利用SYBR Green I可以检测PCR反应中获得的全部双链DNA,但是不能区分不同的双链DNA。为了进一步确保荧光检测的就是靶DNA序列，人们又设计了能与目的DNA序列特异结合的荧光探针，如TaqMan探针。TaqMan探针是一小段被设计成可以与靶DNA序列中间部位结合的单链DNA（一般为50-150 bp）,并且该单链DNA的5'和3'端带有短波长和长波长两个不同荧光基团。这两个荧光基团由于距离过近，在荧光共振能量转移（FRET）作用下发生荧光淬灭，因而检测不到荧光。PCR反应开始后，随着双链DNA变性产生单链DNA，TaqMan探针结合到与之配对的靶DNA序列上，并被具有外切酶活性的Taq DNA聚合酶逐个切除而降解，从而解除荧光淬灭的束缚，荧光基团在激发光下发岀荧光，所产生的荧光强度直接反映了被扩增的靶DNA总量。qPCR面对小的差异较弱，dPCR则可识别差异较小的拷贝数。荧光定量qPCR仪型号

检测原理：将一个样本分成几十到几万份，再将其分配到不同的反应单元中，使每个微滴单元包含一个或多个拷贝的核酸分子（即DNA模板），每个单元都会对目标分子进行扩增，检测PCR扩增产物的荧光信号强度，带入泊松分布即可计算出起始模板DNA浓度。dPCR原理:微滴式数字PCR检测流程：其方法与qPCR类似，分为以下几步。:1、DNA提取2、DNA浓度检测并稀释。3、配置PCR反应液。4、上机到PCR仪中进行检测。5、PCR扩增。6、结果判读。使用微滴数字PCR仪逐个对每个微滴进行检测，有荧光信号的微滴判读为1，没有荧光信号的微滴判读为0，终根据泊松分布原理以及阳性微滴的比例，计算出DNA浓度。

珠三角小巧qPCR仪使用说明实时荧光定量PCR是一种采用外标准曲线定量的方法。

1983年，美国化学家Kary Mullis发明了聚合酶链反应技术(polymerase chain reaction， PCR)，这一技术将DNA聚合酶的特性结合核酸双链的变性复性特性，采用适温延伸、高温变性以及低温复性，让目的核酸片段实现了特异性体外扩增，可将极微量的目标DNA特异地扩增上百万倍，从而提高对DNA分子的分析和检测灵敏度。尤其是耐热DNA聚合酶的发现，更是极大地促进了PCR技术在分子生物学科研，及临床分子诊断领域的广泛应用。常用的 PCR 技术包括逆转录PCR（Reverse Transcription PCR，RT-PCR）和实时荧光定量PCR（Real-time Quantitative PCR，qPCR）等。

所有仪器的操作都基本一致。设置的时候包括反应板设置（plate setup）和程序设置（program setup）。我们以 ABI StepOne为例，详细看一下反应设置：A. 首先是实验目的选择：定量还是其他。我们命名为“BioTeke”，进行“定量”实验。B. 实验方法的选择：我们选用的比较Ct的SYBR Green方法， Fast程序，以cDNA为模板进行。C. 目的基因的设置：有几个目的基因和目的基因的名称。D. 样品的设置：包括哪个是实验组，哪个是对照组。以及负对照的设置和生物重复的设置。E. 对照组和内参基因的设置：这个是为后面的定量做准备F. 反应程序的设置：PCR反应程序的设置要根据不同公司的MasterMix。比如BioTeke的95℃ 2分钟就可以DNA聚合酶（ABI的需要10 分钟）。循环反应是95℃15秒，60℃15秒的40个循环。溶解曲线程序采用仪器默认设置就可以。或者是仪器说明书上建议的程序。G. 反应体系的设置：A-G这五个步骤简单设置好，可以保存，修改反应程序或者立刻进行反应。

qpcr在扩增每个循环中模板DNA通过变性、复性、延伸三个阶段形成更多的子代DNA，为下一个循环提供模板DNA。

定量方法包括相对定量和定量，两者的重要差异在于相对定量的结果是差异性的结果，涉及比较；而定量的结果是一个具体数值，对于基因表达量而言是基因的拷贝数，不涉及任何比较。相对定量首先需要确定一个内参基因，内参基因作用有检测样本材料中RNA是否降解、纠正样本加样的差异、校正cDNA合成速率差异及校正PCR抑制剂的影响，其本质作用是利用内参基因的Ct值对目的基因的Ct值进行均一化处理，常用的内参基因包括DH、β-actin、18S rRNA，使用的时候需要注意其序列必须是物种本身的特异序列，虽然其比较保守，但不同物种也会存在碱基差别。另外，相对定量需要确定参照物，因为涉及比较，参照物选择不同，所得的定量结果可能完全相反，经常选择的参照物一般是对照组或未处理组。QPCR用于基因表达研究、转基因研究，药物疗效考核、病原体检测等诸多领域。珠三角小巧qPCR仪使用说明

在进行大量SNP标记分型时无需合成荧光探针和荧光引物。可以的节省实验成本。荧光定量qPCR仪型号

qPCR的实质就是PCR反应，只是在扩增产物上增加了荧光标记，通过仪器对荧光信号进行采集。荧光信号的强度与扩增得到的dsDNA的浓度成正比，因此非理想条件下的PCR荧光强度Rn=R0+YnRs＝RB+Y0(1+Ex)^nRs （Rn：第n次循环时荧光信号强度，R0：背景信号强度，Rs：每个分子的荧光强度），通过对采集荧光信号就能进行初始模板定量、基因表达量的研究。通过对PCR过程中荧光信号的实时监测，荧光强度的变化趋势，呈现出一条S型曲线即“扩增曲线（Amplication plot）”，分为四个时期：基线期、指数扩增期、线性增长期、平台期。荧光定量qPCR仪型号

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