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湖北蛋白质丙二酰化修饰组学分析

来源: 发布时间:2021-12-24

蛋白质磷酸化修饰组学:磷酸化蛋白质是由蛋白激酶将ATP或GTP分子上的磷酸基团转移到底物蛋白特定的氨基酸侧链上形成的。蛋白质磷酸化是一种可逆的蛋白质翻译后修饰。在哺乳动物的细胞生命周期中,至少有三分之一的蛋白质发生磷酸化修饰。磷酸化修饰参与许多信号转导途径和细胞代谢过程,且许多已知的疾病也与蛋白质的异常磷酸化有关。因此,对磷酸化蛋白质组进行定量研究,寻找差异表达的磷酸化蛋白质,有助于发现疾病的生物标志物和寻找新的具有诊疗潜力的药物靶标。乙酰化修饰对细胞核内转录调控因子的刺激有着非常重要的作用。湖北蛋白质丙二酰化修饰组学分析

蛋白质-蛋白质相互作用是蛋白质发挥功能的主要机制之一,在DNA损伤修复,自噬和代谢等过程中都扮演着非常重要的角色,蛋白相互作用异常便会导致疾病的发生.在蛋白质的赖氨酸,丝氨酸和苏氨酸等氨基酸残基上,可发生甲基化,乙酰化,磷酸化和泛素化等200多种翻译后修饰,这些修饰通常能改变蛋白质的电性,疏水性和空间结构等属性,为与之结合的蛋白提供结合的锚定或产生位阻效应,像一把开关在时空上精确调控蛋白质-蛋白质相互作用的发生以及动态变化.结构研究表明,蛋白质之间的相互作用通常由临近的几个氨基酸残基直接结合,替换该区域的氨基酸残基,通常能破坏结合,使其失去部分功能或酶活性,可以针对性地开发和设计抑制剂,用于疾病的诊疗。泛素化修饰蛋白质组学领域蛋白质翻译后修饰组学磷酸化修饰具有简单的特性。

蛋白质乙酰化修饰定义:蛋白质在细胞中经过翻译后,到被运输到相应的细胞器并且发生特定的生物学作用前会经过很重要的一步加工,那就是蛋白质翻译后修饰加工。蛋白质翻译后修饰的作用主要是改变蛋白质的活性、定位或功能。通过蛋白质翻译后修饰也进一步增加了细胞通路机制和生命活动的多样性和复杂性。常见的蛋白质翻译后修饰包括磷酸化,乙酰化,糖基化,泛素化等。蛋白质乙酰化修饰,顾名思义指的就是在蛋白质原有基础上面嫁接上乙酰化基团。在细胞中,乙酰化修饰的反应由乙酰基转移酶所催化,将乙酰辅酶A的乙酰基转移并添加在蛋白质赖氨酸残基上。在早期的研究中,乙酰化修饰一直被认为是真核细胞所特有的一种翻译后修饰,直到后来研究发现原核细胞中年也存在着蛋白质乙酰化修饰。所以,乙酰化修饰是原核和真核生物所共有的一种翻译后修饰类型。

蛋白翻译后修饰:蛋白质氨基酸序列的特定位置可以与化学基团或者小分子量的蛋白共价结合从而发生蛋白质翻译后修饰(post-translational modifications,PTMs)。翻译后修饰是蛋白质生物合成的一个步骤,翻译后多肽链在成为成熟的蛋白质产品之前要经过修饰,PTMs的类型包括磷酸化、乙酰化、糖基化、泛素化和二硫键等等,它导致蛋白质组复杂性的大幅增加。对于任何给定的蛋白质,各种各样的PTMs提供了一种通过改变蛋白质的结构和功能来促进细胞快速变化的方法。PTMs在信号转导、蛋白质稳定性和周转率、蛋白质与蛋白质识别和相互作用以及空间定位中起着至关重要的作用。各种蛋白质翻译后修饰在信号通路和网络中发挥着重要的作用。

质谱分析蛋白翻译后修饰:相对于蛋白质印迹等技术,质谱技术能更有效的对蛋白质的翻译后修饰进行分析,且可以对常规的Western blot 翻译后修饰蛋白鉴定进行补充。质谱分析蛋白翻译后修饰一般使用自下而上的基于肽段的方法。但是自下而上的质谱方法无法保证可以完全识别目的蛋白的特定翻译后修饰,因为质谱是通过蛋白质序列内的多个肽段来鉴定的,这很大程度上降低了翻译后修饰肽段被识别的机会。一种提高质谱仪检测到修饰肽段数量的策略是使用PTM亲和试剂进行肽段富集,而不是使用PTM亲和试剂进行蛋白富集,这将减少富集的未修饰肽段的数量。蛋白质修饰可检测修饰类型有磷酸化、糖基化、乙酰化、泛素化、丙酰化、丁酰化、丙二酰化。江苏甲基化修饰蛋白质组学有哪些

质谱是蛋白质翻译后修饰检测的常用技术之一。湖北蛋白质丙二酰化修饰组学分析

蛋白质翻译后修饰组学:翻译后修饰自下而上分析策略:自下而上蛋白质组学是一种基于肽段分析的技术。对于不同类型的翻译后修饰,具体的分析策略存在差异。蛋白质的糖基化具有异质性。不同的糖链可以连接到同一位点上,不同位点可以连接到同一蛋白质上的不同糖链上。糖基化的异质性严重阻碍了糖蛋白的分离和分析。不同糖类型的相同蛋白质,在电泳上会出现分散的条带,导致信号分散。此外,对低丰度蛋白质的识别性差导致糖蛋白在色谱图中分离不佳,质谱中有一簇分子量不准确的分辨不清的峰。目前,蛋白糖基化研究的主要策略是利用现有的技术体系对糖基化蛋白的糖基化肽段进行分离和富集,消除糖基化的异质性及其对质谱的影响,标记糖基化位点。湖北蛋白质丙二酰化修饰组学分析

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