单细胞转录组学技术：单细胞转录组目前主要有三种方法：SMART扩增技术、10×genomics技术及Andeplete技术。SMART扩增技术比较关键的技术，就是设计了2个特殊的引物。再配合用MMLV逆转录酶进行逆转录。特殊引物1由中间PolyT序列加上一段通用序列及3’末端两个简并碱基构成，但在PolyT的3’端倒数第二个碱基是A、C、G而非T的简并碱基，而倒数第1个为简并碱基，这样做的好处是让它正好结合在mRNA的3’端连到Poly(A)尾巴的这个连接处，而不会结合到mRNA的别的地方。这样就保证了逆转录的起始位置正好是mRNA的3’端的序列终止位置。MMLV逆转录酶，这个酶有个特点，就是它在转录到mRNA的5’端末端的时侯，会在新合成的cDNA的3’末端，多加出几个C碱基来。转录组具有时间特异性的特点。杭州mRNA-seq转录组学研究方法

RNA-Seq，是基于新一代测序技术的转录组学研究方法：首先提取生物样品的全部转录的RNA并进行mRNA富集，然后反转录为cDNA后进行的新一代高通量测序，在此基础上进行片段的拼接组装，从而可得到一个个的转录本，进而可以形成对该生物样品当前发育状态的基因表达状况的全局了解。不同阶段或部位的生物样品的RNA-Seq转录组进行比较分析，则可以在转录层面得到基因表达水平的变化，针对关键基因则可以进行代谢通路（Pathway）的构建。转录组学即特定细胞在某一功能状态下转录出来的所有RNA的总和，包括mRNA和非编码RNA。贵州高通量转录组学质谱鉴定普通转录组测序主要适用于不同的生长阶段或者发育过程。

转录组学的概念：转录组是指特定组织或细胞在某一发育阶段或功能状态下转录出来的所有RNA的汇合，包括蛋白质编码的信使RNA和非编码RNA（rRNA、tRNA和其他ncRNAs），高通量测序技术也被称为下一代测序（NGS）技术，推进了基因组学的研究进展。该项新技术除了研究静态基因组，近年来也开始应用于动态转录分析，由此衍生的技术称为RNA序列分析（RNA-seq）随着DNA基因芯片技术的快速发展，开创了这个病症近十年的高通量转录组研究。RNA-Seq技术可以从转录水平检测瘤中的改变基因。通过相关软件分析，鉴定相关改变基因在瘤发生的发展中所起的作用。然后经过刷选，进一步挑选出相关靶基因进行实验研究，有望为瘤的基因医治提供新的靶点。

宏转录学组概念：宏转录组测序是对某一特定时期、特定环境样品中的全部微生物的RNA进行高通量测序，直接获得该环境中所有微生物转录组信息的一种测序技术的新应用。宏转录组中不只包含有微生物的物种信息，还有微生物的基因表达信息。如果说宏基因组能告诉我们微生物群，那么宏转录组则能告诉我们这些微生物，这有助于挖掘微生物功能基因和探索微生物与环境、疾病、动植物等关系的机制。宏转录组分析：从以G为单位的高通量测序数据中获取研究所需的微生物种类、基因、通路等信息是进行宏转录组研究必须经历的一步。现在网络上分析组学数据的工具五花八门。能否从众多组学工具中选择出适合分析宏转录组数据的软件，能否搭建一套完整、快速、高效、灵敏、高精确的宏转录组分析pipline，直接关乎到后期数据分析的进行。转录组学包括：mRNA、ncRNA、rRNA等。

全转录组学测序技术优势：文库优化：针对不同长度的序列采用两种文库构建方法，采用去核糖体的链特异性文库可以获得mRNA、lncRNA和circRNA的序列信息。数据全：全转录组测序完成后可获取4类主要RNA（miRNA，mRNA，lncRNA，circRNA）数据，可对这些数据进行标准分析及整合分析。关联全：通过对mRNA/miRNA/lncRNA/circRN序列测定及后续分析，深入开展全转录组调控网络(ceRNA网络)分析。样本类型：细胞，组织，体液、血清、血浆、全血，总RNA等。建议总RNA起始量：＞15μg，浓度≥200ng/μL）。转录组学可应用于炎症发生机制的发现及干预。杭州mRNA-seq转录组学研究方法

转录组学是从RNA水平研究基因表达的情况。杭州mRNA-seq转录组学研究方法

单细胞转录组学基本概念：普通转录组的思路也可以应用到单细胞转录组。普通转录组相当于把一群细胞混合到一起去提取RNA，获得的是每个细胞中RNA表达量的平均值。单细胞是把每个细胞单独分出来去提取RNA，然后建库测序，获得是是单个细胞的表达值。在每个细胞里面基因的表达具有随机性，且存在异质性。而且这些细胞群中会存在不同类型的细胞，尤其是当我们对整个组织进行测序时，它们本身就是由不同类型的细胞组成的，而我们用普通转录组来测序，相当于掩盖住了这些不同的细胞类型的差异，展示的是整个组织的平均的状态，所以说单细胞从这个来看跟普通转录组就不同在是用一个细胞测，不是用一堆细胞测。杭州mRNA-seq转录组学研究方法

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