什么是蛋白质的翻译后修饰?蛋白质的翻译后修饰()是指蛋白质在翻译后的化学修饰。对于大部分的蛋白质来说,这是蛋白质生物合成的较后步骤。PTM是细胞信号传导中的重要组成部分。通过向修饰基团添加一个或多个氨基酸残基或通过蛋白质水解切割该基团来改变蛋白质的性质,是蛋白质生物学功能表达的重要步骤。生物蛋白质的翻译后修饰极大地增加了蛋白质结构的类型和功能。这个过程调节细胞周期和蛋白质转录,并影响表观遗传学。乙酰化修饰是原核和真核生物所共有的一种翻译后修饰类型。南京琥珀酰化修饰蛋白质组学技术服务
蛋白质学组翻译后修饰的类型:翻译后修饰的类型包括N端fMet或Met的去除、二硫键的形成、化学修饰和肽键的裂解,其中磷酸化是比较常见的。蛋白质的化学修饰反应是在维持蛋白质的完整性和功能性的基础上,通过基于其氨基酸残基的化学反应获得新的生物结合物。翻译后修饰在哪里发生?翻译后修饰主要发生在氨基酸侧链或蛋白质的C端或N端。现有的官能团或新官能团的引入可被用于修饰蛋白质,以扩展20个标准氨基酸的化学组成。翻译后修饰的位点通常带有可以在化学反应中充当亲核试剂的官能团,如丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸的羟基;赖氨酸、精氨酸和组氨酸胺形式;同时,在蛋白质的N端和C端,天冬酰胺也可作为翻译后修饰中的一种聚糖连接点。翻译后修饰也发生在氧化的蛋氨酸和侧链位点的一些亚甲基上。上海蛋白质泛素化修饰组学质谱鉴定在蛋白翻译后修饰方式的鉴定过程中,蛋白会首先被酶切成肽段,然后进入质谱进行分析。
蛋白质翻译后修饰组学:血浆蛋白糖基化修饰分析:蛋白质糖基化指碳水化合物通过共翻译或翻译后修饰的方式附着到蛋白质上的过程,是一种常见的蛋白质翻译后修饰。分泌的细胞外蛋白常被糖基化,糖基化蛋白通常是重要的整合膜蛋白。血浆中的蛋白质包括维持机体正常生理状态的蛋白质和机体分泌、渗漏、脱落的蛋白质,其中不乏存在一些糖基化蛋白质。而蛋白质糖基化修饰不只影响蛋白质的空间构象、生物活性、运输和定位,而且在分子识别、细胞通信、信号转导等特定生物过程中发挥着至关重要的作用。因此对血浆蛋白糖基化进行分析,有助于研究血浆蛋白的生理功能等。
蛋白质乙酰化修饰组学定量分析:1. SILAC细胞标记,组织/细胞破碎,提取、提纯目的蛋白质(基于SILAC的乙酰化修饰组学定量)。2. 使用胰蛋白酶将目的蛋白酶解成多肽片段。3. 对多肽片段进行iTRAQ标记(基于iTRAQ的乙酰化修饰组学定量)。4. 使用高效特异性乙酰化抗体对乙酰化修饰肽段进行免疫富集。5. 使用LC-MS/MS对富集的乙酰化肽段进行序列分析。6. 数据分析,比对不同样本中蛋白乙酰化修饰水平差异,并对产生变化的生物学意义进行解释。蛋白质翻译后修饰组学磷酸化修饰具有灵活的特性。
蛋白质学组翻译后修饰分析:组蛋白是一类高度保守的蛋白质,是染色质的关键成分,是DNA包装的结构单位。组蛋白的功能受其翻译后修饰介导。组蛋白翻译后修饰包括通过丝氨酸或苏氨酸残基的磷酸化,赖氨酸或精氨酸的甲基化,赖氨酸的乙酰化和脱乙酰基,赖氨酸的泛素化和磺酰化等对组蛋白进行的共价修饰。组蛋白这些修饰对于核完整性至关重要,因为它们可以调节染色质结构并募集参与基因调节、DNA修复和染色体浓缩的酶。组蛋白的翻译后修饰大多位于N末端的尾巴上,因为N末端是蛋白质中比较暴露和比较灵活的区域。分析组蛋白翻译后修饰有助于探索组蛋白修饰与染色体浓缩、DNA转录等生物功能之间的关系。蛋白质翻译后修饰组学磷酸化修饰具有简单的特性。贵州棕榈酰化修饰蛋白质组学
蛋白磷酸化修饰过程是通过蛋白激酶催化,将磷酸基团从ATP转移到多肽底物的丝氨酸、或酪氨酸残基上。南京琥珀酰化修饰蛋白质组学技术服务
蛋白磷酸化检测方法:一、Western Blot检测方法优势:1. WB方法简便,多数实验室具备Western Blot设备条件。2. 许多磷酸化抗体十分灵敏,能够检测低至10ug的蛋白样品。3. 对于丰度低的蛋白,可以先通过IP使用目标蛋白的抗体对目标蛋白进行富集,再进行WB检测被磷酸化的蛋白,检测效率可以提高几倍甚至几十倍。二、质谱检测方法:Western Blot的方法虽然简便,但是对于大规模分析复杂的生物样品的磷酸化水平就不再适用了。而质谱却能很好的解决这一问题。依靠高准确度质谱仪,如今快速准确分析细胞中高丰度蛋白的磷酸化修饰已是非常简单的事。具体的检测方法为先通过SDS-PAGE胶,或者2D-PAGE胶等分离目标蛋白,将含有目标蛋白的条带切下,胰酶消化,LC-MS/MS检测分析蛋白序列和相应位点的磷酸化修饰。这个方法适用于同时检测多个目标蛋白的磷酸化水平。南京琥珀酰化修饰蛋白质组学技术服务
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