蛋白质-蛋白质相互作用是蛋白质发挥功能的主要机制之一,在DNA损伤修复,自噬和代谢等过程中都扮演着非常重要的角色,蛋白相互作用异常便会导致疾病的发生.在蛋白质的赖氨酸,丝氨酸和苏氨酸等氨基酸残基上,可发生甲基化,乙酰化,磷酸化和泛素化等200多种翻译后修饰,这些修饰通常能改变蛋白质的电性,疏水性和空间结构等属性,为与之结合的蛋白提供结合的锚定或产生位阻效应,像一把开关在时空上精确调控蛋白质-蛋白质相互作用的发生以及动态变化.结构研究表明,蛋白质之间的相互作用通常由临近的几个氨基酸残基直接结合,替换该区域的氨基酸残基,通常能破坏结合,使其失去部分功能或酶活性,可以针对性地开发和设计抑制剂,用于疾病的诊疗。蛋白质翻译后修饰的作用主要是改变蛋白质的定位。浙江亚硝基化修饰蛋白质组学研究

蛋白质乙酰化修饰组学技术：乙酰化修饰是体内保守的可逆转的蛋白修饰，对细胞核内转录调控因子的刺激有着重要的作用。此外，还存在的非组蛋白乙酰化修饰参与了代谢通路及代谢酶活性的调节。采用肽段预分离降低高丰度组蛋白对蛋白乙酰化鉴定的影响，再结合免疫共沉淀通过抗体富集乙酰化的肽段，从而实现乙酰化的鉴定及定量。样品要求：1、SDS-PAGE条带：5个以上可见考染条带。2、溶液（目标蛋白质）：目标蛋白总量>50μg，目标蛋白浓度>80%。3、溶液（大规模混合蛋白质）：蛋白总量>1mg，蛋白浓度>1μg/μl。山东蛋白质翻译后修饰组学质谱分析质谱可以分辨蛋白质修饰前和修饰后分子量上的变化。

蛋白质磷酸化修饰组学：磷酸化蛋白质是由蛋白激酶将ATP或GTP分子上的磷酸基团转移到底物蛋白特定的氨基酸侧链上形成的。蛋白质磷酸化是一种可逆的蛋白质翻译后修饰。在哺乳动物的细胞生命周期中，至少有三分之一的蛋白质发生磷酸化修饰。磷酸化修饰参与许多信号转导途径和细胞代谢过程，且许多已知的疾病也与蛋白质的异常磷酸化有关。因此，对磷酸化蛋白质组进行定量研究，寻找差异表达的磷酸化蛋白质，有助于发现疾病的生物标志物和寻找新的具有诊疗潜力的药物靶标。

蛋白质学组翻译后修饰的研究策略：自中而下：自中而下的分析方法是自下而上分析方法的一种替代方法，分析组蛋白时其原理类似于自下而上分析策略。在使用这种分析方法时，通常需要将被检测蛋白质消化成3-9kDa范围内的肽段，因此也无法保证检测到的肽段的完整性。但是，由于仪器的进步和保留了组蛋白尾部的组合修饰，自中而下分析法正逐渐受到欢迎。自中而下更接近于自下而上法的灵敏度。自上而下：自上而下技术可以直接对完整的蛋白质进行测序，包括翻译后修饰的蛋白质和其他大的蛋白质片段，而不只是肽段。这可以比较大程度地保留与PTMs相关的信息，使其适用于组蛋白的全方面表征和分析。自上而下技术对蛋白质的有效分辨率已达到229kDa，一次可以检测到的蛋白质数量也在增加。在细胞中，乙酰化修饰的反应由乙酰基转移酶所催化，将乙酰辅酶A的乙酰基转移并添加在蛋白质赖氨酸残基上。

蛋白质翻译后修饰：蛋白质的翻译后修饰通过可逆的共价键将小分子或蛋白质与底物蛋白质上特定的氨基酸结合，调控着底物的酶活性、功能以及三级结构的变化。各种蛋白质翻译后修饰在信号通路和网络中发挥着重要的作用，翻译后修饰系统的紊乱将导致一系列疾病的发生。通过实验的方法鉴定蛋白质翻译后修饰的位点需要耗费大量的资金和时间，并且酶反应的优化常常难以实现。而计算的方法则能够快速、准确的预测酶特异性的底物蛋白质及其修饰位点。目前对乙酰化修饰的功能研究主要集中在对细胞转录调控，以及对代谢通路的调控这两个方面。山东琥珀酰化修饰蛋白质组学服务

常见的蛋白质翻译后修饰包括泛素化。浙江亚硝基化修饰蛋白质组学研究

蛋白质翻译后修饰组学：蛋白质翻译后修饰(Post-translational modification, PTM)是指对翻译后的蛋白质进行共价加工的过程。它通过在一个或多个氨基酸残基加上修饰基团，可以改变蛋白质的物理、化学性质，进而影响蛋白质的空间构象和活性状态、亚细胞定位、折叠及其稳定性以及蛋白质-蛋白质相互作用。蛋白质翻译后修饰的丰度变化在生命活动研究中具有重大意义，异常的翻译后修饰会导致多种疾病的发生。质谱可以分辨蛋白质修饰前和修饰后分子量上的变化，因此只要知道靶蛋白翻译后修饰前后分子量的变化,就能对翻译后修饰方式进行鉴定和定量。浙江亚硝基化修饰蛋白质组学研究

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