代谢组学概念：基因与蛋白质的表达紧密相连，而代谢物则更多地反映了细胞所处的环境，这又与细胞的营养状态，药物和环境污染物的作用，以及其它外界因素的影响密切相关。因此有人认为，“基因组学和蛋白质组学告诉你什么可能会发生，而代谢组学则告诉你什么确实发生了。”代谢组学的概念来源于代谢组，代谢组是指某一生物或细胞在一特定生理时期内所有的低分子量代谢产物，代谢组学则是对某一生物或细胞在一特定生理时期内所有低分子量代谢产物同时进行定性和定量分析的一门新学科。它是以组群指标分析为基础，以高通量检测和数据处理为手段，以信息建模与系统整合为目标的系统生物学的一个分支。代谢组学的研究介于基因、蛋白质和细胞、组织之间。杭州动物靶向代谢组学质谱鉴定
GC-MS非靶向代谢组学能检测到哪些类别的代谢物？衍生化极大地拓展了GC/MS的检测分析范围。GC/MS能检测到有机酸、氨基酸、单糖、糖醇、胺类、脂肪酸、吲哚、单甘油酯、核苷、二糖、生育酚、甾醇和胆汁酸等代谢物。如何提高定性准确度？GC/MS的定性有双重标准，一是保留指数，二是质谱信息的相似度（similarity）。不同于LC/MS的软电离源，GC/MS使用的EI源属于硬电离，能量较强且稳定，在将代谢物分子电离后，分子离子峰进一步碎裂产生丰富的碎片离子。因此，我们很难在GC/MS上看到分子离子峰。GC/MS提供的是代谢物的“指纹图谱”，将仪器得到的实际指纹图谱和质谱库（如NIST库）进行比对后，我们将会得到一个叫相似度的指标。保留指数和相似度都必须满足设定的阈值，软件才会给出色谱峰的定性结果。然后采用标准品质谱信息进行完全比对定性，也就是说只有经过标准品比对，代谢物才是被100%定性。杭州动物靶向代谢组学质谱鉴定代谢组学技术可应用于病因病机研究。
什么是非靶向代谢组学、靶向代谢组学？(1) 非靶向代谢组学（Untargeted metabolomics）即非目标代谢组学或发现代谢组学，无偏向性地对所有小分子代谢物（一般相对分子量小于1000）同时进行检测分析的代谢组学。(2) 靶向代谢组学（Trgeted metabolomics）则为目标性代谢组学，着重对于设定好的目标代谢物进行定性、量检测分析和研究。相比于其他组学，代谢组学有哪些特殊的优势？系统生物学有基因组学、转录组学、蛋白组学和代谢组学。代谢组学作为系统生物学的一个重要的分支，与其他组学相比有着其特有的优势，主要体现在以下几点：(1) 基因与蛋白质表达的微小变化会在相应代谢物水平上得到放大，更容易被检测。(2) 代谢物的种类要远小于基因和蛋白的数目。(3) 可与生物表型变化建立直接相关性。
代谢组学的研究分为靶向和非靶向。通俗说就是你有没有目标分子。传统代谢组学研究利用的是GC-MS，因为代谢物大多数都不是高沸点的，而且GC-MS有庞大的数据库检索。然后发展的LC-MS差不多，就是克服了一些高沸点物质难以检测的弊端。NMR用于代谢组学不是很多，一方面是NMR这个东西入行起点有点高，另一方面是样品太复杂而且灵敏度不高。但是NMR样品处理简单，无损。不需要各种衍生化。而且NMR对于物质结构的指认要比MS更精确（比如异构体）因此对定性非常有用，成为非靶向代谢组学的重要方法。代谢组学是系统生物学的组成部分。
代谢组学尿液样本收集：1）取空腹晨尿、中段尿（临床）或晨间1 h尿（动物）于50 mL离心管中；2）4 ℃ 下10000 rpm离心10 min取上清，用1.5 mL离心管分装，保存于-80 ℃。3）动物1 h尿量不够的情况下，可分多次收集尿液；如需收取24 h尿液，需要使用带低温装置的代谢笼收集，并且及时冻存样本。4）收集完尿液样本后，建议使用液氮淬灭15 min后，再分装多管后于-80 ℃冻存。组织样本收集：动物组织（包括脑、心、肝、脾、肺、肾、肌肉和皮肤等；软体动物如血吸虫）：1）取适量组织，用预冷的PBS缓冲液或生理盐水清洗干净；2）迅速剥去非必需的脂肪和结缔组织，再用PBS缓冲液或生理盐水冲洗干净；3）用干净的无尘吸水纸吸干水分，将组织分成50-100 mg / 管分装待用；4）管子上做好标记后迅速放入液氮中冷冻处理至少15 min，-80 ℃冻存；干冰运输。靶向代谢组学着重对于设定好的目标代谢物进行定性、量检测分析和研究。上海常规靶向代谢组学分析研究
代谢组学的研究处于生物信息流的中游。杭州动物靶向代谢组学质谱鉴定
代谢组学在系统生物学中有什么作用？它的地位如何？代谢物作为生物体表型的基础能够帮助我们更直观有效地了解生命现象揭示生命本质。代谢组学本质上是指从整体上研究生物体的代谢物，是对某一生物、组织或细胞中的所有低分子量代谢产物进行定性与定量分析的一门科学。代谢组学以指标分析为基础，高通量检测为手段，通过研究生物体内代谢物的种类与数量及其变化规律来阐述机体在正常生命状态及环境变化后的代谢过程。代谢组是系统生物学的分支学科之一。其研究内容主要包括对代谢物进行定性或定量分析，不同基因型的生物体进行代谢组学表型研究，不同生长环境及加物理、化学或生物性刺激后个体代谢产物的应答，进行代谢途径或代谢网络解析与转基因评价。杭州动物靶向代谢组学质谱鉴定
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