蛋白质组结果一般需要做哪些方面的生物信息学分析？目前一般文献中的分析主要为维恩图分析、热图分析、火山图分析、层次聚类分析、蛋白质功能分析（GO分类为主）、蛋白质所属代谢通路富集分析（基于KEGG的pathway）、差异蛋白互作网络构建、转录因子预测等方面。其它一些比较特异的高级分析包括多组数据关联分析、多pathway延伸分析、磷酸蛋白激酶预测分析、互作网络及生物调控模型构建分析。定量蛋白质组学技术主要分为标记（label）和非标记（labelfree）定量策略，标记策略又分为体内标记和体外标记两种。细胞内蛋白质组丰度的动态变化对各种生命过程有重要影响。例如在许多疾病的发生和发展进程中，常常伴随着某些蛋白质的表达异常。定量蛋白质组学就是把一个基因组表达的全部蛋白质或一个复杂的混合体系中所有的蛋白质进行精确的定量和鉴定。对人类而言，蛋白质组学的研究要服务于人类的健康，主要指促进分子医学的发展。如寻找药物的靶分子。武汉定量蛋白组学价格

蛋白质组学研究策略：蛋白质组学研究主要分为自底向上（Bottom-Up），自顶向下（Top-Down）和自中向下（Middle-Down）三种策略。“自底向上”策略是指通过分析由蛋白质酶解生成的肽段来鉴定蛋白质。当应用该策略来分析蛋白质组混合物时，因其类似于基因组测序的鸟管法，所以又被称为鸟管法蛋白质组学（Shotgun Proteomics），该策略依赖于蛋白酶的酶切。“自中向下”策略也依赖于蛋白酶的酶切，但是由于采用了另外的酶，比如OmpT，只能酶切(Lys/Arg-Lys/Arg)，因此酶切之后的分子量较大，更利于后续的蛋白组装环节。武汉定量蛋白组学价格我们通过研究蛋白质组，可以为患者提供有用的疾病诊断、预后评估信息。

蛋白质组学研究内容：1.蛋白质鉴定：可以利用一维电泳和二维电泳并结合相关技术，利用蛋白质芯片和抗体芯片及免疫共沉淀等技术对蛋白质进行鉴定研究。2.翻译后修饰：很多mRNA表达产生的蛋白质要经历翻译后修饰如磷酸化，糖基化，酶原刺激等。翻译后修饰是蛋白质调节功能的重要方式，因此对蛋白质翻译后修饰的研究对阐明蛋白质的功能具有重要作用。3.蛋白质功能确定：如分析酶活性和确定酶底物，细胞因子的生物分析/配基-受体结合分析。可以利用基因敲除和反义技术分析基因表达产物-蛋白质的功能。另外对蛋白质表达出来后在细胞内的定位研究也在一定程度上有助于蛋白质功能的了解。有的荧光蛋白表达系统就是研究蛋白质在细胞内定位的一个很好的工具。

蛋白质组学与基因组学的差异：蛋白质组和基因组（genome）在概念上有相关性，某一个蛋白质组的蛋白质是由其基因组所编码的，然而蛋白质组学和基因组学在研究对象和研究方法上有很大的区别。基因组在所有的细胞中几乎都是完整的，与之不同，蛋白质组具有很高的细胞和组织特异性，不同的细胞组织表达不同的蛋白质组。蛋白质组的复杂性也远远高于基因组，这是因为一个基因≠一个转录产物≠一个蛋白质。比如据估计人的基因组由30000个基因组成，经mRNA剪切和蛋白质翻译后修饰将产生20万~200万个蛋白质。由于不同的转录起始和mRNA剪切使同一基因产生了不同的转录产物。同样由于不同的翻译起始，一个mRNA可以翻译成不同的蛋白质。蛋白质组学包括蛋白与蛋白相互作用等。

蛋白质组学植物篇样品寄样要求：植物相较于动物，蛋白占比不高，所以送样在量上面的要求会多一些，推荐送500mg以上的量可以确保实验能够提取到充足的蛋白。如果是种仁、豆类等蛋白含量比较高的，200mg足以完成抽提。处理样本需要用PBS将样本表面的泥土等杂质冲洗干净，去除掉多余的组织。尽量能够保证样本的形态和纯度，不推荐用锡纸包裹，放在EP管中使其形态完整为比较好。用液氮急速冷冻5min后置于-80℃环境中保存，送样时需要添加干冰。蛋白质组研究技术在研究对象上，覆盖了原核微生物、真核微生物、植物和动物等范围。山东高通量蛋白质组学分析研究

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蛋白质组学基础研究方面：近两年来蛋白质组研究技术已被应用到各种生命科学领域，如细胞生物学、神经生物学等。在研究对象上，覆盖了原核微生物、真核微生物、植物和动物等范围，涉及到各种重要的生物学现象，如信号转导、细胞分化、蛋白质折叠等等。在未来的发展中，蛋白质组学的研究领域将更加普遍。应用研究方面：蛋白质组学将成为寻找疾病分子标记和药物靶标比较有效的方法之一。在对早老性痴呆等人类重大疾病的临床诊断和治理方面蛋白质组技术也有十分诱人的前景，目前国际上许多大型药物公司正投入大量的人力和物力进行蛋白质组学方面的应用性研究。武汉定量蛋白组学价格