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贵阳新型修饰蛋白组学方法

来源: 发布时间:2022-01-08

定量蛋白质组学的方法学背景和意义:从生命活动的直接执行者——蛋白质的角度研究生命现象和规律(特别是疾病防治和病理研究)已成为研究生命科学的主要手段。而这些研究往往离不开对细胞、组织中含有蛋白质种类和表达量的研究。对处不同时期、不同条件下蛋白质表达水平变化的研究,识别功能??楹吐肪?,监控疾病的生物标志物,这些研究都需要对蛋白质进行鉴定和定量。生物质谱技术的出现和不断成熟为蛋白质差异表达分析提供了更可靠、动态范围更广的研究手段。基于质谱技术,科学家们不断开发出新的定量蛋白质组学方法,来了解细胞、组织或生物体的整体蛋白质动力学。蛋白质组的研究能为众多种疾病机理的阐明及攻克提供理论根据和解决途径。贵阳新型修饰蛋白组学方法

蛋白质组学:蛋白质组一词,源于蛋白质与基因组两个词的组合,意指“一种基因组所表达的全套蛋白质”,即包括一种细胞乃至一种生物所表达的全部蛋白质。蛋白质组学本质上指的是在大规模水平上研究蛋白质的特征,包括蛋白质的表达水平,翻译后的修饰,蛋白与蛋白相互作用等,由此获得蛋白质水平上的关于疾病发生,细胞代谢等过程的整体而全方面的认识。蛋白质组的研究不只能为生命活动规律提供物质基础,也能为众多种疾病机理的阐明及攻克提供理论根据和解决途径。通过对正常个体及病理个体间的蛋白质组比较分析,我们可以找到某些“疾病特异性的蛋白质分子”,它们可成为新药物设计的分子靶点,或者也会为疾病的早期诊断提供分子标志。确实,那些世界范围内销路*的药物本身是蛋白质或其作用靶点为某种蛋白质分子。因此,蛋白质组学研究不只是探索生命奥秘的必须工作,也能为人类健康事业带来巨大的利益。武汉Label free多肽组学技术服务蛋白质组学在生物学领域的研究中的应用是怎样的?

蛋白质组学技术:电喷雾质谱:ESI-MS是利用高电场使质谱进样端的毛细管柱流出的液滴带电,在N2气流的作用下,液滴溶剂蒸发,表面积缩小,表面电荷密度不断增加,直至产生的库仑力与液滴表面张力达到雷利极限,液滴爆裂为带电的子液滴,这一过程不断重复使液滴非常细小呈喷雾状,这时液滴表面的电场非常强大,使分析物离子化并以带单电荷或多电荷的离子形式进入质量分析器。ESI-MS从液相中产生离子,一般说来,肽段的混合物经过液相色谱分离后,经过偶联的与在线连接的离子阱质谱分析,给出肽片段的精确的氨基酸序列,但是分析时间一般较长。目前,许多实验室两种质谱方法连用,获得有意义的蛋白质的肽段序列,设计探针或引物来获得有意义的基因。随着蛋白质组研究的深入,又有多种新型质谱仪出现,主要是在上述质谱仪的基础上进行改进与重新组合。

蛋白质组学发展趋势:技术发展方面:蛋白质组学的研究方法将出现多种技术并存,各有优势和的特点,而难以象基因组研究一样形成比较一致的方法。除了发展新方法外,更强调各种方法间的整合和互补,以适应不同蛋白质的不同特征。另外,蛋白质组学与其它学科的交叉也将日益明显和重要,这种交叉是新技术新方法的活水之源,特别是,蛋白质组学与其它大规??蒲缁蜃檠?,生物信息学等领域的交叉,构成组学(omics)生物技术研究方法,所呈现出的系统生物学(SystemBiology)研究模式,将成为未来生命科学比较令人激动的新前沿。有很多蛋白质组学的研究者在工业界和医院进行相关研究和日常工作。

定量蛋白质组学技术:定量蛋白质组学技术主要分为标记(label)和非标记(labelfree)定量策略,标记策略又分为体内标记和体外标记两种。细胞内蛋白质组丰度的动态变化对各种生命过程有重要影响。例如在许多疾病的发生和发展进程中,常常伴随着某些蛋白质的表达异常。定量蛋白质组学就是把一个基因组表达的全部蛋白质或一个复杂的混合体系中所有的蛋白质进行精确的定量和鉴定。非标记(labelfree)的定量蛋白组学技术,Labelfree定量蛋白组学技术是通过液质联用技术对蛋白质酶解肽段进行质谱分析,无需使用昂贵的稳定同位素标签做内部标准,只需分析大规模鉴定蛋白质时所产生的质谱数据,比较不同样品中相应肽段的信号强度,从而对肽段对应的蛋白质进行相对定量。对人类而言,蛋白质组学的研究终究要服务于人类的健康。广东蛋白质定量组学研究内容

蛋白质组学由此获得蛋白质水平上的关于疾病发生,细胞代谢等过程的整体而全方面的认识。贵阳新型修饰蛋白组学方法

定量蛋白质组学方法学介绍:iTRAQ:iTRAQ定量是目前定量蛋白质组学应用比较普遍的技术,该技术的关键原理是多肽标记和定量,将多肽的含量转化为114、115、116和117同位素的含量(或113、114、115、116、117、118、119和121的8标记),从而简化了定量的复杂性,然后通过多肽定量值回归到蛋白的定量值,从而测定出不同样本之间蛋白质的差异。iTRAQ定量不依赖样本,可检测出较低丰度蛋白,胞浆蛋白、膜蛋白、胞外蛋白等,且定量准确,可同时对8个样本进行分析,并可同时得出鉴定和定量的结果,特别适用于采用多种处理方式或来自多个处理时间的样本的差异蛋白分析。贵阳新型修饰蛋白组学方法

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