宏转录组分析：从以G为单位的高通量测序数据中获取研究所需的微生物种类、基因、通路等信息是进行宏转录组研究必须经历的一步。现在网络上分析组学数据的工具五花八门。能否从众多组学工具中选择出适合分析宏转录组数据的软件，能否搭建一套完整、快速、高效、灵敏、高精确的宏转录组分析pipline，直接关乎到后期数据分析的进行。这种技术不只具有宏基因组技术的全部优点，可以检测环境中的活性微生物、活性转录本以及活性功能进行研究，还可以比较不同环境下的差异表达基因和差异功能途径，揭示微生物在不同环境压力下的适应机制，探索环境与微生物之间的互作机理。转录组学能准确地识别可变剪切位点及cSNP，UTR区域。杭州单细胞转录组学技术分析

转录组学介绍：转录组学是研究特定的细胞、组织或个体在特定时间和状态下所转录出所有 RNA 的学科，转录组测序是指利用高通量测序方法，研究特定的细胞、组织或个体在特定时间和状态下所转录出的所有 mRNA，用于揭示不同功能状态下的基因表达、结构的差异，阐明分子机制。应用领域：医学研究：疾病标志物筛查、疾病的诊断和分型、疾病复发诊断、病因与病理机制探究、临床疗效评价、药物毒理学评价。生命科学研究：非生物环境关系研究、植物与微生物、在表型鉴定中的应用、代谢途径及功能基因组研究、药用植物研究中的应用。杭州单细胞转录组学技术分析转录组学为什么原核物种只能做有参转录组分析？

RNA-seq转录组学技术优势有：1、可以直接测定每个转录本片段序列、单核苷酸分辨率的准确度;2、灵敏度高，可以检测细胞中少至几个拷贝的稀有转录本;3、可以对任意物种进行全基因组分析，能够检测未知基因，发现新的转录本，并准确地识别可变剪切位点及cSNP，UTR区域;4、检测范围广，能够同时鉴定和定量稀有转录本和正常转录本。RNA-seq转录组学是需要生物学重复的，至少需要两次生物学重复，3次以上的生物学重复更好。以3个重复为例，加上对照的三个生物学重复，一次RNA-seq需要6个样本。

转录组学(Transcriptomics)，是一门在真整体水平上研究细胞中基因转录的情况及转录调控规律的学科，从RNA水平研究基因的表达情况。转录组测序是通过二代测序平台快速全方面地获得某一物种特定细胞或组织在某一状态下的几乎所有的转录本及基因序列，可以用来研究基因表达量、基因功能、结构、可变剪接和预测新的转录本等等。转录组（transcriptome），是指特定生长阶段某组织或细胞内所有转录产物的汇合，狭义上指所有mRNA的汇合。转录组学即特定细胞在某一功能状态下转录出来的所有RNA的总和，包括mRNA和非编码RNA。转录组学狭义上指所有mRNA的组合。

全转录组测序为什么需要构建两个文库？全转录组测序需要构建2个测序文库，一个小RNA文库和一个去除核糖体RNA的链特异性文库，然后分别上机测序。小RNA长度较短，一般小于50nt，采用测序策略为50SE。其他三类RNA序列一般大于200，通常在1000以上，可达几万，通过片段化构建150PE测序文库。然后小RNA文库可以获得miRNA序列信息，去核糖体的链特异性文库可以获得mRNA、lncRNA和circRNA的序列信息。转录组学即特定细胞在某一功能状态下转录出来的所有RNA的总和，包括mRNA和非编码RNA。转录组学可以直接测定每个转录本片段序列。杭州外泌体转录组学鉴定

转录组学测序结果的影响因素？杭州单细胞转录组学技术分析

转录组学测序有什么样的样品要求？（1）样品纯度要求：OD值应在1.8至2.2之间；电泳检测28S:18S至少大于1.8。（2）样品浓度：totalRNA浓度不低于400ng/μg。（3）totalRNA样品请置于-20℃保存；请提供totalRNA样品具体浓度、体积、制备时间、溶剂名称及物种来源。请同时附上QC数据，包括电泳胶图、分光光度或Nanodrop仪器检测数据。（4）样品请置于1.5ml管中，管上注明样品名称、浓度以及制备时间，管口使用Parafilm封口。建议使用干冰运输，并且尽量选用较快的邮递方式，以降低运输过程中样品降解的可能性。杭州单细胞转录组学技术分析