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上海糖基化修饰蛋白质组学质谱鉴定

来源: 发布时间:2022-04-19

泛素化修饰蛋白质组学:泛素是一种由76个氨基酸组成的多肽,在真核生物中高度保守,可通过异肽键与目标蛋白赖氨酸残基的氨基进行共价连接。泛素化蛋白的富集主要基于标记,泛素用亲和标签(通常为6xHis)进行标记,并通过镍螯合色谱亲和提取泛素化蛋白。由于泛素的C端为Arg-Gly-Gly结构,经胰蛋白酶水解后,Gly-Gly保留在修饰蛋白的肽链上,使肽的质量增加114,因此可作为泛素定位位点的质量标记。用HPLC对样品进行预分离,使用针对特定残留结构的抗体富集泛素化肽,可很大程度上提高泛素化蛋白的浓度。串联质谱可以鉴定泛素化位点。在早期的研究中,乙?;奘我恢北蝗衔钦婧讼赴赜械囊恢址牒笮奘?。上海糖基化修饰蛋白质组学质谱鉴定

泛素化修饰蛋白质组学的作用:泛素化、心血管等疾病的发病密切相关。因此,作为近年来生物化学研究的一个重大成果,它已然成为研究、开发新药物的新靶点。技术原理是首先将蛋白样本酶解成肽段混合物,然后使用液相色谱对酶解后的肽段混合物进行组分分离以降低样本复杂程度,然后通过高质量的泛素化修饰抗体和生物材料对修饰肽段进行富集,之后上样至液相色谱-串联质谱中进行分析定量。技术优势:高特异性的修饰抗体;高分辨率、高灵敏度质谱仪;鉴定通量高;可与代谢组学等进行多组学联合分析。南京蛋白质琥珀?;奘巫檠е势追治龅鞍字实牧姿峄奘问巧锾迥谥匾墓布坌奘畏绞街?。

蛋白质翻译后修饰在蛋白质中磷酸化位点分析时应该注意些什么问题?覆盖率:覆盖率越高,检测和鉴定含有修饰基团的肽几率就越大。修饰位点的占有率:被修饰的蛋白质的百分比低,则检测到修饰肽的机会会随之减少。如果百分比较高(> 30%),则有助于识别修饰位点。棕榈?;鞍仔奘沃势准ǚ椒ǎ篠-棕榈?;闹饕δ苁谴俳鞍字视胂赴さ慕岷?。蛋白质可以由一个棕榈酰基组成,也可以与更多棕榈基或与其他脂质,如豆蔻酰基。由于对S-棕榈?;鞍追治鋈匀痪哂刑粽叫裕捎赟-棕榈?;奘蔚鞍籽撬揭约笆杷院颓痹诓晃榷ǖ牧虼柿吹腟-脂酰化肽。

乙?;奘蔚鞍鬃檠вτ梅较蛴惺裁矗?、基础医学、临床诊断:生物标志物,疾病机理机制,疾病分型,个性化治理等;2、生物医药:药物作用机理,药效评价,药物开发等;3、微生物领域:致病机理,耐药机制,病原体-宿主相互作用研究等;4、海洋水产:渔业资源,海水养殖,渔业环境与水产品安全等;5、生物能源、环境科学领域:发酵过程优化,生物燃料生产,环境危定风险评估研究等;6、食品营养:食品储藏及加工条件优化,食品组分及品质鉴定,功能性食品开发,食品安全监检测等。糖基化蛋白质翻译修饰组学主要在复杂的多细胞或组织形成过程中起关键作用。

蛋白质乙?;奘巫檠В阂阴;奘问侵冈诿富蚍敲缸饔孟?,将乙酰CoA的乙酰基基团转移至蛋白质氨基酸的残基上。蛋白质乙酰化也是一种可逆的酶促反应过程。乙?;泼缚梢越阴;?CH3C=O)从乙酰辅酶A转移至蛋白质。同理,去乙?;冈蚩梢阅孀庵址从?。蛋白质上的赖氨酸乙酰化是细胞内一种重要的PTMs过程。不仅发生在细胞核内组蛋白、转录因子等上,在细胞质和线粒体中也存在着诸多蛋白的乙酰化修饰。在植物研究领域内,乙?;奘沃饕斡胫参锕夂献饔?、生长发育、胁迫响应等过程。在医学领域,乙酰化修饰可调节人体内某种代谢酶,控制糖尿病,这一发现为糖尿病干预与疗理带来新的希望。泛素化修饰蛋白质组学有些什么?南京蛋白质琥珀酰化修饰组学质谱分析

蛋白质翻译后修饰几乎参与了细胞所有正常生命活动的过程。上海糖基化修饰蛋白质组学质谱鉴定

泛素化修饰蛋白组学研究:泛素化修饰蛋白组学是一种重要的翻译后修饰。泛素-蛋白酶体系统介导了真核生物体内80%~85%的蛋白质降解。此外,泛素化修饰还可以直接影响蛋白质的活性和定位,调控包括细胞周期、细胞凋亡、转录调控、DNA 损伤修复以及免疫应答等在内的多种细胞活动。由于翻译后修饰的蛋白质在生物样本中含量低、动态范围广,质谱分析前需要对修饰进行富集以提高其丰度,然后利用传统的定量蛋白组分析手段对富集得到的泛素化肽段样品进行定量分析。上海糖基化修饰蛋白质组学质谱鉴定

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