蛋白质组学概念：蛋白质组学（英语：proteomics，又译作蛋白质体学），是以蛋白质组为研究对象，研究细胞、组织或生物体蛋白质组成及其变化规律的科学。蛋白质组（Proteome）一词，源于蛋白质（protein）与基因组（genome）两个词的组合，意指“一种基因组所表达的全套蛋白质”，即包括一种细胞乃至一种生物所表达的全部蛋白质。蛋白质组学本质上指的是在大规模水平上研究蛋白质的特征，包括蛋白质的表达水平，翻译后的修饰，蛋白与蛋白相互作用等，由此获得蛋白质水平上的关于疾病发生，细胞代谢等过程的整体而全方面的认识。蛋白质组学，指对某一基因组所表达的所有蛋白质及其特征进行大规模、系统化地研究。哈尔滨PRM靶向定量蛋白质组学研究方法

蛋白组究竟研究原因：首先，由于翻译调控和翻译后调控的存在，RNA的表达量与实际对应蛋白质的含量相关性并不高，就简单地测试了酵母中mRNA和对应蛋白质的定量相关性，结果是，低丰度蛋白与mRNA的相关性尤其低，而高丰度蛋白和其mRNA的相关性则高，经过平均后r值只为0.4。蛋白质组学相关技术目前在一小部分]应用中具有独特优势。蛋白组究竟研究的是什么呢？第1，蛋白质定性，或者说大规模检测某些蛋白质是否存在于样品当中；第2，蛋白质定量，也就是大规模检测某些蛋白质的含量（包括一定含量与相对含量）；第3，蛋白质翻译后修饰，这些修饰主要包括磷酸化，泛素化，糖基化，乙酰化等等，也包括对这些翻译后修饰的定量研究。武汉定量蛋白组学质谱鉴定蛋白质组学可以通过系统性地研究蛋白质表达和翻译后修饰变化对疾病的影响。

iTRAQ/TMT标记定量蛋白质组技术优势：1、结果可靠：基于高灵敏度和高分辨的串联质谱方法，定性与定量同步进行，同时得出定性和定量结果，重复样品间的蛋白表达量相关性高；2、灵敏度高：分级分离，降低样品复杂度，相比凝胶电泳观测到的蛋白变化在2倍以上，iTRAQ计算出的蛋白变化在1.3-1.6倍之间，可检测低丰度蛋白；3、分离能力强：可分离出酸/碱性蛋白，小于10KDa或大于200KDa的蛋白、难溶性蛋白等；4、自动化程度高：液质联用，自动化操作，分析速度快，分离效果好。

非标定量法(Label-free)是通过比较质谱分析次数或质谱峰强度，分析不同来源样品蛋白的数量变化，认为肽段在质谱中被捕获检测的频率与其在混合物中的丰度成正相关，因此蛋白质被质谱检测的计数反映了蛋白质的丰度，通过适当的数学公式可以将质谱检测计数与蛋白质的量联系起来,从而对蛋白质进行定量。按照其原理主要分为两种，第1种spectrumcounts类的非标记方法，发展比较早，已经形成多种定量算法，但是主要的原理都是以MS2的鉴定结果为定量基础，各种方法的差别在于后期算法在大规模数据上的修正。第二种非标记定量的原理是以MS1为基础，计算每个肽段的信号强度在LC-MS上的积分。有很多蛋白质组学研究者在工业界和医院进行相关研究和日常工作。

蛋白质组学的应用：蛋白质组学现已被普遍应用于生命科学研究领域，对理解细胞生长、分化、代谢、衰老与病变有着重要作用。尤其在疾病的研究中，蛋白质组学可以通过系统性地研究蛋白质表达和翻译后修饰变化对疾病的影响，从而在分子层面对疾病进行分型，以起到对个性化疗理研究的积极推进作用。蛋白质组学在医学方面的应用是当今迅猛发展的研究领域之一，随着蛋白质组学技术的不断进步和普遍应用，基于蛋白质组学技术的医疗有望在不久的将来应用于大规模的临床实践中。蛋白质组（Proteome）一词，源于蛋白质（protein）与基因组（genome）两个词的组合。武汉定量蛋白组学质谱鉴定

蛋白质组学技术的本质（从分析化学角度来看），就是对蛋白质的定性定量分析。哈尔滨PRM靶向定量蛋白质组学研究方法

蛋白质组学技术：蛋白质组学技术的发展已经成为现代的生物技术快速发展的重要支撑，并将带领生物技术取得关键性的突破。为帮助生命科学领域的工作者全方面掌握蛋白质组学的技术与方法、实验难点与关键点、研究前沿与热点，包括双向凝胶电泳、等电聚焦、生物质谱分析及非凝胶技术。双向凝胶电泳：双向凝胶电泳的原理是第1向基于蛋白质的等电点不同用等电聚焦分离，第二向则按分子量的不同用SDS-PAGE分离，把复杂蛋白混合物中的蛋白质在二维平面上分开。由于双向电泳技术在蛋白质组与医学研究中所处的重要位置，它可用于蛋白质转录及转录后修饰研究，蛋白质组的比较和蛋白质间的相互作用，细胞分化凋亡研究，致病机制及耐药机制的研究，疗效监测，新药开发，病症研究，蛋白纯度检查，小量蛋白纯化，新替代疫苗的研制等许多方面。近年来经过多方面改进已成为研究蛋白质组的比较有使用价值的关键方法。哈尔滨PRM靶向定量蛋白质组学研究方法