,在调控蛋白质功能、染色质结构和基因表达中起重要作用。乙酰化修饰主要分为两类:蛋白N端的乙酰化修饰和蛋白赖氨酸上的乙酰化修饰。N端乙酰化修饰大部分发生在真核生物的蛋白上,由N乙酰转移酶(NATs)催化;赖氨酸上的乙酰化修饰是一个可逆的过程,主要由赖氨酸乙酰化酶(KATs)和赖氨酸去乙酰化酶(KDACs)催化。蛋白质磷酸化修饰的免疫印迹技术优点:检测特异性高。
泛素化修饰蛋白质组学的作用:泛素化、心血管等疾病的发病密切相关。因此,作为近年来生物化学研究的一个重大成果,它已然成为研究、开发新药物的新靶点。技术原理是首先将蛋白样本酶解成肽段混合物,然后使用液相色谱对酶解后的肽段混合物进行组分分离以降低样本复杂程度,然后通过高质量的泛素化修饰抗体和生物材料对修饰肽段进行富集,之后上样至液相色谱-串联质谱中进行分析定量。技术优势:高特异性的修饰抗体;高分辨率、高灵敏度质谱仪;鉴定通量高;可与代谢组学等进行多组学联合分析。目前对乙酰化修饰的功能研究主要集中在对细胞转录调控,以及对代谢通路的调控这两个方面。上海蛋白质琥珀酰化修饰组学鉴定
蛋白质乙酰化也是一种可逆的酶促反应过程。上海蛋白质乙酰化修饰组学鉴定
蛋白质翻译后修饰:蛋白质翻译后修饰 (Protein translational modifications,PTMs) 通过功能基团或蛋白质的共价添加、调节亚基的蛋白水解切割或整个蛋白质的降解来增加蛋白质组的功能多样性。这些修饰包括磷酸化、糖基化、泛素化、亚硝基化、甲基化、乙酰化、脂质化和蛋白水解,几乎影响正常细胞生物学和发病机制的所有方面。因此,识别和理解 PTM 在细胞生物学和疾病疗理和预防的研究中至关重要。蛋白质翻译后修饰 (PTMs) 进一步促进了从基因组水平到蛋白质组复杂性的增加。PTMs 是一种化学修饰,在功能蛋白质组中发挥关键作用,因为它们调节活性、定位以及与其他细胞分子(如蛋白质、核酸、脂质和辅助因子)的相互作用。上海蛋白质乙酰化修饰组学鉴定