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武汉非靶向代谢组学技术服务

来源: 发布时间:2022-01-15

靶向代谢组学:靶向代谢组学(Targeted Metabolomics)是代谢组学研究的重要组成部分,也是全代谢组研究的延伸与拓展。相对于全代谢组分析而言,靶向代谢组分析具有特异性强,检测灵敏度高和定量准确等几个特点。通过对血液、尿液或其他体液以及组织中某一特定的代谢物的富集与准确定量定性分析,一方面可以结合其它实验数据揭示相关的分子生物学作用机制,另一方面,也可以为后续代谢分子标志物的深入研究和开发利用提供有力支持。靶向代谢组学可以用于:验证有非靶向代谢组学实验提出的假说;进行基于假说的探索性实验,针对特定代谢物,研究代谢模型。代谢组学是系统生物学的组成部分。武汉非靶向代谢组学技术服务

代谢组学研究方法:代谢组学的研究方法与蛋白质组学的方法类似,通常有两种方法。一种方法称作代谢物指纹分析 (metabolomic fingerprinting),采用液相色谱-质谱联用(LC-MS)的方法,比较不同血样中各自的代谢产物以确定其中所有的代谢产物。从本质上来说,代谢指纹分析涉及比较不同个体中代谢产物的质谱峰,然后了解不同化合物的结构,建立一套完备的识别这些不同化合物特征的分析方法。另一种方法是代谢轮廓分析(metabolomic profiling),研究人员假定了一条特定的代谢途径,并对此进行更深入的研究。上海动物靶向代谢组学鉴定什么是非靶向代谢组学、靶向代谢组学?

代谢组学究竟是一门什么样的研究方向?首先定义什么是代谢组学。简单的说就是研究生物体对内外刺激的整体代谢应答规律。那么为什么代谢组学是基因组,转录组,蛋白质组的下游。我们研究它到底有什么意义。中心法则告诉我们了遗传信息的流向,的执行者蛋白质中很多酶参与了体内的代谢过程。基因测序数量太大,而且基因水平解释问题往往很吃力。因为基因的调控和生物学事件之间隔了一个很漫长的信号转导过程。蛋白同理,一是蛋白种类巨大,二是蛋白组学发展进入瓶颈;发展代谢组是因为代谢物种类只有不到1w种,建立它的差异分析更加简单,同时在价格等方面更有推广的意义。

药物代谢和代谢组学区别:代谢组学与药物代谢不同是它关注的对象不是外源性的药物而是生物体本身就有的内源性代谢物。这些代谢物是糖,脂肪,蛋白质,核酸,胆汁酸等等代谢得到的。还有共生菌代谢的,是一个庞大的混合物。目的是通过样本的对比,发现潜在标志物,指导疾病早期诊断甚至基因水平的研究。而药物代谢的目标是只要只要追踪到这种药物分子在体内变化就好,相当具有靶向性,因此使用的技术手段就是LC-MS。检测药物的中间体,和具体的药效,药代动的效应。与其他“组学”研究相比,代谢组学的费用更低。

代谢组学比较常用到的数据分析方法:多变量分析:多变量分析方法能同时处理数百或数千个变量,并且能处理变量之间的相互关系。利用变量之间的协方差或相关性,使原始数据在较低维空间上的投影能尽可能地捕获数据中的信息。但是如果存在大量无信息变量可能会妨碍多变量分析的能力,无信息变量的数量越多,减少真阳性数量的效果就越明显。多变量分析分为无监督分析方法和有监督分析方法。在代谢组学分析中无监督学习有主成分分析只需要数据集X,而有监督分析方法主要是偏比较小二乘判别分析和正交偏比较小二乘判别分析,这类方法在分析时除了需要数据集X,还需对样品进行指定并分组, 这样分组后模型将自动加上另外一个隐含的数据集Y,通常Y的赋值用-1/1或者0/1表示类别信息。代谢组学的研究介于基因、蛋白质和细胞、组织之间。脂质代谢组学多研究

代谢组学技术可应用于疾病早期诊断。武汉非靶向代谢组学技术服务

代谢组学样本收集植物组织:叶片、茎、花:1)取整片叶片/一段茎/一朵花,放入离心管或锡箔纸中并标记,迅速放入液氮中冷冻处理至少15 min。2)将装有样本的离心管迅速放入自封袋中(每组一袋),在自封袋中放入标签纸注明样本信息。3)迅速放入-80 ℃冰箱冻存。足量干冰寄送。注意:(1)采集叶片样本时,在中午光照好的时间收集。(2)采集样本时保持样本一致性,尤其是同一组样本(颜色、衰老程度、叶脉占比、光照、位置等)。根:1)取整株植物的根部,迅速用PBS缓冲液或者超纯水漂洗掉根上的泥土、培养基或营养液等;2)吸水纸吸干水分后,分装为500 mg/管;3)标号后迅速放入液氮中冷冻处理至少15 min,-80 ℃冻存,干冰寄送。武汉非靶向代谢组学技术服务

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