定量蛋白质组学方法学介绍:iTRAQ:iTRAQ定量是目前定量蛋白质组学应用比较普遍的技术,该技术的关键原理是多肽标记和定量,将多肽的含量转化为114、115、116和117同位素的含量(或113、114、115、116、117、118、119和121的8标记),从而简化了定量的复杂性,然后通过多肽定量值回归到蛋白的定量值,从而测定出不同样本之间蛋白质的差异。iTRAQ定量不依赖样本,可检测出较低丰度蛋白,胞浆蛋白、膜蛋白、胞外蛋白等,且定量准确,可同时对8个样本进行分析,并可同时得出鉴定和定量的结果,特别适用于采用多种处理方式或来自多个处理时间的样本的差异蛋白分析。质谱技术相较于传统蛋白质鉴定技术而言,拥有灵敏、准确、高通量、自动化等特点。贵阳PRM定量蛋白质组学技术
蛋白组学研究怎么做?PRM:平行反应监测(ParallelReactionMonitoring)是一种基于高分辨、高精度质谱的离子监视技术,能够对目标蛋白质、目标肽段(如发生翻译后修饰的肽段)进行选择性检测,从而实现对目标蛋白质/肽段进行一定定量,因此也被称之为基于液相色谱质谱联用技术的WesternBlot(LC-MSMSbasedWesternBlot,L-WB)。PRM技术基于Q-Orbitrap为表示的高分辨、高精度质谱平台,首先利用四级杆质量分析器的选择能力,用Q1选择目标肽段的母离子,随后在Collisioncell中对母离子进行碎裂,之后利用Orbitrap分析器在二级质谱中检测所选择的母离子窗口内的所有碎片信息。这样即可对复杂样本中的目标蛋白质/肽段进行准确地特异性分析。济南外泌体蛋白质组学质谱分析蛋白质组学包括蛋白质的表达水平。
定量蛋白质组学技术:定量蛋白质组学技术主要分为标记(label)和非标记(labelfree)定量策略,标记策略又分为体内标记和体外标记两种。细胞内蛋白质组丰度的动态变化对各种生命过程有重要影响。例如在许多疾病的发生和发展进程中,常常伴随着某些蛋白质的表达异常。定量蛋白质组学就是把一个基因组表达的全部蛋白质或一个复杂的混合体系中所有的蛋白质进行精确的定量和鉴定。非标记(labelfree)的定量蛋白组学技术,Labelfree定量蛋白组学技术是通过液质联用技术对蛋白质酶解肽段进行质谱分析,无需使用昂贵的稳定同位素标签做内部标准,只需分析大规模鉴定蛋白质时所产生的质谱数据,比较不同样品中相应肽段的信号强度,从而对肽段对应的蛋白质进行相对定量。
蛋白组学技术:质谱技术相较于传统蛋白质鉴定技术而言,拥有灵敏、准确、高通量、自动化等特点。质谱鉴定蛋白质的基本原理是先将样品分子离子化,然后根据不同离子之间的质荷比差异来分离并确定蛋白质的相对分子质量。根据蛋白质酶解后所得到的肽质量指纹图谱、肽序列标签、和肽阶梯序列去检索蛋白质或核酸序列数据库,质谱技术可达到对蛋白质的快速鉴定和高通量筛选。因产生离子的方法不同而发展起来的质谱包括基质辅助激光解吸离子化质谱、电喷雾离子化质谱、表面增强激光解吸离子化质谱等。蛋白质组的概念指由一个基因组,或一个细胞、组织表达的所有蛋白质。
蛋白质组学,指对某一基因组所表达的所有蛋白质及其特征进行大规模、系统化地研究,以期望在蛋白质水平上解释控制复杂的生命活动的分子网络。研究的内容主要包括:组成蛋白质一级结构氨基酸的序列特征、蛋白质的丰度、蛋白质活性、蛋白质的修饰、亚细胞定位和三维结构、蛋白质之间的相互作用以及对蛋白质的高阶复合物结构。质谱技术的发展为这些研究提供了有力的技术支撑,使得许多有实际应用的蛋白质组功能研究成为可能,包括翻译后修饰的整体分析,蛋白质相互作用网络的重建和模式生物蛋白表达谱的定量研究;在临床医学和转化医学研究中也越来越多地应用到蛋白质组学技术。在对早老性痴呆等人类重大疾病的临床诊断和治理方面蛋白质组技术也有十分诱人的前景。济南外泌体蛋白质组学质谱分析
蛋白质组学与其它学科的交叉也将日益明显和重要。贵阳PRM定量蛋白质组学技术
蛋白质组学在医疗和健康方面有什么应用?基于质谱的蛋白质组学是目前比较主流的高通量蛋白质研究手段,当前在医疗健康方面的应用主要集中于基础研究和转化医学。随着质谱、系统生物学、生物信息学等相关学科的发展,我认为今后我们会更多地在现实生活中见到蛋白质组学相关的应用。如定量胰岛素、鉴定血红蛋白氨基酸突变(镰刀形红细胞症)、糖化血红蛋白比例测定等。从测试体量估计,应该远小于1%的ELISA测试量。由于成本和通量等原因,蛋白质组学技术并不如ELISA适合大量的日常分析。但对于一些分析有问题的项目,采用基于质谱(或二维胶等手段)的蛋白质组学有独特的技术优势。另外,蛋白质组学方法开发和验证周期短,在中高级特殊应用(如极少使用的特殊蛋白指标临床检测、未知疾病研究和控制)中也有其独特优势。贵阳PRM定量蛋白质组学技术
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